seq1 = pF1KE0175.tfa, 903 bp
seq2 = pF1KE0175/gi568815581f_44089119.tfa (gi568815581f:44089119_44290861), 201743 bp

>pF1KE0175 903
>gi568815581f:44089119_44290861 (Chr17)

1-542  (99929-100470)   100% ->
543-903  (101383-101743)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTCTCTGATGTCACCCTCATTGAGGGTGTGGGTAATGAGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99929 ATGGAGCTCTCTGATGTCACCCTCATTGAGGGTGTGGGTAATGAGGTGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGTGGCAGGTGTGGTGGTGCTGATTCTAGCCTTGGTCCTAGCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99979 GGTGGTGGCAGGTGTGGTGGTGCTGATTCTAGCCTTGGTCCTAGCTTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCTACCTACGTAGCAGACAGCGGTAGCAACCAGCTCCTGGGCGCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100029 TCTCTACCTACGTAGCAGACAGCGGTAGCAACCAGCTCCTGGGCGCTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGTCAGCAGGCGACACATCCGTCCTCCACCTGGGGCATGTGGACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100079 GTGTCAGCAGGCGACACATCCGTCCTCCACCTGGGGCATGTGGACCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTGGCAGGCCAAGGCAACCCCGAGCCAACTGAACTCCCCCATCCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100129 GGTGGCAGGCCAAGGCAACCCCGAGCCAACTGAACTCCCCCATCCATCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGGTAATGATGAGAAGGCTGAAGAGGCGGGTGAAGGTCGGGGAGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100179 AGGGTAATGATGAGAAGGCTGAAGAGGCGGGTGAAGGTCGGGGAGACTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTGGGGAGGCTGGAGCTGGGGGTGGTGTTGAGCCCAGCCTTGAGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100229 ACTGGGGAGGCTGGAGCTGGGGGTGGTGTTGAGCCCAGCCTTGAGCATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTTGACATCCAAGGCCTGCCCAAAAGACAAGCAGGTGCAGGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100279 CCTTGACATCCAAGGCCTGCCCAAAAGACAAGCAGGTGCAGGCAGCAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTCCAGAGGCCCCCCTGAGATCTGAGGATAGCACCTGCCTCCCTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100329 GTCCAGAGGCCCCCCTGAGATCTGAGGATAGCACCTGCCTCCCTCCCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGGCCTCATCACTGTGCGGCTCAAATTCCTCAATGATACCGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100379 CCTGGCCTCATCACTGTGCGGCTCAAATTCCTCAATGATACCGAGGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCTGTGGCTAGGCCAGAGGATACCGTGGGTGCCCTGAAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100429 GGCTGTGGCTAGGCCAGAGGATACCGTGGGTGCCCTGAAGAGGTG...CA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    543  CAAATACTTCCCTGGACAAGAAAGCCAGATGAAACTGATCTACCAGGGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101382 GCAAATACTTCCCTGGACAAGAAAGCCAGATGAAACTGATCTACCAGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCCTGCTACAAGACCCAGCCCGCACACTGCGTTCTCTGAACATTACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101432 CGCCTGCTACAAGACCCAGCCCGCACACTGCGTTCTCTGAACATTACCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAACTGTGTGATTCACTGCCACCGCTCACCCCCAGGGTCAGCTGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101482 CAACTGTGTGATTCACTGCCACCGCTCACCCCCAGGGTCAGCTGTTCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCCCCTCAGCCTCCTTGGCCCCCTCGGCCACTGAGCCACCCAGACTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 101532 GCCCCTCAGCCTCCTTGGCCCCCTCGGCCACTGAGCCACCCAGCCTTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GTCAATGTGGGCAGCCTCATGGTGCCTGTCTTTGTGGTGCTGTTGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101582 GTCAATGTGGGCAGCCTCATGGTGCCTGTCTTTGTGGTGCTGTTGGGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGTCTGGTACTTCCGAATCAATTACCGCCAATTCTTCACAGCACCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101632 GGTCTGGTACTTCCGAATCAATTACCGCCAATTCTTCACAGCACCTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTGTCTCCCTGGTGGGAGTCACCGTCTTCTTCAGCTTCCTAGTATTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101682 CTGTCTCCCTGGTGGGAGTCACCGTCTTCTTCAGCTTCCTAGTATTTGGG

    900     .    :
    892 ATGTATGGACGA
        ||||||||||||
 101732 ATGTATGGACGA