seq1 = pF1KE0148.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KE0148/gi568815591f_143163514.tfa (gi568815591f:143163514_143368834), 205321 bp

>pF1KE0148 678
>gi568815591f:143163514_143368834 (Chr7)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-154  (100573-100654)   100% ->
155-283  (101035-101163)   100% ->
284-384  (101479-101579)   100% ->
385-420  (101748-101783)   100% ->
421-537  (104104-104220)   99% ->
538-631  (104578-104671)   100% ->
632-678  (105275-105321)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCCCCTGCCGCGCACCGTGGAGCTCTTCTATGACGTGCTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCCCCTGCCGCGCACCGTGGAGCTCTTCTATGACGTGCTGTCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACTCCTGGCTGGGCTTCGAG         ATCCTGTGCCGGTATCAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CTACTCCTGGCTGGGCTTCGAGGTG...CAGATCCTGTGCCGGTATCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATATCTGGAACATCAACCTGCAGTTGCGGCCCAGCCTCATAACAGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100592 ATATCTGGAACATCAACCTGCAGTTGCGGCCCAGCCTCATAACAGGGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAAAGACAGTG         GAAACAAGCCTCCAGGTCTGCTTCCCCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100642 ATGAAAGACAGTGGTA...CAGGAAACAAGCCTCCAGGTCTGCTTCCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAAGGACTATACATGGCAAATGACTTAAAGCTCCTGAGACACCATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101063 CAAAGGACTATACATGGCAAATGACTTAAAGCTCCTGAGACACCATCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATTCCCATCCACTTCCCCAAGGATTTCTTGTCTGTGATGCTTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101113 AGATTCCCATCCACTTCCCCAAGGATTTCTTGTCTGTGATGCTTGAAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 G         GAAGTTTGTCTGCCATGCGTTTCCTCACCGCCGTGAACTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101163 GGTG...CAGGAAGTTTGTCTGCCATGCGTTTCCTCACCGCCGTGAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAGCATCCAGAGATGCTGGAGAAAGCGTCCCGGGAGCTGTGGATGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101519 GGAGCATCCAGAGATGCTGGAGAAAGCGTCCCGGGAGCTGTGGATGCGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGGTCAAGG         AATGAAGACATCACCGAGCCGCAGAGCATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101569 TCTGGTCAAGGGTG...CAGAATGAAGACATCACCGAGCCGCAGAGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGCG         GCTGCAGAGAAGGCTGGTATGTCTGCAGAACAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 CTGGCGGTG...TAGGCTGCAGAGAAGGCTGGTATGTCTGCAGAACAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCAGGGACTTCTGGAAAAGATCGCAGCGCCAAAGGTGAAGAACCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 104139 CCAGGGACTTCTGGAAAAGATCGCAACGCCAAAGGTGAAGAACCAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGAGACCACTGAGGCAGCCTGCAGATACGGA         GCCTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104189 AGGAGACCACTGAGGCAGCCTGCAGATACGGAGTG...CAGGCCTTTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CTGCCCATCACCGTGGCCCATGTGGATGGCCAAACCCACATGTTATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104587 CTGCCCATCACCGTGGCCCATGTGGATGGCCAAACCCACATGTTATTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTCTGACCGGATGGAGCTGCTGGCGCACCTGCTGG         GAGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104637 CTCTGACCGGATGGAGCTGCTGGCGCACCTGCTGGGTA...CAGGAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AGTGGATGGGCCCTATACCTCCAGCCGTGAATGCCAGACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105281 AGTGGATGGGCCCTATACCTCCAGCCGTGAATGCCAGACTT