seq1 = pF1KE0109.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE0109/gi568815581f_48793418.tfa (gi568815581f:48793418_48995766), 202349 bp

>pF1KE0109 408
>gi568815581f:48793418_48995766 (Chr17)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-117  (100955-101032)   100% ->
118-296  (101739-101917)   100% ->
297-408  (102238-102349)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGACCGCCGGGGCATTATTCATTTCTCCAGCTCTG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGCAGACCGCCGGGGCATTATTCATTTCTCCAGCTCTGGTA...CAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCGCTGTTGTACCAGGGGTCTAATCAGGCCTGTGTCTGCCTCCTTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100957 CCGCTGTTGTACCAGGGGTCTAATCAGGCCTGTGTCTGCCTCCTTCTTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATAGCCCAGTGAATTCATCTAAACAG         CCTTCCTACAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101007 ATAGCCCAGTGAATTCATCTAAACAGGTA...TAGCCTTCCTACAGCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTCCCACTCCAGGTGGCCAGACGGGAGTTCCAGACCAGTGTTGTCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101754 TTCCCACTCCAGGTGGCCAGACGGGAGTTCCAGACCAGTGTTGTCTCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACATTGACACAGCAGCCAAGTTTATTGGTGCTGGGGCAGCCACAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101804 GGACATTGACACAGCAGCCAAGTTTATTGGTGCTGGGGCAGCCACAGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGTGGCTGGTTCAGGGGCTGGCATTGGAACCGTGTTTGGCAGCTTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101854 GTGTGGCTGGTTCAGGGGCTGGCATTGGAACCGTGTTTGGCAGCTTGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTGGCTATGCCAG         GAACCCGTCTCTCAAGCAGCAGCTCTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101904 ATTGGCTATGCCAGGTA...CAGGAACCCGTCTCTCAAGCAGCAGCTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTCCTATGCCATTCTTGGCTTTGCCCTGTCTGAGGCCATGGGGCTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 CTCCTATGCCATTCTTGGCTTTGCCCTGTCTGAGGCCATGGGGCTTTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .
    374 GTTTGATGGTCGCCTTCCTCATCCTCTTCGCCATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 GTTTGATGGTCGCCTTCCTCATCCTCTTCGCCATG