seq1 = pF1KE0145.tfa, 375 bp
seq2 = pF1KE0145/gi568815589f_136749431.tfa (gi568815589f:136749431_136950844), 201414 bp

>pF1KE0145 375
>gi568815589f:136749431_136950844 (Chr9)

1-160  (100001-100160)   98% ->
161-285  (100583-100707)   99% ->
286-375  (101325-101414)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGGCGGACCTCGCTCTCATTCCTGATGTGGACACCGACTCCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100001 ATGGCGGTGGCGGACCTCGCTCTCATTCCTGATGTGGACATCGACTCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCGTCTTCAAGTATGTGCTGATCCGAATCCACTCGGCTCCCCGCTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100051 CGGCGTCTTCAAGTATGTGCTGATCCGAGTCCACTCGGCTCCCCGCTCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCTCCGGCTGCAGAGAGCAAGGAGATCGTGCGCGGCTACAAGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCTCCGGCTGCAGAGAGCAAGGAGATCGTGCGCGGCTACAAGTGGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGTACCATG         CGGACATCTACGACAAAGTGTCGGGCGACAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGTACCATGGTG...CAGCGGACATCTACGACAAAGTGTCGGGCGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGAAGCAAGGCTGCGACTGTGAGTGTCTGGGCGGCGGGCGCACCTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100614 GCAGAAGCAAGGCTGCGACTGTGAGTGTCTGGGCGGCGGGCGCATCTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCAGAGTCAGGACAAGAAGATTCACGTGTACGGCTATTCCATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100664 ACCAGAGTCAGGACAAGAAGATTCACGTGTACGGCTATTCCATGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    GCCTATGGTCCTGCCCAGCACGCCATTTCAACTGAGAAAATCAAAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101322 CAGGCCTATGGTCCTGCCCAGCACGCCATTTCAACTGAGAAAATCAAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGTACCCCGACTACGAGGTCACCTGGGCTAACGACGGCTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101372 CAAGTACCCCGACTACGAGGTCACCTGGGCTAACGACGGCTAC