seq1 = pF1KE0179.tfa, 1026 bp
seq2 = pF1KE0179/gi568815589f_114517196.tfa (gi568815589f:114517196_114743310), 226115 bp

>pF1KE0179 1026
>gi568815589f:114517196_114743310 (Chr9)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-216  (107155-107264)   100% ->
217-324  (109704-109811)   100% ->
325-474  (110906-111055)   100% ->
475-585  (116573-116683)   100% ->
586-666  (119795-119875)   100% ->
667-849  (121349-121531)   100% ->
850-1026  (125939-126115)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGTGAACCACAGGTGGACCCGGGGGCCACTGGCCCATTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGTGAACCACAGGTGGACCCGGGGGCCACTGGCCCATTGCCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTCCCCTGGCTGGAGTGCCCTGCCTGGAGGGAGCCCTCCTGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTCCCCTGGCTGGAGTGCCCTGCCTGGAGGGAGCCCTCCTGGCTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCAAG         AGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCAAGGTA...CAGAGCTCCACAATGGCCAGGTCCTCACTGTTCTCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCGACCTGGGAGCCGCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107190 ATTGACAATACCTGTGCACCCATCTCCTTCGACCTGGGAGCCGCAGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAG         GTCCCGGCTGACCAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107240 GCAACTGCAAACTTGGGGCATCCAGGTG...CAGGTCCCGGCTGACCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAGGAGCTTGGCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109720 ACAGGAGCTTGGCTGAGAGTGCCCTCTTGGAGCCCCAAGTGAGAAGATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTTTGCTGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 109770 ATCATCTACAACTCGAGGCCTATGCGGCTGGCCTTTGCTGTGGTA...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    325  GTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110905 GGTTTTCTATGTGGTGGTGTGGGCCAATATCTACTCTACCAGTCAGATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGCCTTGGGGAACCACTGGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110955 TTGCCTTGGGGAACCACTGGGCTGGCATGCTGCTCGTGACCCTGGCCGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACACCAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111005 GTGAGCCTGACCTTGACTCTTGTGCTGGTCTTTGAAAGACACCAGAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 G         GCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111055 GGTG...CAGGCCAACACCAACACGGACCTGAGGCTGGCAGCTGCCAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCTGCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116613 GAGCCCTCCTGAGACACCGGGTGCTGCTGGGGGTGACAGACACAGTGGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGATGCCAGAGTGTGATTCAG         CTTTGGTTTGTCTACTTCGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 116663 GGATGCCAGAGTGTGATTCAGGTG...CAGCTTTGGTTTGTCTACTTCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCTGGAGAACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119815 CCTGGAGAACTGTGTGCAGTTTTTGTCTGATCATGTTCAAGAAATGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTAGCCAAGAG         TCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGCCAGTTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 119865 CTAGCCAAGAGGTA...CAGTCCTTGCTGAGAAGCAGATTGAGCCAGTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121379 TGTGTTGTCATGGAGACTGGGGTGAGCCCTGCAACAGCGGAGGGGCCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAACTTGGAGGATGCTCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121429 GAACTTGGAGGATGCTCCTCTCCTGCCCGGCAATTCTTGTCCTAACGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTGAGGCTGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121479 GGCCACTCATGCAGACTGAGCTTCATCAGCTTGTTCCTGAGGCTGAGCCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAG         GAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121529 GAGGTA...TAGGAAATGGCCCGCCAGCTGCTGGCAGTGTTTGGCGGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTACATCCGGCTTCTAGTGACCTCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125977 CTACATCCGGCTTCTAGTGACCTCCCAGCTCCCTCAGGCAATGGGGACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126027 GACACACGAACTCTCCGAGAATTCCATGCCCCTGCCAGCTCATAGAAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .
    988 TACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126077 TACATCCTAGGCACAGGGTGCTGCCCGTTCCTGGCGAGG