seq1 = pF1KE0098.tfa, 1098 bp
seq2 = pF1KE0098/gi568815586r_54270259.tfa (gi568815586r:54270259_54484514), 214256 bp

>pF1KE0098 1098
>gi568815586r:54270259_54484514 (Chr12)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-198  (108561-108671)   100% ->
199-361  (110380-110542)   99% ->
362-604  (112800-113042)   100% ->
605-774  (113419-113588)   100% ->
775-870  (113794-113889)   100% ->
871-1098  (114029-114256)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCCCCCACTGGACCTCAAGCAGATCCTGCCCTTCCCACTCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCCCCCACTGGACCTCAAGCAGATCCTGCCCTTCCCACTCGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCCCTACCCTTGGCCTCTTCAGCAACTACAGCACC         ATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 AGCCCCTACCCTTGGCCTCTTCAGCAACTACAGCACCGTA...CAGATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCCTGTGCAGAAGGCTGTGCTCTCCCACACTTTTGGGGGACCCTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108565 ACCCTGTGCAGAAGGCTGTGCTCTCCCACACTTTTGGGGGACCCTTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGACCAAGCGGCCCGTCATTTCCTGTAATATCTGTCAAATCCGCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108615 AAGACCAAGCGGCCCGTCATTTCCTGTAATATCTGTCAAATCCGCTTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCTCAG         AGCCAGGCTGAGGCGCACTACAAAGGTAATCGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108665 TTCTCAGGTA...AAGAGCCAGGCTGAGGCGCACTACAAAGGTAATCGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACGCCCGACGAGTCAAAGGCATTGAGGCTGCCAAGACCAGAGGCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110414 ACGCCCGACGAGTCAAAGGCATTGAGGCTGCCAAGACCAGAGGCAGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTGGCGTCCGAGAACCTGGAGATCCAGCTCCCCCAGGCAGCACCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 110464 CCTGGCGTCCGAGAACCTGGAGACCCAGCTCCCCCAGGCAGCACCCCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAATGGGGATGGTGTAGCACCCCGTCCAG         TTTCCATGGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110514 AAATGGGGATGGTGTAGCACCCCGTCCAGGTG...CAGTTTCCATGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGGACTGGGGCCAGCCCCAGGATCCCCAGAGAAACAGCCTGGCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112812 ATGGACTGGGGCCAGCCCCAGGATCCCCAGAGAAACAGCCTGGCTCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCCCTCCCAGCATTCCGGAGACTGGTCAGGGTGTAACCAAGGGTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112862 TCCCCTCCCAGCATTCCGGAGACTGGTCAGGGTGTAACCAAGGGTGAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGGACTCCAGCCCCGGCTTCCTTGCCTGGGGGTAGCAAGGAAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112912 GGGGACTCCAGCCCCGGCTTCCTTGCCTGGGGGTAGCAAGGAAGAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAAGCCAAGCGGCTGCTCTACTGTGCTCTGTGCAAGGTGGCTGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112962 AGAAAGCCAAGCGGCTGCTCTACTGTGCTCTGTGCAAGGTGGCTGTGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCCTGTCCCAGCTTGAGGCACATAACAAAG         GTACTAAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 113012 TCCCTGTCCCAGCTTGAGGCACATAACAAAGGTA...CAGGTACTAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAGACAATTCTGGAGGCCCGAAGTGGGCTCGGGCCCATCAAAGCTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113429 CAAGACAATTCTGGAGGCCCGAAGTGGGCTCGGGCCCATCAAAGCTTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTCGGCTGGGGCCTCCCACCCCGGGGGAACCAGAGGCTCCTGCCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113479 CTCGGCTGGGGCCTCCCACCCCGGGGGAACCAGAGGCTCCTGCCCAGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CGAACTTTCCACTGTGAGATCTGCAATGTCAAGGTCAACTCGGAGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113529 CGAACTTTCCACTGTGAGATCTGCAATGTCAAGGTCAACTCGGAGGTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACTGAAACAG         CACATCTCCAGCCGGCGGCACCGAGACGGCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 113579 ACTGAAACAGGTG...CAGCACATCTCCAGCCGGCGGCACCGAGACGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGCCGGGAAGCCCAACCCACTACTGAGCCGTCACAAGAAGTCTAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113825 TGGCCGGGAAGCCCAACCCACTACTGAGCCGTCACAAGAAGTCTAGGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCCGGGGAGCTGGCG         GGCACGCTGACTTTCTCCAAGGAGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 113875 GCCGGGGAGCTGGCGGTG...CAGGGCACGCTGACTTTCTCCAAGGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCCCAAGTCCCTGGCGGGCGGCCTGCTCCCCAGCCCCCTGGCGGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114055 GCCCAAGTCCCTGGCGGGCGGCCTGCTCCCCAGCCCCCTGGCGGTGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CAGTGATGGCAGCGGCAGCAGGCTCGCCGCTGTCCCTGCGCCCGGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114105 CAGTGATGGCAGCGGCAGCAGGCTCGCCGCTGTCCCTGCGCCCGGCTCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCCGCACCTCTTCTCCAGGGACCGCCGATCACTCACCCTCTGCTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114155 GCCGCACCTCTTCTCCAGGGACCGCCGATCACTCACCCTCTGCTTCACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGCCCCCGGACCCATCCGAACTGCGCACGGACCCATCCTCTTCTCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114205 GGCCCCCGGACCCATCCGAACTGCGCACGGACCCATCCTCTTCTCCCCGT

   1150 
   1097 AC
        ||
 114255 AC