seq1 = pF1KE0128.tfa, 303 bp
seq2 = pF1KE0128/gi568815575f_151297309.tfa (gi568815575f:151297309_151505055), 207747 bp

>pF1KE0128 303
>gi568815575f:151297309_151505055 (ChrX)

1-53  (100001-100053)   100% ->
54-163  (106323-106432)   100% ->
164-303  (107608-107747)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGCCCGGATAAGGCGGCGCTGAACGCACTGCAGCCTCCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGCCCGGATAAGGCGGCGCTGAACGCACTGCAGCCTCCTGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAG         AAATGAAAGCTCATTAGCATCTACACTGAAGACGCTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGTA...CAGAAATGAAAGCTCATTAGCATCTACACTGAAGACGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTTCTTCACAGCTTTAATGATCACTGTTCCTATTGGGTTATATTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106361 TGTTCTTCACAGCTTTAATGATCACTGTTCCTATTGGGTTATATTTCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTAAATCTTACATATTTGAAG         GCGCCCTTGGGATGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106411 ACTAAATCTTACATATTTGAAGGTA...TAGGCGCCCTTGGGATGTCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAGGGACAGCTATTTTTACGCTGCTATTGTTGCAGTGGTCGCCGTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107627 TAGGGACAGCTATTTTTACGCTGCTATTGTTGCAGTGGTCGCCGTCCATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTGCTGGCCCTCTTTGTGTATGTGGCCTGGAATGAAGGCTCACGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107677 TGGTGCTGGCCCTCTTTGTGTATGTGGCCTGGAATGAAGGCTCACGACAG

    300     .    :    .    :
    283 TGGCGTGAAGGCAAACAGGAT
        |||||||||||||||||||||
 107727 TGGCGTGAAGGCAAACAGGAT