seq1 = pF1KE0166.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KE0166/gi568815575r_134672142.tfa (gi568815575r:134672142_134896205), 224064 bp

>pF1KE0166 744
>gi568815575r:134672142_134896205 (ChrX)

(complement)

1-98  (100001-100098)   100% ->
99-177  (102313-102391)   100% ->
178-221  (106940-106983)   100% ->
222-276  (107067-107121)   100% ->
277-378  (107375-107476)   100% ->
379-440  (108673-108734)   100% ->
441-505  (110256-110320)   100% ->
506-602  (114289-114385)   100% ->
603-744  (123923-124064)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCAGGAGAAAATGGAGCTGGACCTTGAGCCTGACACATCTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCAGGAGAAAATGGAGCTGGACCTTGAGCCTGACACATCTTATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGAACCCTGAGGAGATCCAGCAGCGCTCCCCTAATCCATGGGCTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100051 GGGAACCCTGAGGAGATCCAGCAGCGCTCCCCTAATCCATGGGCTCAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99        TGACCTTTCACAGGTTTTCCAACCTTACACACTTAGAACTCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 G...CAGTGACCTTTCACAGGTTTTCCAACCTTACACACTTAGAACTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGAATAGTACAACAATTATGAGCCGTCACAGCCTG         GAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102356 AGGAATAGTACAACAATTATGAGCCGTCACAGCCTGGTA...CAGGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGGCCTGGATATGGTGAACAGAGAAACTGCACATGAAAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106945 AGGCCTGGATATGGTGAACAGAGAAACTGCACATGAAAGGTT...TAGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAATGCAAACGGCAATGCAGATAAGCCAATCATGGGATGAGAGCTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107069 AAATGCAAACGGCAATGCAGATAAGCCAATCATGGGATGAGAGCTTGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTG         AGTGACAGTGATTTTGACAAGCCGGAGAAATTATATTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107119 CTGGTA...CAGAGTGACAGTGATTTTGACAAGCCGGAGAAATTATATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TCCTAAGAGAATTGACTTCACTCCAGTTTCTCCAGCACCTTCACCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107413 TCCTAAGAGAATTGACTTCACTCCAGTTTCTCCAGCACCTTCACCCACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GGGGATTCGGAAAG         ATGTTCGTGAGCAGCAGTGGATTGCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 107463 GGGGATTCGGAAAGGTA...CAGATGTTCGTGAGCAGCAGTGGATTGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CCAAGTCCAGTTCCCAGTCCAAGACGATTTTCAAG         CAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 108700 CCAAGTCCAGTTCCCAGTCCAAGACGATTTTCAAGGTA...AAGCAGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 AAGTCAGAGTCCAGTCAAGTGCATTAGACCCAGTGTTCTTGGTCCTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110262 AAGTCAGAGTCCAGTCAAGTGCATTAGACCCAGTGTTCTTGGTCCTCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AAAGAAAAG         GTGAAATGGAGACAGAAAGTCAGCCCAAGAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110312 AAAGAAAAGGTA...TAGGTGAAATGGAGACAGAAAGTCAGCCCAAGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 CTCTTCCAAGGCACTACCAATATGTTATCTCCAGATGCCGCGCAACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114321 CTCTTCCAAGGCACTACCAATATGTTATCTCCAGATGCCGCGCAACTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TGATCTCAGTTCATG         TTCAGATATTTTGGATGGCAGTAGTA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 114371 TGATCTCAGTTCATGGTA...CAGTTCAGATATTTTGGATGGCAGTAGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 GCAGCAGTGGCTTATCCTCAGACCCGCTGGCTAAAGGCAGCGCTACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123949 GCAGCAGTGGCTTATCCTCAGACCCGCTGGCTAAAGGCAGCGCTACCGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GAGTCTCCAGTAGCATGCTCCAATTCATGCTCTTCGTTCATCTTGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123999 GAGTCTCCAGTAGCATGCTCCAATTCATGCTCTTCGTTCATCTTGATGGA

    800     .    :    .
    729 TGATCTCTCACCCAAG
        ||||||||||||||||
 124049 TGATCTCTCACCCAAG