seq1 = pF1KE0144.tfa, 501 bp
seq2 = pF1KE0144/gi568815586f_108462623.tfa (gi568815586f:108462623_108668913), 206291 bp

>pF1KE0144 501
>gi568815586f:108462623_108668913 (Chr12)

1-114  (100001-100114)   97% ->
115-228  (101657-101770)   100% ->
229-339  (102699-102809)   100% ->
340-418  (104568-104646)   100% ->
419-501  (106209-106291)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCTGGGGCTGGCCGTCTGAGGCGGGTGGCATCGGCTCTGCT
        ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCTGGGGCTTTCCGTCTGAGGCGGGCGGCATCGGCTCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCGGAGCCCCCGCCTGCCCGCCCGGGAGCTGTCGGCCCCGGCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCGGAGCCCCCGCCTGCCCGCCCGGGAGCTGTCGGCCCCGGCCCGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATCACAAGAAG         GTTGTTGATCATTATGAAAATCCTAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATCACAAGAAGGTA...TAGGTTGTTGATCATTATGAAAATCCTAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACGTGGGGTCCCTTGACAAGACATCTAAAAATGTTGGAACTGGACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101684 AACGTGGGGTCCCTTGACAAGACATCTAAAAATGTTGGAACTGGACTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGGGCTCCAGCATGTGGTGACGTAATGAAATTACAG         ATTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101734 GGGGGCTCCAGCATGTGGTGACGTAATGAAATTACAGGTA...TAGATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGTGGATGAAAAGGGGAAGATTGTGGATGCTAGGTTTAAAACATTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102703 AAGTGGATGAAAAGGGGAAGATTGTGGATGCTAGGTTTAAAACATTTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTGGTTCCGCAATTGCCTCCAGCTCATTAGCCACTGAATGGGTGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102753 TGTGGTTCCGCAATTGCCTCCAGCTCATTAGCCACTGAATGGGTGAAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAGACG         GTGGAGGAAGCCTTGACTATCAAAAACACAGATA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102803 AAAGACGGTA...CAGGTGGAGGAAGCCTTGACTATCAAAAACACAGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCGCCAAGGAGCTCTGCCTTCCTCCCGTGAAACTGCACTGCTCCA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104602 TCGCCAAGGAGCTCTGCCTTCCTCCCGTGAAACTGCACTGCTCCAGTA..

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    419     TGCTGGCTGAAGATGCAATCAAGGCCGCCCTGGCTGATTACAAATT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104652 .CAGTGCTGGCTGAAGATGCAATCAAGGCCGCCCTGGCTGATTACAAATT

    500     .    :    .    :    .    :    .
    465 GAAACAAGAACCCAAAAAAGGAGAGGCAGAGAAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106255 GAAACAAGAACCCAAAAAAGGAGAGGCAGAGAAGAAA