seq1 = pF1KE0149.tfa, 468 bp
seq2 = pF1KE0149/gi568815575f_7743204.tfa (gi568815575f:7743204_7943852), 200649 bp

>pF1KE0149 468
>gi568815575f:7743204_7943852 (ChrX)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-447  (100295-100639)   98% ->
448-468  (100790-100810)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCCAAAGCCGAGAGCCTCGGGACCTCCGGCCAAGGCCACGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCCAAAGCCGAGAGCCTCGGGACCTCCGGCCAAGGCCACGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGAAAGAGGAAGTCCTCCTCTCAGCCGAGCCCCAGTGACCCGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGAAAGAGGAAGTCCTCCTCTCAGCCGAGCCCCAGTGACCCGAAGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         ACTACCAAGGTGGCCAAGAAGGGAAAAGCAGTTCGTAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTG...CAGACTACCAAGGTGGCCAAGAAGGGAAAAGCAGTTCGTAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAGACGCGGGAAGAAAGGGGCTGCGACAAAGATGGCGGCCGTGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100334 GGGAGACGCGGGAAGAAAGGGGCTGCGACAAAGATGGCGGCCGTGACGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCTGAGGCGGAGAGCGGGCCAGCGGCACCCGGCCCCAGCGACCAGCCCA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100384 ACCTGAGGCGGAGAGCGCGCCAGCGGCACCCGGCCCCAGCGACCAGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCAGGAGCTCCCTCAGCACGAGCTGCCGCCGGAGGAGCCAGTGAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100434 GCCAGGAGCTCCCTCAGCACGAGCTGCCGCCGGAGGAGCCAGTGAGCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGACCCAGCACGACCCCCTGAGTCAGGAGAGCGAGCTGGAGGAACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
 100484 GGGACCCAGCACGACCCCCTGAGTCAGGAGGCCGAGCTGGAGGAACCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAGTCAGGAGAGCGAGGTGGAAGAACCACTGAGTCAGGAGAGCCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100534 GAGTCAGGAGAGCGAGGTGGAAGAACCACTGAGTCAGGAGAGCCAGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGAACCACTGAGTCAGGAGAGCGAGGTGGAAGAACCACTGAGTCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100584 AGGAACCACTGAGTCAGGAGAGCGAGGTGGAAGAACCACTGAGTCAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    442 AGCGAG         ATGGAAGAACTACCGAGTGTG
        ||| ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100634 AGCCAGGTG...GAGATGGAAGAACTACCGAGTGTG