seq1 = pF1KE0176.tfa, 2331 bp
seq2 = pF1KE0176/gi568815583r_30841473.tfa (gi568815583r:30841473_31091506), 250034 bp

>pF1KE0176 2331
>gi568815583r:30841473_31091506 (Chr15)

(complement)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-121  (100670-100730)   100% ->
122-258  (114552-114688)   100% ->
259-331  (116504-116576)   98% ->
332-474  (117051-117193)   100% ->
475-565  (123497-123587)   100% ->
566-758  (130434-130626)   100% ->
759-846  (132386-132473)   100% ->
847-935  (132556-132644)   100% ->
936-1066  (136614-136744)   99% ->
1067-1136  (137876-137945)   100% ->
1137-1207  (139469-139539)   100% ->
1208-1377  (143036-143205)   100% ->
1378-1548  (144207-144377)   100% ->
1549-1731  (148435-148617)   99% ->
1732-2331  (149435-150034)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTCCCTCAAGCCGCCCAAACCCACCTTCAGGTCCTACCTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTCCCTCAAGCCGCCCAAACCCACCTTCAGGTCCTACCTCCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCGCCCCAG         ACTGACGATAAGATCAATTCGGAACCGAAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCGCCCCAGGTA...CAGACTGACGATAAGATCAATTCGGAACCGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTAAAAAACTGGAGCCAGTCCTTTTGCCAG         GAGAAATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100701 TTAAAAAACTGGAGCCAGTCCTTTTGCCAGGTA...AAGGAGAAATTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTAAATGAAGTCAATTTTGTGAGAAAATGCATTGCAACAGACACAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114563 GTAAATGAAGTCAATTTTGTGAGAAAATGCATTGCAACAGACACAAGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTACGATTTGTGGGGAAAGCTGATATGCAGTAACTTCAAAATCTCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114613 GTACGATTTGTGGGGAAAGCTGATATGCAGTAACTTCAAAATCTCCTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTACAGATGACCCAATGCCATTACAG         AAATTCCATTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 114663 TTACAGATGACCCAATGCCATTACAGGTG...CAGAAATTCCATTACAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AACCTTCTTCTTGGTGAACACGATGTCCCTTTAACATGTATTGAACAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 116519 AACCTTCTTCTTGGTGAACACGATGTCCCTTTAACATGTATTGAGCAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGTCACAG         TAAACGACCACAAGAGGAAGCAGAAAGTCCTAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 116569 TGTCACAGGTA...TAGTAAACGACCACAAGAGGAAGCAGAAAGTCCTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCCCCAACCAGAAACTGAAATTTAATCCAACAGAGTTAATTATTTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117084 GCCCCAACCAGAAACTGAAATTTAATCCAACAGAGTTAATTATTTATTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAGATTTCAGAATTGTCAGATTTCGCTTTGATGAATCAGGTCCCGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117134 AAAGATTTCAGAATTGTCAGATTTCGCTTTGATGAATCAGGTCCCGAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCTAAAAAG         GTATGCCTTGCAATAGCTCATTATTCCCAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 117184 TGCTAAAAAGGTA...TAGGTATGCCTTGCAATAGCTCATTATTCCCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAACAGACCTCCAGCTACTCTTTGCATTTGAATATGTTGGGAAAAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123528 CAACAGACCTCCAGCTACTCTTTGCATTTGAATATGTTGGGAAAAAATAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CACAATTCAG         CAAACAAAATTAATGGAATTCCCTCAGGAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 123578 CACAATTCAGGTA...CAGCAAACAAAATTAATGGAATTCCCTCAGGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTAATGGAGCTGGTGGTGGCAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130465 TGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTAATGGAGCTGGTGGTGGCAGCAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGAAAACTCCACTCTTTGAAACTTACTCGGATTGGGACAGAGAAATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130515 AGAAAACTCCACTCTTTGAAACTTACTCGGATTGGGACAGAGAAATCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGGACAGGTGCTTCCGGGTGGAGAGTTTGTTCTATTAACGAGGGTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130565 AGGACAGGTGCTTCCGGGTGGAGAGTTTGTTCTATTAACGAGGGTTACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GATATCCACTTG         CCTTCCAGAATACATTGTAGTGCCAAGTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 130615 GATATCCACTTGGTA...CAGCCTTCCAGAATACATTGTAGTGCCAAGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTTTAGCAGACCAAGATCTAAAGATCTTTTCCCATTCTTTTGTTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132415 CTTTAGCAGACCAAGATCTAAAGATCTTTTCCCATTCTTTTGTTGGGAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AGGATGCCA         CTCTGGTGCTGGAGCCACTCTAACGGCAGTGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 132465 AGGATGCCAGTA...TAGCTCTGGTGCTGGAGCCACTCTAACGGCAGTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCTTGTGCGAATGGCCCTCATCAAAGACGTGCTGCAGCAGAGGAAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132588 TCTTGTGCGAATGGCCCTCATCAAAGACGTGCTGCAGCAGAGGAAGATTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACCAGAG         GATTTGTAATGCAATAACTAAAAGTCACCCACAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132638 ACCAGAGGTA...TAGGATTTGTAATGCAATAACTAAAAGTCACCCACAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AGAAGTGATGTTTACAAATCAGATTTGGATAAGACCTTGCCTAATATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136648 AGAAGTGATGTTTACAAATCAGATTTGGATAAGACCTTGCCTAATATTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGAAATACAGGCAGCATTTGTAAAACTGAAGCAGCTATGCGTTAATG   
        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 136698 AGAAGTACAGGCAGCATTTGTAAAACTGAAGCAGCTATGCGTTAATGGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1067       AGCCTTTTGAAGAAACTGAAGAGAAATGGTTATCTTCACTGGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136748 ...CAGAGCCTTTTGAAGAAACTGAAGAGAAATGGTTATCTTCACTGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AATACTCGATGGTTAGAATATGTAAG         GGCATTCCTTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 137920 AATACTCGATGGTTAGAATATGTAAGGTT...CAGGGCATTCCTTAAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TTCAGCAGAACTTGTATACATGCTAGAAAGCAAACATCTCTCTGTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139484 TTCAGCAGAACTTGTATACATGCTAGAAAGCAAACATCTCTCTGTAGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TACAAG         AGGAGGAAGGAAGAGACTTGAGCTGTTGTGTAGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139534 TACAAGGTA...CAGAGGAGGAAGGAAGAGACTTGAGCTGTTGTGTAGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TCTCTTGTTCAAGTGATGCTGGATCCCTATTTTAGGACAATTACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143071 TCTCTTGTTCAAGTGATGCTGGATCCCTATTTTAGGACAATTACTGGATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 TCAGAGTCTGATACAGAAGGAGTGGGTCATGGCAGGATATCAGTTTCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143121 TCAGAGTCTGATACAGAAGGAGTGGGTCATGGCAGGATATCAGTTTCTAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ACAGATGCAACCATCTAAAGAGATCAGAGAAAGAG         TCTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 143171 ACAGATGCAACCATCTAAAGAGATCAGAGAAAGAGGTA...CAGTCTCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TTATTTTTGCTATTCTTGGATGCCACCTGGCAGCTGTTAGAACAATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144213 TTATTTTTGCTATTCTTGGATGCCACCTGGCAGCTGTTAGAACAATATCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TGCAGCTTTTGAGTTCTCCGAAACCTACCTGGCAGTGTTGTATGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144263 TGCAGCTTTTGAGTTCTCCGAAACCTACCTGGCAGTGTTGTATGACAGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CCCGGATCTCACTGTTTGGCACCTTCCTGTTCAACTCCCCTCACCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144313 CCCGGATCTCACTGTTTGGCACCTTCCTGTTCAACTCCCCTCACCAGCGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GTGAAGCAAAGCACG         GAATTTGCTATAAGCAAAAACATCCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 144363 GTGAAGCAAAGCACGGTA...CAGGAATTTGCTATAAGCAAAAACATCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 ATTGGGTGATGAGAAGGGCTTAAAATTCCCCTCTGTTTGGGACTGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148461 ATTGGGTGATGAGAAGGGCTTAAAATTCCCCTCTGTTTGGGACTGGTCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCCAGTTTACAGCAAAGGATCGCACCCTTTTCCATAACCCCTTCTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148511 TCCAGTTTACAGCAAAGGATCGCACCCTTTTCCATAACCCCTTCTACATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GGAAAGAGCACGCCTTGTATACAGAATGGCTCCGTGAAGTCTTTTAAACG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148561 GGAAAGAGCACACCTTGTATACAGAATGGCTCCGTGAAGTCTTTTAAACG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GACAAAG         AAAAGCTACAGCTCCACACTAAGAGGAATGCCGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148611 GACAAAGGTA...TAGAAAAGCTACAGCTCCACACTAAGAGGAATGCCGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CTGCCTTAAAGAATGGAATCATCAGTGACCAAGAATTACTTCCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149469 CTGCCTTAAAGAATGGAATCATCAGTGACCAAGAATTACTTCCAAGGAGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AATTCATTGATATTAAAACCAAAGCCAGATCCAGCTCAGCAAACCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149519 AATTCATTGATATTAAAACCAAAGCCAGATCCAGCTCAGCAAACCGACAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CCAGAACAGTGATACGGAGCAGTATTTTAGAGAATGGTTTTCCAAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149569 CCAGAACAGTGATACGGAGCAGTATTTTAGAGAATGGTTTTCCAAACCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 CCAACCTGCACGGTGTTATTCTGCCACGTGTCTCTGGAACACACATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149619 CCAACCTGCACGGTGTTATTCTGCCACGTGTCTCTGGAACACACATAAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CTGTGGAAACTGTGCTACTTCCGCTGGGTTCCCGAGGCCCAGATCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149669 CTGTGGAAACTGTGCTACTTCCGCTGGGTTCCCGAGGCCCAGATCAGCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GGGTGGCTCCATCACAGCCTTTCACAAGCTCTCCCTCCTGGCTGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149719 GGGTGGCTCCATCACAGCCTTTCACAAGCTCTCCCTCCTGGCTGATGAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TCGACGTACTGAGCAGGATGCTGCGGCAACAGCGCAGTGGCCCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149769 TCGACGTACTGAGCAGGATGCTGCGGCAACAGCGCAGTGGCCCCCTGGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GCCTGCTATGGGGGGCTGGGCCAGAGCAGGATGTACTTCAACGCCAGCGG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149819 GCCTGCTATGGGGAGCTGGGCCAGAGCAGGATGTACTTCAACGCCAGCGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CCCTCACCACACCGACACCTCGGGGACACCGGAGTTTCTCTCCTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149869 CCCTCACCACACCGACACCTCGGGGACACCGGAGTTTCTCTCCTCCTCAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TTCCATTTTCTCCTGTAGGGAATCTGTGCAGACGAAGCATTTTAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149919 TTCCATTTTCTCCTGTAGGGAATCTGTGCAGACGAAGCATTTTAGGAACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CCATTAAGCAAATTTTTAAGTGGGGCCAAAATATGGTTGTCTACTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149969 CCATTAAGCAAATTTTTAAGTGGGGCCAAAATATGGTTGTCTACTGAGAC

   2450     .    :    .
   2316 ATTAGCAAATGAAGAC
        ||||||||||||||||
 150019 ATTAGCAAATGAAGAC