seq1 = pF1KE0133.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KE0133/gi568815575f_153882063.tfa (gi568815575f:153882063_154082845), 200783 bp

>pF1KE0133 783
>gi568815575f:153882063_154082845 (ChrX)

1-783  (100001-100783)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCCAGAGTGGGGGCAGGCCTTCGTGCACGTGGCCGTGGCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCCAGAGTGGGGGCAGGCCTTCGTGCACGTGGCCGTGGCCGGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTGTGCCGTGGCTGTGTTCACGGGCATTTTCGACAGTGTTTCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTGTGCCGTGGCTGTGTTCACGGGCATTTTCGACAGTGTTTCCGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTGGGCTATGAGCACTACGCCGAGGCGCCCGTGGCCGGCCTCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTGGGCTATGAGCACTACGCCGAGGCGCCCGTGGCCGGCCTCCCTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCTGGCCATGCCGTTCAACTCACTCGTGAACATGGCCTACACGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCTGGCCATGCCGTTCAACTCACTCGTGAACATGGCCTACACGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGGCTGTCGTGGCTGCACAGGGGCGGCGCGATGGGGCTGGGTCCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGGCTGTCGTGGCTGCACAGGGGCGGCGCGATGGGGCTGGGTCCCCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGAAGGACGTGTTCGCAGCCATGGCCCTGCTCTATGGCCCCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGAAGGACGTGTTCGCAGCCATGGCCCTGCTCTATGGCCCCGTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGCTGCGCCTGTGGACGCAGTGGCGCCGTGCCGCGGTGCTGGACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGGCTGCGCCTGTGGACGCAGTGGCGCCGTGCCGCGGTGCTGGACCAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCACACTGCCCATCTTTGCATGGCCCGTGGCCTGGTGCCTCTACCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCACACTGCCCATCTTTGCATGGCCCGTGGCCTGGTGCCTCTACCTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCGCGGCTGGCGGCCCTGGCTGTTCCTCTCTCTTGAGTGCGTCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCGCGGCTGGCGGCCCTGGCTGTTCCTCTCTCTTGAGTGCGTCTCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAGTTATGGCCTCGCTCTGCTGCATCCCCAGGGCTTCGAGGTCGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCAGTTATGGCCTCGCTCTGCTGCATCCCCAGGGCTTCGAGGTCGCACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGTGCTCACGTGGTGGCCGCTGTGGGGCAGGCGCTGCGCACCCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGTGCTCACGTGGTGGCCGCTGTGGGGCAGGCGCTGCGCACCCACAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTATGGCAGCACCACCTCGGCTACCTACTTAGCTTTGGGGGTGCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTATGGCAGCACCACCTCGGCTACCTACTTAGCTTTGGGGGTGCTCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGCCTGGGCTTTGTGGTCCTCAAGCTGTGTGACCATCAGCTCGCACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGCCTGGGCTTTGTGGTCCTCAAGCTGTGTGACCATCAGCTCGCACGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGTCTCTTCCAGTGCCTCACAGGCCACTTCTGGTCCAAGGTCTGTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGTCTCTTCCAGTGCCTCACAGGCCACTTCTGGTCCAAGGTCTGTGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCTCCAGTTCCACTTTGCGTTTTTGTTTCTGACGCATTTCAACACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCTCCAGTTCCACTTTGCGTTTTTGTTTCTGACGCATTTCAACACTCAC

    750     .    :    .    :    .    :
    751 CCAAGATTCCATCCCTCTGGCGGGAAGACGCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCAAGATTCCATCCCTCTGGCGGGAAGACGCGT