seq1 = pF1KE0138.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KE0138/gi568815588r_12798438.tfa (gi568815588r:12798438_13101570), 303133 bp

>pF1KE0138 810
>gi568815588r:12798438_13101570 (Chr10)

(complement)

1-374  (100001-100374)   100% ->
375-549  (103059-103233)   100% ->
550-810  (202892-203152)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCGCCAGCTGCTGCTCGCCGCGCTCTGCCTGGCGGGTCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCGCCAGCTGCTGCTCGCCGCGCTCTGCCTGGCGGGTCCCCCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCGCGCGCGCCTGCCAGCTGCCCTCCGAGTGGAGGCCCCTGAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCGCGCGCGCCTGCCAGCTGCCCTCCGAGTGGAGGCCCCTGAGCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGCCGCGCCGAGCTGGCCGAGACCATCGTGTACGCCAGGGTGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTGCCGCGCCGAGCTGGCCGAGACCATCGTGTACGCCAGGGTGCTGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCACCCCGAGGCGCCCGGCCTCTACAACCACCTGCCCTGGCAGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCACCCCGAGGCGCCCGGCCTCTACAACCACCTGCCCTGGCAGTACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCGGCCAGGGGGGCCTCTTCTACTCGGCCGAGGTCGAGATGCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCGGCCAGGGGGGCCTCTTCTACTCGGCCGAGGTCGAGATGCTGTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCAGGCGTGGGGCAGCATGCTGGAGGTGCCCGCCGGCTCCAGGCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCAGGCGTGGGGCAGCATGCTGGAGGTGCCCGCCGGCTCCAGGCTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCACCGGCCTGGGCTACTTCTCGTGCCACTCCCACACCGTGGTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCACCGGCCTGGGCTACTTCTCGTGCCACTCCCACACCGTGGTCCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTACTCCTATTTCTTCTTCCTCAG         GATGGATGAAAATTATA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100351 CTACTCCTATTTCTTCTTCCTCAGGTG...TAGGATGGATGAAAATTATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCTCTTGCCTCACGGAGTCAATTTCCAAGATGCCATCTTCCCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103076 ACCTCTTGCCTCACGGAGTCAATTTCCAAGATGCCATCTTCCCAGACACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAAGAGAACAGAAGGATGTTTTCTAGCCTTTTCCAGTTTTCAAACTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103126 CAAGAGAACAGAAGGATGTTTTCTAGCCTTTTCCAGTTTTCAAACTGTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCAAGGGCAGCAGCTGGCGACTTTCTCCAGTGACTGGGAAATCCAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103176 GCAAGGGCAGCAGCTGGCGACTTTCTCCAGTGACTGGGAAATCCAGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACAGTAGG         CTCATGTGCTCCTCGGTGCAGAAGGCCTTGTTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103226 ACAGTAGGGTA...CAGCTCATGTGCTCCTCGGTGCAGAAGGCCTTGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGGAGGAGGACCACGTCAAGAAACTGCAGCAGAAAGTGGCCACCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202925 GAGGAGGAGGACCACGTCAAGAAACTGCAGCAGAAAGTGGCCACCCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAAGCGCAACCGGCAGCTCCGGGAGCGAGTGAAGAAGGTCAAGAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202975 GAAGCGCAACCGGCAGCTCCGGGAGCGAGTGAAGAAGGTCAAGAGGTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGCGGCAGGCGCGTAAGAAGGGCCGCCACCTGGAGCTGGCGAACCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203025 TGCGGCAGGCGCGTAAGAAGGGCCGCCACCTGGAGCTGGCGAACCAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTCAGTGAGAAGCTGGCGGCGGGCGCGCTGCCGCACATCAACGCCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 203075 CTCAGTGAGAAGCTGGCGGCGGGCGCGCTGCCGCACATCAATGCCCGGGG

    800     .    :    .    :    .
    783 GCCCGTGCGCCCCCCCTACCTGCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 203125 GCCCGTGCGCCCCCCCTACCTGCGGGGG