seq1 = pF1KE0107.tfa, 849 bp
seq2 = pF1KE0107/gi568815583r_52024471.tfa (gi568815583r:52024471_52279879), 255409 bp

>pF1KE0107 849
>gi568815583r:52024471_52279879 (Chr15)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-249  (125804-125940)   100% ->
250-291  (129955-129996)   100% ->
292-435  (144124-144267)   100% ->
436-527  (146411-146502)   100% ->
528-576  (151636-151684)   100% ->
577-673  (153836-153932)   100% ->
674-842  (155241-155409)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACCGAGGGGCTGCACGAGAACGAGACGCTGGCGTCGCTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACCGAGGGGCTGCACGAGAACGAGACGCTGGCGTCGCTGAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGCCGAGAGCCTCAAGGGCAAGCTGGAGGAGGAGCGAGCCAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGGCCGAGAGCCTCAAGGGCAAGCTGGAGGAGGAGCGAGCCAAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGATGTGGAGC         TGCACCAGGTGGCGGAGCGGGTGGAGGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGATGTGGAGCGTG...CAGTGCACCAGGTGGCGGAGCGGGTGGAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGGGCAGTTTGTCATGAAGACCAGAAGGACCCTCAAAGGCCACGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125833 CTGGGGCAGTTTGTCATGAAGACCAGAAGGACCCTCAAAGGCCACGGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAAGTCCTGTGCATGGACTGGTGCAAAGATAAGAGGAGGATCGTGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125883 CAAAGTCCTGTGCATGGACTGGTGCAAAGATAAGAGGAGGATCGTGAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGTCACAG         GATGGGAAGGTGATCGTGTGGGATTCCTTCACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 125933 CGTCACAGGTA...CAGGATGGGAAGGTGATCGTGTGGGATTCCTTCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAAACAAG         ATCCTGACAGCGAGCGGCGATGGCACATGTGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 129988 ACAAACAAGGTG...CAGATCCTGACAGCGAGCGGCGATGGCACATGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTGTGGGACGTGGAGAGCGGGCAGCTGCTGCAGAGCTTCCACGGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144156 CCTGTGGGACGTGGAGAGCGGGCAGCTGCTGCAGAGCTTCCACGGACATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGCTGACGTCCTCTGCTTGGACCTGGCCCCCTCAGAAACTGGAAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144206 GGGCTGACGTCCTCTGCTTGGACCTGGCCCCCTCAGAAACTGGAAACACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCGTGTCTGGG         GGATGTGACAAGAAAGCCATGGTGTGGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 144256 TTCGTGTCTGGGGTA...TAGGGATGTGACAAGAAAGCCATGGTGTGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGCGCTCCGGCCAGTGCGTGCAGGCCTTTGAAACACATGAATCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146440 CATGCGCTCCGGCCAGTGCGTGCAGGCCTTTGAAACACATGAATCTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAACAGTGTCCG         GTACTACCCCAGTGGAGATGCCTTTGCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 146490 TCAACAGTGTCCGGTC...CAGGTACTACCCCAGTGGAGATGCCTTTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TCAGGGTCAGATGACGCTACG         TGTCGCCTCTATGACCTGCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 151664 TCAGGGTCAGATGACGCTACGGTA...CAGTGTCGCCTCTATGACCTGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGCAGATAGGGAGGTTGCCATCTATTCCAAAGAAAGCATCATATTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153856 GGCAGATAGGGAGGTTGCCATCTATTCCAAAGAAAGCATCATATTTGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CATCCAGCGTGGACTTCTCCCTCAGTG         GTCGCCTGCTGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 153906 CATCCAGCGTGGACTTCTCCCTCAGTGGTA...AAGGTCGCCTGCTGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCTGGATACAATGATTACACTATCAACGTCTGGGATGTTCTCAAAGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155255 GCTGGATACAATGATTACACTATCAACGTCTGGGATGTTCTCAAAGGGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCGGGTCTCCATCCTGTTTGGACATGAAAACCGCGTTAGCACTCTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155305 CCGGGTCTCCATCCTGTTTGGACATGAAAACCGCGTTAGCACTCTACGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTTCCCCCGATGGGACTGCTTTCTGCTCTGGATCATGGGATCATACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155355 TTTCCCCCGATGGGACTGCTTTCTGCTCTGGATCATGGGATCATACCCTC

    900     .
    838 AGAGT
        |||||
 155405 AGAGT