seq1 = pF1KE0130.tfa, 1197 bp
seq2 = pF1KE0130/gi568815575f_152973063.tfa (gi568815575f:152973063_153174259), 201197 bp

>pF1KE0130 1197
>gi568815575f:152973063_153174259 (ChrX)

1-1197  (100001-101197)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTGACCATGCTGCAGGACTGGTGCCGGTGGATGGGGGTCAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGTGACCATGCTGCAGGACTGGTGCCGGTGGATGGGGGTCAACGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGCAGGGGCCTGCTCATCCTGGGCATCCCGGAGGACTGTGATGATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGCAGGGGCCTGCTCATCCTGGGCATCCCGGAGGACTGTGATGATGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATTCCAAGAGTCCCTCGAGGCTGCCCTGAGGCCTATGGGACACTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AATTCCAAGAGTCCCTCGAGGCTGCCCTGAGGCCTATGGGACACTTTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTAGGCAAAGCGTTTCGAGAGGAGGATAATGCCACCGCGGCCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTAGGCAAAGCGTTTCGAGAGGAGGATAATGCCACCGCGGCCCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGCTCGACCGGGAAGTCAACTATGCTTTGGTCCCCAGGGAAATCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGCTCGACCGGGAAGTCAACTATGCTTTGGTCCCCAGGGAAATCCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCACTGGGGGCCCGTGGAACGTGGTCTTTGTGCCCCGTTGCTCAGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCACTGGGGGCCCGTGGAACGTGGTCTTTGTGCCCCGTTGCTCAGGCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGTTTCTCGGTCTCGGTCGCGTGTTCCACTTCCCGGAGCAAGAGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGTTTCTCGGTCTCGGTCGCGTGTTCCACTTCCCGGAGCAAGAGGGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGTGGAGAGCGTGGCCGGCGCCCTGGGTGTGGGGCTGCGCAGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGTGGAGAGCGTGGCCGGCGCCCTGGGTGTGGGGCTGCGCAGGGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTGGCTGCGATCCATCGGTCAGGCGGTCCAGCCCTGGGTGGAGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTGGCTGCGATCCATCGGTCAGGCGGTCCAGCCCTGGGTGGAGGCCGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGTGCCAGAGCCTGGGCGTGTTTTCCGGGAGGGACCAGCCAGCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGTGCCAGAGCCTGGGCGTGTTTTCCGGGAGGGACCAGCCAGCCCCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGGAGTCCTTTGAGGTCTGGCTAGACCACACCACCGAAATGCTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGGAGTCCTTTGAGGTCTGGCTAGACCACACCACCGAAATGCTGCATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTGGCAGGGGGTCTCGGAAAGGGAGAGGAGGAGGAGGCTGCTGGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTGGCAGGGGGTCTCGGAAAGGGAGAGGAGGAGGAGGCTGCTGGAAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGCGTGGGACCGCCCTGCAGCTCGTGCACGCGCTCCTGGCGGAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGCGTGGGACCGCCCTGCAGCTCGTGCACGCGCTCCTGGCGGAGAACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGCCAGGACGGCGCAGGACTGTCTGGCGGCCCTGGCCCAGGTGTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGCCAGGACGGCGCAGGACTGTCTGGCGGCCCTGGCCCAGGTGTTTGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAACGAGTCCCAGGCGACCATCCGGGTGAAGTGTCTGACCGCTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAACGAGTCCCAGGCGACCATCCGGGTGAAGTGTCTGACCGCTCAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGTCAGGCGAGCGTCTCTCAGCTTTCGTGTTGCGGCTGGAAGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGTCAGGCGAGCGTCTCTCAGCTTTCGTGTTGCGGCTGGAAGTGCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCAGAAGGCCATGGAGAAGGAGGCCCTGGCCAGAGCATCCGCCGACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCAGAAGGCCATGGAGAAGGAGGCCCTGGCCAGAGCATCCGCCGACCGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCGCCTGAGGCAGATGCTCACCAGGGCCCACCTTACTGAGCCTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCGCCTGAGGCAGATGCTCACCAGGGCCCACCTTACTGAGCCTCTGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAAGCACTGAGGAAGCTGAGAATGGCCGGGAGGTCTCCAAGTTTCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAAGCACTGAGGAAGCTGAGAATGGCCGGGAGGTCTCCAAGTTTCTTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATGCTGGGGCTCGTTCGGGAGTCTGAGGCATGGGAGGCCAGTCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATGCTGGGGCTCGTTCGGGAGTCTGAGGCATGGGAGGCCAGTCTAGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGAGCGTGAGAGCCCAGACACAGGAAGGGGCCGGTGCCCGGGCTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGAGCGTGAGAGCCCAGACACAGGAAGGGGCCGGTGCCCGGGCTGGTGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGGCTGTTGCCAGAGCCAGCACTAAAGTAGAGGCGGTCCCAGGAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGGCTGTTGCCAGAGCCAGCACTAAAGTAGAGGCGGTCCCAGGAGGTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGGTCGGGAGCCAGAGGGCCTCCTCCAGGCAGGAGGCCAGGAGGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGGTCGGGAGCCAGAGGGCCTCCTCCAGGCAGGAGGCCAGGAGGCTGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1151 AGCTCCTCCAGGAGGGGCTCAAGCCCGTCCTGGAGGAATGTGATAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCTCCTCCAGGAGGGGCTCAAGCCCGTCCTGGAGGAATGTGATAAC