seq1 = pF1KE0131.tfa, 549 bp
seq2 = pF1KE0131/gi568815575f_151616120.tfa (gi568815575f:151616120_151822756), 206637 bp

>pF1KE0131 549
>gi568815575f:151616120_151822756 (ChrX)

1-106  (100001-100106)   100% ->
107-234  (101153-101280)   100% ->
235-341  (105276-105382)   100% ->
342-420  (105784-105862)   100% ->
421-549  (106509-106637)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGAGGCCCTCCCAACACCAAGGCGGAGATGGAAATGTCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGAGGCCCTCCCAACACCAAGGCGGAGATGGAAATGTCCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAGAACTGAATCATGGACGCCAAGGGGAAAACCAAGAGCACCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAAGAACTGAATCATGGACGCCAAGGGGAAAACCAAGAGCACCTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGCAG         AAATGATGGAGCTTGGATCTCGGTCCCGGGGTGCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGCAGGTG...TAGAAATGATGGAGCTTGGATCTCGGTCCCGGGGTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCAGAAGAAGCAGAAGTTGGAACAAAAAGCTGCTGGCTCTGCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101188 TCCCAGAAGAAGCAGAAGTTGGAACAAAAAGCTGCTGGCTCTGCTTCAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAACGAGTTTGGAATATGACTGCCACCCGACCCAAGAAAATG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101238 CAAACGAGTTTGGAATATGACTGCCACCCGACCCAAGAAAATGGTA...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    235   GGGTCCCAGCTGCCAAAGCCCAGAATGCTGAGAGAATCAGGCCATGGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105274 AGGGGTCCCAGCTGCCAAAGCCCAGAATGCTGAGAGAATCAGGCCATGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGCCCATCTCCAGGAGTACGCTGGCAATTTCCAAGGCATACGTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105324 GATGCCCATCTCCAGGAGTACGCTGGCAATTTCCAAGGCATACGTTTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTATGATCG         CAACCCAGGGACAGATGCAGTGGCGCAGACTA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105374 TTATGATCGGTA...CAGCAACCCAGGGACAGATGCAGTGGCGCAGACTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTGGAAGAGTTCAATGTACTGGAGATGGAAGTCATGAGAAGACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105816 GCCTGGAAGAGTTCAATGTACTGGAGATGGAAGTCATGAGAAGACAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421       CTGTATGCAGTCAACCGGCGTCTGCGCGCCCTGGAGGAACAGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105866 ...CAGCTGTATGCAGTCAACCGGCGTCTGCGCGCCCTGGAGGAACAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGCCACCTGGCGCCACAGGGAGACCCTGATCATCGCCGTGCTGGTGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106553 CGCCACCTGGCGCCACAGGGAGACCCTGATCATCGCCGTGCTGGTGTCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .
    515 CCAGCATTGCCAACCTGTGGCTGTGGATGAACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106603 CCAGCATTGCCAACCTGTGGCTGTGGATGAACCAG