seq1 = pF1KE0112.tfa, 585 bp
seq2 = pF1KE0112/gi568815597r_32234600.tfa (gi568815597r:32234600_32436033), 201434 bp

>pF1KE0112 585
>gi568815597r:32234600_32436033 (Chr1)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-585  (100937-101434)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAGCCAGAGCTCCAAGGCTCCCCGGGGCGACGTGACCGCCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAGCCAGAGCTCCAAGGCTCCCCGGGGCGACGTGACCGCCGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAGCAGGCGCTTCCCCCGCGAAGGCCAACGGCCAG         GAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 GGCAGCAGGCGCTTCCCCCGCGAAGGCCAACGGCCAGGTG...CAGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGGCCACGTGAAAAGCAATGGAGACTTATCCCCCAAGGGTGAAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100941 ATGGCCACGTGAAAAGCAATGGAGACTTATCCCCCAAGGGTGAAGGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCGCCCCCTGTGAACGGAACAGATGAGGCAGCCGGGGCCACTGGCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100991 TCGCCCCCTGTGAACGGAACAGATGAGGCAGCCGGGGCCACTGGCGATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCGAGCCAGCACCCCCTAGCCAGGGTGCTGAGGCCAAGGGGGAGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101041 CATCGAGCCAGCACCCCCTAGCCAGGGTGCTGAGGCCAAGGGGGAGGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCCAAGGAGACCCCCAAGAAGAAGAAGAAATTCTCTTTCAAGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101091 CCCCCAAGGAGACCCCCAAGAAGAAGAAGAAATTCTCTTTCAAGAAGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCAAATTGAGCGGCCTGTCCTTCAAGAGAAATCGGAAGGAGGGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101141 TTCAAATTGAGCGGCCTGTCCTTCAAGAGAAATCGGAAGGAGGGTGGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGATTCTTCTGCCTCCTCACCCACAGAGGAAGAGCAGGAGCAGGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101191 TGATTCTTCTGCCTCCTCACCCACAGAGGAAGAGCAGGAGCAGGGGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCGGTGCCTGCAGCGACGAGGGCACTGCTCAGGAAGGGAAGGCCGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101241 TCGGTGCCTGCAGCGACGAGGGCACTGCTCAGGAAGGGAAGGCCGCAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCCCTGAGAGCCAGGAACCCCAGGCCAAGGGGGCAGAGGCTAGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101291 ACCCCTGAGAGCCAGGAACCCCAGGCCAAGGGGGCAGAGGCTAGTGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTCAGAAGAAGAGGCAGGGCCCCAGGCTACAGAGCCATCCACTCCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101341 CTCAGAAGAAGAGGCAGGGCCCCAGGCTACAGAGCCATCCACTCCCTCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGCCGGAGAGTGGCCCTACACCAGCCAGCGCTGAGCAGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101391 GGCCGGAGAGTGGCCCTACACCAGCCAGCGCTGAGCAGAATGAG