seq1 = pF1KE0159.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KE0159/gi568815594r_17387134.tfa (gi568815594r:17387134_17611993), 224860 bp

>pF1KE0159 732
>gi568815594r:17387134_17611993 (Chr4)

(complement)

1-105  (99940-100044)   100% ->
106-198  (102631-102723)   100% ->
199-295  (107519-107615)   100% ->
296-436  (110135-110275)   100% ->
437-545  (119654-119762)   100% ->
546-629  (121249-121332)   100% ->
630-732  (124758-124860)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCGGCGGCTGCAGGCGAGGCGCGCCGGGTGCTGGTGTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99940 ATGGCGGCGGCGGCGGCTGCAGGCGAGGCGCGCCGGGTGCTGGTGTACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCAGGGGCGCTCTGGGTTCTCGATGCGTGCAGGCTTTTCGGGCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99990 CGGCAGGGGCGCTCTGGGTTCTCGATGCGTGCAGGCTTTTCGGGCCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGG         TGGGTTGCCAGCGTTGATGTGGTGGAGAATGAAGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100040 ACTGGGTA...CAGTGGGTTGCCAGCGTTGATGTGGTGGAGAATGAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCAGCGCTAGCATCATTGTTAAAATGACAGACTCGTTCACTGAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102667 GCCAGCGCTAGCATCATTGTTAAAATGACAGACTCGTTCACTGAGCAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACCAG         GTGACTGCTGAGGTTGGAAAGCTCTTGGGTGAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102717 TGACCAGGTA...AAGGTGACTGCTGAGGTTGGAAAGCTCTTGGGTGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAGGTGGATGCAATTCTTTGCGTTGCTGGAGGATGGGCCGGGGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107553 AGAAGGTGGATGCAATTCTTTGCGTTGCTGGAGGATGGGCCGGGGGCAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCAAATCCAAGT         CTCTCTTTAAGAACTGTGACCTGATGTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107603 GCCAAATCCAAGTGTG...CAGCTCTCTTTAAGAACTGTGACCTGATGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAGCAGAGCATATGGACATCGACCATCTCCAGCCATCTGGCTACCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110163 GAAGCAGAGCATATGGACATCGACCATCTCCAGCCATCTGGCTACCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTCAAGGAAGGAGGCCTCCTGACCTTGGCTGGCGCAAAGGCTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110213 ATCTCAAGGAAGGAGGCCTCCTGACCTTGGCTGGCGCAAAGGCTGCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGGGACTCCTG         GTATGATCGGGTACGGCATGGCCAAGGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110263 GATGGGACTCCTGGTA...CAGGTATGATCGGGTACGGCATGGCCAAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCTGTTCACCAGCTCTGCCAGAGCCTGGCTGGGAAGAACAGCGGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119682 TGCTGTTCACCAGCTCTGCCAGAGCCTGGCTGGGAAGAACAGCGGCATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGCCCGGGGCAGCCGCCATCGCTGTGCTCCC         GGTTACCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119732 CGCCCGGGGCAGCCGCCATCGCTGTGCTCCCGTA...CAGGGTTACCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GATACCCCGATGAACAGGAAATCAATGCCTGAGGCTGACTTCAGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121259 GATACCCCGATGAACAGGAAATCAATGCCTGAGGCTGACTTCAGCTCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GACACCCTTAGAATTCCTAGTTGA         AACTTTCCATGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 121309 GACACCCTTAGAATTCCTAGTTGAGTG...CAGAACTTTCCATGACTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCACAGGGAAAAACCGACCGAGCTCAGGAAGCCTAATCCAGGTGGTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124775 TCACAGGGAAAAACCGACCGAGCTCAGGAAGCCTAATCCAGGTGGTAACC

    750     .    :    .    :    .    :    .
    697 ACAGAAGGAAGGACGGAACTCACCCCAGCATATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124825 ACAGAAGGAAGGACGGAACTCACCCCAGCATATTTT