seq1 = pF1KE0182.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KE0182/gi568815581f_32831529.tfa (gi568815581f:32831529_33040990), 209462 bp

>pF1KE0182 678
>gi568815581f:32831529_33040990 (Chr17)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-263  (101646-101777)   100% ->
264-297  (102763-102796)   100% ->
298-413  (104804-104919)   99% ->
414-473  (107949-108008)   100% ->
474-678  (109258-109462)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACTGTGGTGATTGTTGCCATAGGTGTGCTGGCCACCATCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACTGTGGTGATTGTTGCCATAGGTGTGCTGGCCACCATCTTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTTCGTTTGCAGCCTTGGTGCTGGTTTGCAGGCAGCGCTACTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTTCGTTTGCAGCCTTGGTGCTGGTTTGCAGGCAGCGCTACTGCCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGAGACCTGCTGCAGCGCTATGATTCTAA         GCCCATTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 CGCGAGACCTGCTGCAGCGCTATGATTCTAAGTG...CAGGCCCATTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCTCATTGGTGCCATGGAGACCCAGTCTGAGCCCTCTGAGTTAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101656 GACCTCATTGGTGCCATGGAGACCCAGTCTGAGCCCTCTGAGTTAGAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACGATGTCGTTATCACCAACCCCCACATTGAGGCCATTCTGGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 GGACGATGTCGTTATCACCAACCCCCACATTGAGGCCATTCTGGAGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGACTGGATCGAAGATGCCTC         GGGTCTCATGTCCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101756 AAGACTGGATCGAAGATGCCTCGTA...CAGGGGTCTCATGTCCCACTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTGCCATCTTGAAG         ATTTGTCACACTCCGACAGAGAAGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| ||||||||||||
 102782 ATTGCCATCTTGAAGGTA...TAGATTTGTCACACTCTGACAGAGAAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGTTGCCATGACAATGGGCTCTGGGGCCAAGATGAAGACTTCAGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104830 TGTTGCCATGACAATGGGCTCTGGGGCCAAGATGAAGACTTCAGCCAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAGCGACATCATTGTGGTGGCCAAGCGGATCAGCCCCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104880 TCAGCGACATCATTGTGGTGGCCAAGCGGATCAGCCCCAGGTG...CAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGGATGATGTTGTGAAGTCGATGTACCCTCCGTTGGACCCCAAACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107950 GTGGATGATGTTGTGAAGTCGATGTACCCTCCGTTGGACCCCAAACTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGACGCACG         GACGACTGCCCTGCTCCTGTCTGTCAGTCACC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108000 GGACGCACGGTG...TAGGACGACTGCCCTGCTCCTGTCTGTCAGTCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGTGCTGGTGACAAGGAATGCCTGCCATCTGACGGGAGGCCTGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109290 TGGTGCTGGTGACAAGGAATGCCTGCCATCTGACGGGAGGCCTGGACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATTGACCAGTCTCTGTCGGCTGCTGAGGAGCGTTTGGAAGTCCTTCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 109340 ATTGACCAGTCTCTGTCGGCTGCTGAGGAGCATTTGGAAGTCCTTCGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGCAGCCCTAGCTTCTGAGCCAGATAAAGGCCTCCCAGGCCCTGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109390 AGCAGCCCTAGCTTCTGAGCCAGATAAAGGCCTCCCAGGCCCTGAAGGCT

    700     .    :    .    :
    656 TCCTGCAGGAGCAGTCTGCAATT
        |||||||||||||||||||||||
 109440 TCCTGCAGGAGCAGTCTGCAATT