seq1 = pF1KE0180.tfa, 654 bp
seq2 = pF1KE0180/gi568815596r_85499079.tfa (gi568815596r:85499079_85701108), 202030 bp

>pF1KE0180 654
>gi568815596r:85499079_85701108 (Chr2)

(complement)

1-22  (99653-99674)   100% ->
23-109  (100002-100088)   100% ->
110-237  (101091-101218)   100% ->
238-415  (101407-101584)   99% ->
416-654  (101792-102030)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTATGCCCTGTGGAGAACTG         GTCCTACAACGAGTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  99653 ATGTATGCCCTGTGGAGAACTGGTA...CAGGTCCTACAACGAGTCCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTCCTGACCCTGCTGAGCAAGGGGGTCCCAAGACCTGCTGCACCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 CCTCCTGACCCTGCTGAGCAAGGGGGTCCCAAGACCTGCTGCACCCTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGATGTCCCCCTCATCAG         TGGCCCTGATCTGCCTCCTGCGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100071 CGATGTCCCCCTCATCAGGTA...CAGTGGCCCTGATCTGCCTCCTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TACGGGCAGCTCCTGGAGCAGAGTCGGCACTCTTGGGTTAACACCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101114 TACGGGCAGCTCCTGGAGCAGAGTCGGCACTCTTGGGTTAACACCACGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACTCATCACAGGCTGCACCAACGCTGCGGGCCTCTTGGTGGTTGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101164 ACTCATCACAGGCTGCACCAACGCTGCGGGCCTCTTGGTGGTTGGCAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCAG         GTGGATCATGCCAGGTCTCTGCACTACGTTGGAGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101214 TTCAGGTG...CAGGTGGATCATGCCAGGTCTCTGCACTACGTTGGAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGCGTGGCCTTCCCTGCGGGGCTGCTCTTTGTTTGCCTGCACTGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101443 GGCGTGGCCTTCCCTGCGGGGCTGCTCTTTGTTTGCCTGCACTGTGCTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTCCTACCAAGGGGCCACTGCCCCGCTGGACCTGGCTGTGGCCTATCTGC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 101493 CTCCTACCAAGGGGCCACCGCCCCGCTGGACCTGGCTGTGGCCTATCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAAGTGTGCTGGCTGTCATCGCCTTTATCACCCTGGTCCTCA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101543 GAAGTGTGCTGGCTGTCATCGCCTTTATCACCCTGGTCCTCAGTA...TA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    416  GTGGAGTCTTCTTTGTCCATGAGAGTTCTCGGCTGCAACATGGGGCAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 101791 GGTGGAGTCTTCTTTGTCCATGAGAGTTCTCAGCTGCAACATGGGGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTGTGTGAGTGGGTGTGTGTCATCGATATCCTCATTTTCTATGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101841 CCTGTGTGAGTGGGTGTGTGTCATCGATATCCTCATTTTCTATGGCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAGCTACGAGTTTGGGGCAGTCTCCTCAGACACACTGGTGGCTGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101891 TCAGCTACGAGTTTGGGGCAGTCTCCTCAGACACACTGGTGGCTGCACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGCCTACCCCTGGCCGGGCCTGCAAGTCCTCCGGGAGCAGCAGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101941 CAGCCTACCCCTGGCCGGGCCTGCAAGTCCTCCGGGAGCAGCAGCACCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACCCACCTCAACTGTGCCCCCGAGAGCATCGCTATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101991 CACCCACCTCAACTGTGCCCCCGAGAGCATCGCTATGATC