seq1 = pF1KE0106.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KE0106/gi568815586r_2727210.tfa (gi568815586r:2727210_2934983), 207774 bp

>pF1KE0106 843
>gi568815586r:2727210_2934983 (Chr12)

(complement)

1-342  (100001-100342)   100% ->
343-495  (104124-104276)   100% ->
496-578  (106570-106652)   100% ->
579-700  (106937-107058)   100% ->
701-753  (107307-107359)   100% ->
754-843  (107685-107774)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTATTTATTTTTCCTCTTTCCCTCCCGTGGAGACCCTCCTGTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTATTTATTTTTCCTCTTTCCCTCCCGTGGAGACCCTCCTGTTGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGAGCTGCAGCACGGGACAGAGACAGGCAGGAAGAAGCAGAGAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGAGCTGCAGCACGGGACAGAGACAGGCAGGAAGAAGCAGAGAGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGTGACGCCCCCACCGAGCAGCCCCTGGCCCACTCCTCCAGCAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGTGACGCCCCCACCGAGCAGCCCCTGGCCCACTCCTCCAGCAGGGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGAGCACCAAGCAGGAGGCCAGGAGAGATGAGGGAGAAGCCAGGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGAGCACCAAGCAGGAGGCCAGGAGAGATGAGGGAGAAGCCAGGACGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGGCAGGAGGCACAGCTTCGAGACCGAGCCCACCTGAGCCAGCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGGCAGGAGGCACAGCTTCGAGACCGAGCCCACCTGAGCCAGCAGCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCTCAAACAGGCCACCCAGTTCCTGCACAAGGACTCGGCCGACCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCTCAAACAGGCCACCCAGTTCCTGCACAAGGACTCGGCCGACCTGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCTGGACAGCCTCAAGAGGCTCGGCACCTCCAAGGACTTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100301 CCGCTGGACAGCCTCAAGAGGCTCGGCACCTCCAAGGACTTGGTG...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    343  CAGCCGCGCAGTGTGATCCAAAGACGCCTGGTGGAGGGAAACCCGAATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104123 GCAGCCGCGCAGTGTGATCCAAAGACGCCTGGTGGAGGGAAACCCGAATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGCTTCAGGGGGAGCCTCCCCGGATGCAGGACCTGATTCATGGCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104173 GGCTTCAGGGGGAGCCTCCCCGGATGCAGGACCTGATTCATGGCCAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGCAGGAGGAAGACCAGCAGGACAGAGATTCCAGCTCTTCTGGTCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104223 AGCAGGAGGAAGACCAGCAGGACAGAGATTCCAGCTCTTCTGGTCAACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAAG         TGCCAGGACCAGCTGCTTAGAGTGGCCGTTGACACAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104273 CAAGGTG...TAGTGCCAGGACCAGCTGCTTAGAGTGGCCGTTGACACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCACCCAATACAATCGGATCTCTGCTGGATGTCTCAGCCGCCTGGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106607 GCACCCAATACAATCGGATCTCTGCTGGATGTCTCAGCCGCCTGGGGTA.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579      GTTAGAGAAAAGGGTCCTAAAAGCCTCAGCTGGGGACCTGGCCCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106657 ..CAGGTTAGAGAAAAGGGTCCTAAAAGCCTCAGCTGGGGACCTGGCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGGGCCCCCAACCCAGGTGGAGCAGTTGGAGCTACAGCTGGGGCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106982 TGGGCCCCCAACCCAGGTGGAGCAGTTGGAGCTACAGCTGGGGCAGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGTGGTGTGCTCGGCACAGGTGGTGG         ATGCTGAGAGTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107032 CTGTGGTGTGCTCGGCACAGGTGGTGGGTA...TAGATGCTGAGAGTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAATTCTGCCTGGGCCTGCAGACTCTGCTTTCTCTCAAG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 107321 GAATTCTGCCTGGGCCTGCAGACTCTGCTTTCTCTCAAGGTA...CAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGCATCGACCTGGAGCACGGAGTGCTGCGGCTGAAAGCCCCGTTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107687 CTGCATCGACCTGGAGCACGGAGTGCTGCGGCTGAAAGCCCCGTTCTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .
    806 AGCTACCCTTCCTGCCTTTGTACCAAGAGCCTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107737 AGCTACCCTTCCTGCCTTTGTACCAAGAGCCTGGCCAG