seq1 = pF1KE0121.tfa, 381 bp
seq2 = pF1KE0121/gi568815597r_167819979.tfa (gi568815597r:167819979_168035841), 215863 bp

>pF1KE0121 381
>gi568815597r:167819979_168035841 (Chr1)

(complement)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-150  (111305-111345)   100% ->
151-235  (115211-115295)   100% ->
236-347  (115752-115863)   100% ->
348-381  (117483-117516)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCCGCCGGTGCCCGAGGCCTGCGGGCCACCTACCACCGGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCCGCCGGTGCCCGAGGCCTGCGGGCCACCTACCACCGGCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGATAAAGTGGAGCTGATGCTGCCCGAGAAATTGAGGCCGTTGTACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGATAAAGTGGAGCTGATGCTGCCCGAGAAATTGAGGCCGTTGTACAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCCAGCAG         GTCCCAGAACAGTTTTCTTCTGGGCTCCAATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCCAGCAGGTA...CAGGTCCCAGAACAGTTTTCTTCTGGGCTCCAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGAAATGG         GGGTTGGTGTGTGCTGGATTGGCTGATATGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111337 ATGAAATGGGTA...TAGGGGTTGGTGTGTGCTGGATTGGCTGATATGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGACCTGCAGAAAAACTTAGCACAGCTCAATCTGCTGTTTTGATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115243 CAGACCTGCAGAAAAACTTAGCACAGCTCAATCTGCTGTTTTGATGGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAG         GGTTTATTTGGTCAAGATACTCACTTGTAATTATTCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115293 CAGGTA...CAGGGTTTATTTGGTCAAGATACTCACTTGTAATTATTCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAAAATTGGAGTCTGTTTGCTGTTAATTTCTTTGTGGGGGCAGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115790 AAAAATTGGAGTCTGTTTGCTGTTAATTTCTTTGTGGGGGCAGCAGGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTCTCAGCTTTTTCGTATTTGGAG         ATATAACCAAGAACTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 115840 CTCTCAGCTTTTTCGTATTTGGAGGTA...TAGATATAACCAAGAACTAA

    400     .    :    .
    365 AAGCTAAAGCACACAAA
        |||||||||||||||||
 117500 AAGCTAAAGCACACAAA