seq1 = pF1KE0178.tfa, 1041 bp
seq2 = pF1KE0178/gi568815592f_36799445.tfa (gi568815592f:36799445_37023438), 223994 bp

>pF1KE0178 1041
>gi568815592f:36799445_37023438 (Chr6)

1-189  (100001-100189)   99% ->
190-403  (102777-102990)   100% ->
404-555  (114840-114991)   100% ->
556-695  (115110-115249)   100% ->
696-825  (117001-117130)   99% ->
826-949  (120134-120257)   100% ->
950-1041  (123903-123994)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCTTGCTGTCAACGAGATCAGCATTTATGACAAACTTTCAGAGAC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCTTGCTGCCAACGAGATCAGCATTTATGACAAACTTTCAGAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTGATTTGGTGAGACAGACCGGCCATCAGTGTGGCATGTCAGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTGATTTGGTGAGACAGACCGGCCATCAGTGTGGCATGTCAGAGAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAATTGAAAAATTTATCAGACAGCTGCTGGAAAAGAATGAACCTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAATTGAAAAATTTATCAGACAGCTGCTGGAAAAGAATGAACCTCAGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCCCCGCAGTATCCTCTCCTTATAGTTGTGTATAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100151 CCCCCCCCGCAGTATCCTCTCCTTATAGTTGTGTATAAGGTA...TAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTCGCAACCTTGGGATTAATCTTGCTCACTGCCTACTTTGTGATTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102779 TCTCGCAACCTTGGGATTAATCTTGCTCACTGCCTACTTTGTGATTCAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTTCAGCCCATTAGCACCTGAGCCAGTGCTTTCTGGAGCTCACACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102829 CTTTCAGCCCATTAGCACCTGAGCCAGTGCTTTCTGGAGCTCACACCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGCTCACTCATCCATCACATTAGGCTGATGTCCTTGCCCATTGCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102879 CGCTCACTCATCCATCACATTAGGCTGATGTCCTTGCCCATTGCCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTACATGTCAGAAAATAAGGGAGTTCCTCTGCATGGGGGTGATGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102929 GTACATGTCAGAAAATAAGGGAGTTCCTCTGCATGGGGGTGATGAAGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GACCCTTTCCAG         ACTTTGACCCCTGGTGGACAAACGACTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102979 GACCCTTTCCAGGTA...CAGACTTTGACCCCTGGTGGACAAACGACTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGCAGAATGAGTCAGAGCCCATTCCTGCCAACTGCACTGGCTGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114869 GAGCAGAATGAGTCAGAGCCCATTCCTGCCAACTGCACTGGCTGTGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAAACACCTGAAGGTGATGCTCCTGGAAGACGCCCCAAGGAAATTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114919 GAAACACCTGAAGGTGATGCTCCTGGAAGACGCCCCAAGGAAATTTGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGCTCCATCCACTGGTGATCAAG         ACGGGAAAGCCCCTGTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 114969 GGCTCCATCCACTGGTGATCAAGGTG...AAGACGGGAAAGCCCCTGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGGAAGAGATTCAGCATTTTTTGTGCCAGTACCCTGAGGCGACAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115128 GAGGAAGAGATTCAGCATTTTTTGTGCCAGTACCCTGAGGCGACAGAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTCTCTGAAGGGTTTTTCGCCAAGTGGTGGCGCTGCTTTCCTGAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115178 CTTCTCTGAAGGGTTTTTCGCCAAGTGGTGGCGCTGCTTTCCTGAGCGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGTTCCCATTTCCTTATCCATG         GAGGAGACCTCTGAACAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115228 GGTTCCCATTTCCTTATCCATGGTG...CAGGAGGAGACCTCTGAACAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCACAAATGTTGCGTGAGCTTTTTCCTGTTTTCACTCACCTGCCATTTCC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117020 TCACAAATGTTACGTGAGCTTTTTCCTGTTTTCACTCACCTGCCATTTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AAAAGATGCCTCTTTAAACAAGTGCTCCTTTCTTCACCCAGAACCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117070 AAAAGATGCCTCTTTAAACAAGTGCTCCTTTCTTCACCCAGAACCTGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGGGAGTAAG         ATGCATAAGATGCCTGACCTATTTATCATT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117120 TGGGGAGTAAGGTA...CAGATGCATAAGATGCCTGACCTATTTATCATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGCAGCGGTGAGGCCATGTTGCAGCTCATCCCTCCCTTCCAGTGCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120164 GGCAGCGGTGAGGCCATGTTGCAGCTCATCCCTCCCTTCCAGTGCCGAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACATTGTCAGTCTGTGGCCATGCCAATAGAGCCAGGGGATATCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 120214 ACATTGTCAGTCTGTGGCCATGCCAATAGAGCCAGGGGATATCGGTA...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950    GCTATGTCGACACCACCCACTGGAAGGTCTGCGTTATAGCCAGAGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 123900 AAGGCTATGTCGACACCACCCACTGGAAGGTCTACGTTATAGCCAGAGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    997 GTCCAGCCTTTGGTCATCTGCGATGGAACCGCTTTCTCAGAACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123950 GTCCAGCCTTTGGTCATCTGCGATGGAACCGCTTTCTCAGAACTG