seq1 = pF1KE0118.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KE0118/gi568815587f_85550256.tfa (gi568815587f:85550256_85756498), 206243 bp

>pF1KE0118 585
>gi568815587f:85550256_85756498 (Chr11)

1-86  (100001-100086)   100% ->
87-280  (103808-104001)   100% ->
281-395  (105339-105453)   100% ->
396-585  (106054-106243)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAATCATAAATCCAATAATAAGGAAAACATAACAATTGTTGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAATCATAAATCCAATAATAAGGAAAACATAACAATTGTTGATAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCAGAAAAATTAACCAGCTTCCAGAAGCAGAAAG         GAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100051 ATCCAGAAAAATTAACCAGCTTCCAGAAGCAGAAAGGTA...CAGGAATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TACTTGAAAATGGATCGGTTTATGTTGGATTAAATGCTGCTCTTTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103813 TACTTGAAAATGGATCGGTTTATGTTGGATTAAATGCTGCTCTTTGTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCATAGCAAACAGTCTTTTTCGACGCATCTTGAATGTGACAAAGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103863 CTCATAGCAAACAGTCTTTTTCGACGCATCTTGAATGTGACAAAGGCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATAGCTGCTGGCTTACCAATGGCAGGGATACCTTTTCTTACAACAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103913 CATAGCTGCTGGCTTACCAATGGCAGGGATACCTTTTCTTACAACAGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAACTTACAGATGTTTTGTAAGTTTTCCTTTGAATACAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103963 TAACTTACAGATGTTTTGTAAGTTTTCCTTTGAATACAGGTA...TAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATTTGGATTGTGAAACCTGTACCATAACACGGAGTGGACTGACTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105341 GATTTGGATTGTGAAACCTGTACCATAACACGGAGTGGACTGACTGGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTTATTGGTGGTCTATACCCTGTTTTCTTGGCTATACCTGTAAATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105391 TGTTATTGGTGGTCTATACCCTGTTTTCTTGGCTATACCTGTAAATGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCTAGCAGCCAG         GTATCAATCAGCTCTGTTACCACACAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105441 GTCTAGCAGCCAGGTA...CAGGTATCAATCAGCTCTGTTACCACACAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGAACATCTTAAGTTACTGGATTAGAACTTCTAAGCCTGTCTTTAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106082 GGGAACATCTTAAGTTACTGGATTAGAACTTCTAAGCCTGTCTTTAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGTTATTTCCTATTTTGCTCCAGACTATGTTTTCAGCATACCTTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106132 GATGTTATTTCCTATTTTGCTCCAGACTATGTTTTCAGCATACCTTGGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGAACAATATAAACTACTTATAAAGGCCCTTCAGTTATCTGAACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106182 CTGAACAATATAAACTACTTATAAAGGCCCTTCAGTTATCTGAACCTGGC

    600     .    :
    574 AAAGAAATTCAC
        ||||||||||||
 106232 AAAGAAATTCAC