seq1 = pF1KE0120.tfa, 861 bp
seq2 = pF1KE0120/gi568815582r_4697463.tfa (gi568815582r:4697463_4902571), 205109 bp

>pF1KE0120 861
>gi568815582r:4697463_4902571 (Chr16)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-117  (100119-100190)   100% ->
118-200  (100987-101069)   100% ->
201-255  (101251-101305)   100% ->
256-336  (101994-102074)   100% ->
337-432  (102791-102886)   100% ->
433-531  (103905-104003)   100% ->
532-645  (104388-104501)   100% ->
646-695  (104585-104634)   100% ->
696-822  (104732-104858)   99% ->
823-861  (105071-105109)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCGTGATGGCAGCGACGGCGGCGGAGCGGGCGGTGCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGGCCACCGTGATGGCAGCGACGGCGGCGGAGCGGGCGGTGCTGGTA..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     GAGGAGGAGTTCCGCTGGCTGCTGCACGACGAGGTGCACGCTGTGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGGAGGAGGAGTTCCGCTGGCTGCTGCACGACGAGGTGCACGCTGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAGCAGCTGCAGGACATCCTCAAG         GAGGCCTCTCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100165 TGAAGCAGCTGCAGGACATCCTCAAGGTA...CAGGAGGCCTCTCTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTCACTCTGCCGGGCTCCGGCACTGAGGGGCCCGCCAAGCAAGAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 TTCACTCTGCCGGGCTCCGGCACTGAGGGGCCCGCCAAGCAAGAGAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATCCTAGGCAGCTGTGG         CACAGACCAGGTGAAGGGTGTGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101052 CATCCTAGGCAGCTGTGGGTG...CAGCACAGACCAGGTGAAGGGTGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGACTCTGCAGGGGGATGCCCTCAGCCAGGCG         GATGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101274 TGACTCTGCAGGGGGATGCCCTCAGCCAGGCGGTG...CAGGATGTGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CTGAAGATGCCCCGGAACAACCAGCTGCTGCACTTCGCCTTCCGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102003 CTGAAGATGCCCCGGAACAACCAGCTGCTGCACTTCGCCTTCCGGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAAGCAGTGGAAGCTGCAGCAG         ATCCAGGATGCCAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102053 CAAGCAGTGGAAGCTGCAGCAGGTG...CAGATCCAGGATGCCAGAAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 ATGTGAGCCAAGCCATTTACCTGCTTACCAGCCGGGACCAGAGCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102810 ATGTGAGCCAAGCCATTTACCTGCTTACCAGCCGGGACCAGAGCTACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTCAAGACGGGCGCTGAGGTCCTCAAG         CTGATGGACGCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102860 TTCAAGACGGGCGCTGAGGTCCTCAAGGTG...CAGCTGATGGACGCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GATGCTGCAGCTGACCAGAGCCCGAAACCGGCTCACCACCCCCGCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103919 GATGCTGCAGCTGACCAGAGCCCGAAACCGGCTCACCACCCCCGCCACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TCACCCTCCCCGAGATCGCCGCCAGCGGCCTCACG         CGGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103969 TCACCCTCCCCGAGATCGCCGCCAGCGGCCTCACGGTC...CAGCGGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 TTCGCCCCTGCCCTGCCGTCCGACCTGCTGGTCAACGTCTACATCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104394 TTCGCCCCTGCCCTGCCGTCCGACCTGCTGGTCAACGTCTACATCAACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CAACAAGCTCTGCCTCACGGTGTACCAGCTGCATGCCCTGCAGCCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104444 CAACAAGCTCTGCCTCACGGTGTACCAGCTGCATGCCCTGCAGCCCAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CCACCAAG         AACTTCCGCCCAGCTGGGGGCGCGGTGCTGCAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104494 CCACCAAGGTG...TAGAACTTCCGCCCAGCTGGGGGCGCGGTGCTGCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AGCCCTGGGGCCATGTT         CGAGTGGGGCTCTCAGCGCCTGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104618 AGCCCTGGGGCCATGTTGTA...CAGCGAGTGGGGCTCTCAGCGCCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GGTGAGCCACGTGCACAAAGTGGAGTGCGTGATCCCCTGGCTCAACGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104756 GGTGAGCCACGTGCACAAAGTGGAGTGCGTGATCCCCTGGCTCAACGACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CCCTGGTCTACTTCACCGTCTCCCTGCAGCTCTGCCAGCAGCTTAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 104806 CCCTGGTCTACTTCACCGTCTCCCTGCAGCTCTGCCAGCAGCTCAAGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AAG         ATCTCCGTGTTCTCCAGCTACTGGAGCTACAGACCCTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104856 AAGGTG...CAGATCTCCGTGTTCTCCAGCTACTGGAGCTACAGACCCTT

    950 
    861 C
        |
 105109 C