seq1 = pF1KE0147.tfa, 612 bp
seq2 = pF1KE0147/gi568815578f_249644.tfa (gi568815578f:249644_453632), 203989 bp

>pF1KE0147 612
>gi568815578f:249644_453632 (Chr20)

1-189  (100001-100189)   100% ->
190-612  (103567-103989)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCCGAGCTGCAATCGTTCCTGCAGCTGCAGCCGCGGCCCCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCCGAGCTGCAATCGTTCCTGCAGCTGCAGCCGCGGCCCCAGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGATGGCAAGTGGTATGGGGTCCGCTCCTACCTGCACCTCTTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGATGGCAAGTGGTATGGGGTCCGCTCCTACCTGCACCTCTTCTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACTGTGCAGGCACTGCTCTCAGCGACGACCCTGAGGGACCTCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGACTGTGCAGGCACTGCTCTCAGCGACGACCCTGAGGGACCTCCGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGTGCCCCCGCCGGCCCTGGCCCTCACTGTGTTGGAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100151 CTGTGCCCCCGCCGGCCCTGGCCCTCACTGTGTTGGAAGGTA...TAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGCCTGTCCTCGGGGACCCTGCTTCTGCTGCTGGGTGTGGCGGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103569 CAGCCTGTCCTCGGGGACCCTGCTTCTGCTGCTGGGTGTGGCGGCTCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCACTGGCTATGCAGTGCCCCCCAAGCTGGAGGGCATCGGTGAGGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103619 CCACTGGCTATGCAGTGCCCCCCAAGCTGGAGGGCATCGGTGAGGGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCTGGTGTTGGATCAGCGGACAGCCGACTACAACCAGGCCCTGGGCAC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 103669 TTCCTGGTGTTGGATCAGCGGGCAGCCGACTACAACCAGGCCCTGGGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGTCGCCTGGCAGGCACAGCGCTCTGTGTGGCAGCTGGAGTTCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103719 CTGTCGCCTGGCAGGCACAGCGCTCTGTGTGGCAGCTGGAGTTCTGCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCATCTGCCTCTTCTGGGCCATGATAGGCTGGCTGAGCCAGGACACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103769 CCATCTGCCTCTTCTGGGCCATGATAGGCTGGCTGAGCCAGGACACCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCAGAGCCCTTGGACCCCGAAGCCGACAGCCACGTGGAGGTCTTCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103819 GCAGAGCCCTTGGACCCCGAAGCCGACAGCCACGTGGAGGTCTTCGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAGCCAGAGCAGCAGTTGTCACCCATTTTCCGCAATGCCAGTGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103869 TGAGCCAGAGCAGCAGTTGTCACCCATTTTCCGCAATGCCAGTGGCCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CATGGTTCTCGCCACCCGCCAGCCCCTTTGGGCAATCTTCTGTGCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103919 CATGGTTCTCGCCACCCGCCAGCCCCTTTGGGCAATCTTCTGTGCAGACT

    600     .    :    .    :
    592 ATCCAGCCCAAGAGGGACTCC
        |||||||||||||||||||||
 103969 ATCCAGCCCAAGAGGGACTCC