seq1 = pF1KE0103.tfa, 1200 bp seq2 = pF1KE0103/gi568815595f_14029412.tfa (gi568815595f:14029412_14241792), 212381 bp >pF1KE0103 1200 >gi568815595f:14029412_14241792 (Chr3) 13-162 (100001-100150) 100% -> 163-297 (101411-101545) 99% -> 298-392 (102169-102263) 100% -> 393-442 (103135-103184) 100% -> 443-512 (103455-103524) 98% -> 513-583 (104328-104398) 98% -> 584-705 (105359-105480) 100% -> 706-780 (105747-105821) 100% -> 781-882 (106396-106497) 100% -> 883-1000 (109769-109886) 100% -> 1001-1200 (112182-112381) 100% 0 . : . : . : . : . : 13 TATTCCAGTACCAGTACCCGGAGAGAACATGTCAAAGTTAAAACCAGCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 TATTCCAGTACCAGTACCCGGAGAGAACATGTCAAAGTTAAAACCAGCTC 50 . : . : . : . : . : 63 CCAGCCAGGCTTCCTGGAACGGCTGAGCGAGACCTCGGGTGGGATGTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 CCAGCCAGGCTTCCTGGAACGGCTGAGCGAGACCTCGGGTGGGATGTTTG 100 . : . : . : . : . : 113 TGGGGCTCATGGCCTTCCTGCTCTCCTTCTACCTAATTTTCACCAATGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 TGGGGCTCATGGCCTTCCTGCTCTCCTTCTACCTAATTTTCACCAATGAG 150 . : . : . : . : . : 163 GGCCGCGCATTGAAGACGGCAACCTCATTGGCTGAGGGGCT >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100151 GTA...CAGGGCCGCGCATTGAAGACGGCAACCTCATTGGCTGAGGGGCT 200 . : . : . : . : . : 204 CTCGCTTGTGGTGTCTCCTGACAGCATCCACAGTGTGGCTCCGGAGAATG |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 101452 CTCGCTTGTGGTGTCTCCCGACAGCATCCACAGTGTGGCTCCGGAGAATG 250 . : . : . : . : . : 254 AAGGAAGGCTGGTGCACATCATTGGCGCCTTACGGACATCCAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 101502 AAGGAAGGCTGGTGCACATCATTGGCGCCTTACGGACATCCAAGGTA... 300 . : . : . : . : . : 298 CTTTTGTCTGATCCAAACTATGGGGTCCATCTTCCGGCTGTGAAACT >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102166 AAGCTTTTGTCTGATCCAAACTATGGGGTCCATCTTCCGGCTGTGAAACT 350 . : . : . : . : . : 345 GCGGAGGCACGTGGAGATGTACCAATGGGTAGAAACTGAGGAGTCCAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 102216 GCGGAGGCACGTGGAGATGTACCAATGGGTAGAAACTGAGGAGTCCAGGT 400 . : . : . : . : . : 393 GGAGTACACCGAGGATGGGCAGGTGAAGAAGGAGACGAGGTAT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102266 G...CAGGGAGTACACCGAGGATGGGCAGGTGAAGAAGGAGACGAGGTAT 450 . : . : . : . : . : 436 TCCTACA ACACTGAATGGAGGTCAGAAATCATCAACAGCAA |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 103178 TCCTACAGTG...CAGACACTGAATGGAGGTCAGAAATCATCAACAGCAA 500 . : . : . : . : . : 477 AAACTTCGACCGAGAGATTGGCCACAATAACCCCAG TGCCA ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||>>>...>>>||||| 103489 AAACTTCGACCGAGAGATTGGCCACAAAAACCCCAGGTG...CAGTGCCA 550 . : . : . : . : . : 518 TGGCAGTGGAGTCATTCACGGCAACAGCCCCCTTTGTCCAAATTGGCAGG |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 104333 TGGCAGTGGAGTCATTCATGGCAACAGCCCCCTTTGTCCAAATTGGCAGG 600 . : . : . : . : . : 568 TTTTTCCTCTCGTCAG GCCTCATCGACAAAGTCGACAACTT ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| 104383 TTTTTCCTCTCGTCAGGTA...CAGGCCTCATCGACAAAGTCGACAACTT 650 . : . : . : . : . : 609 CAAGTCCCTGAGCCTATCCAAGCTGGAGGACCCTCATGTGGACATCATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105384 CAAGTCCCTGAGCCTATCCAAGCTGGAGGACCCTCATGTGGACATCATTC 700 . : . : . : . : . : 659 GCCGTGGAGACTTTTTCTACCACAGCGAAAATCCCAAGTATCCAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 105434 GCCGTGGAGACTTTTTCTACCACAGCGAAAATCCCAAGTATCCAGAGGTG 750 . : . : . : . : . : 706 GTGGGAGACTTGCGTGTCTCCTTTTCCTATGCTGGACTGAGCGG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105484 ...CAGGTGGGAGACTTGCGTGTCTCCTTTTCCTATGCTGGACTGAGCGG 800 . : . : . : . : . : 750 CGATGACCCTGACCTGGGCCCAGCTCACGTG GTCACTGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 105791 CGATGACCCTGACCTGGGCCCAGCTCACGTGGTA...CAGGTCACTGTGA 850 . : . : . : . : . : 791 TTGCCCGGCAGCGGGGTGACCAGCTAGTCCCATTCTCCACCAAGTCTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106406 TTGCCCGGCAGCGGGGTGACCAGCTAGTCCCATTCTCCACCAAGTCTGGG 900 . : . : . : . : . : 841 GATACCTTACTGCTCCTGCACCACGGGGACTTCTCAGCAGAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 106456 GATACCTTACTGCTCCTGCACCACGGGGACTTCTCAGCAGAGGTG...CA 950 . : . : . : . : . : 883 GAGGTGTTTCATAGAGAACTAAGGAGCAACTCCATGAAGACCTGGGGCC >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109768 GGAGGTGTTTCATAGAGAACTAAGGAGCAACTCCATGAAGACCTGGGGCC 1000 . : . : . : . : . : 932 TGCGGGCAGCTGGCTGGATGGCCATGTTCATGGGCCTCAACCTTATGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109818 TGCGGGCAGCTGGCTGGATGGCCATGTTCATGGGCCTCAACCTTATGACA 1050 . : . : . : . : . : 982 CGGATCCTCTACACCTTGG TGGACTGGTTTCCTGTTTTCCG |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 109868 CGGATCCTCTACACCTTGGGTA...CAGTGGACTGGTTTCCTGTTTTCCG 1100 . : . : . : . : . : 1023 AGACCTGGTCAACATTGGCCTGAAAGCCTTTGCCTTCTGTGTGGCCACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112204 AGACCTGGTCAACATTGGCCTGAAAGCCTTTGCCTTCTGTGTGGCCACCT 1150 . : . : . : . : . : 1073 CGCTGACCCTGCTGACCGTGGCGGCTGGCTGGCTCTTCTACCGACCCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112254 CGCTGACCCTGCTGACCGTGGCGGCTGGCTGGCTCTTCTACCGACCCCTG 1200 . : . : . : . : . : 1123 TGGGCCCTCCTCATTGCCGGCCTGGCCCTTGTGCCCATCCTTGTTGCTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 112304 TGGGCCCTCCTCATTGCCGGCCTGGCCCTTGTGCCCATCCTTGTTGCTCG 1250 . : . : . 1173 GACACGGGTGCCAGCCAAAAAGTTGGAG |||||||||||||||||||||||||||| 112354 GACACGGGTGCCAGCCAAAAAGTTGGAG