seq1 = pF1KE0136.tfa, 906 bp
seq2 = pF1KE0136/gi568815575r_154302710.tfa (gi568815575r:154302710_154505568), 202859 bp

>pF1KE0136 906
>gi568815575r:154302710_154505568 (ChrX)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-224  (100486-100574)   98% ->
225-311  (100655-100741)   100% ->
312-412  (101947-102047)   100% ->
413-525  (102188-102300)   100% ->
526-774  (102379-102627)   100% ->
775-906  (102728-102859)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACTACCCAACTGCACTCCTCTTCCTCATCCTGGCCAATGGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACTACCCAACTGCACTCCTCTTCCTCATCCTGGCCAATGGGGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCTTTCGCATCTGCGCCTTCAATGCCCAGCGGCTGACACTGGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCTTTCGCATCTGCGCCTTCAATGCCCAGCGGCTGACACTGGCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCAGGGAGCAGGTGATGGACACCTTAGTTCGG         ATACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 TGGCCAGGGAGCAGGTGATGGACACCTTAGTTCGGGTA...CAGATACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTCGCTGTGACATCATGGTGCTGCAGGAGGTGGTGGACTCTTCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100492 GCTCGCTGTGACATCATGGTGCTGCAGGAGGTGGTGGACTCTTCCGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCCATCCCCCTCCTGCTTCGAGAACTCAATCG         ATTTGATG
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100542 CGCCATCCCGCTCCTGCTTCGAGAACTCAATCGGTG...CAGATTTGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTCTGGGCCCTACAGCACCCTGAGCAGCCCCCAGCTGGGGCGCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100663 GCTCTGGGCCCTACAGCACCCTGAGCAGCCCCCAGCTGGGGCGCAGCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACATGGAGACGTATGTGTACTTCTATCG         GTCACACAAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100713 TACATGGAGACGTATGTGTACTTCTATCGGTG...CAGGTCACACAAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAGGTCCTGAGTTCCTACGTGTACAACGATGAGGATGACGTCTTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101959 ACAGGTCCTGAGTTCCTACGTGTACAACGATGAGGATGACGTCTTTGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGAGCCATTTGTGGCCCAGTTCTCTTTGCCCAGCAATG         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102009 GGGAGCCATTTGTGGCCCAGTTCTCTTTGCCCAGCAATGGTA...CAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTTCCCAGCCTGGTGTTGGTCCCGCTGCACACCACTCCTAAGGCCGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102190 CTTCCCAGCCTGGTGTTGGTCCCGCTGCACACCACTCCTAAGGCCGTAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAGGAGCTGAACGCCCTCTACGATGTGTTTCTGGAGGTCTCCCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102240 GAAGGAGCTGAACGCCCTCTACGATGTGTTTCTGGAGGTCTCCCAGCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGCAGAGCAAG         GACGTGATCCTGCTTGGGGACTTCAATGCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102290 GGCAGAGCAAGGTA...TAGGACGTGATCCTGCTTGGGGACTTCAATGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACTGCGCTTCACTGACCAAAAAGCGCCTGGACAAGCTGGAGCTGCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102409 GACTGCGCTTCACTGACCAAAAAGCGCCTGGACAAGCTGGAGCTGCGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAGCCAGGCTTCCACTGGGTGATTGCCGATGGGGAGGACACCACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102459 TGAGCCAGGCTTCCACTGGGTGATTGCCGATGGGGAGGACACCACAGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGGCCAGCACCCACTGCACCTATGACCGCGTCGTGCTGCACGGGGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102509 GGGCCAGCACCCACTGCACCTATGACCGCGTCGTGCTGCACGGGGAGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGCCGGAGTCTGCTGCACACTGCGGCTGCCTTTGACTTCCCCACGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102559 TGCCGGAGTCTGCTGCACACTGCGGCTGCCTTTGACTTCCCCACGAGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCAGCTCACCGAGGAGGAG         GCCCTCAACATCAGTGACCACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102609 CCAGCTCACCGAGGAGGAGGTG...CAGGCCCTCAACATCAGTGACCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCCCGTGGAGGTGGAGCTGAAGCTGAGCCAGGCACACAGCGTCCAGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 102750 ACCCCGTGGAGGTGGAGCTGAAGCTGAGCCAGGCGCACAGCGTCCAGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCAGCCTCACTGTTCTGTTGCTGCCATCACTCCTGTCCCCTCAGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 102800 CTCAGCCTCACTGTTCTGTTGCTGCTATCACTCCTGTCCCCTCAGCTGTG

    950     .    :
    897 CCCTGCTGCC
        ||||||||||
 102850 CCCTGCTGCC