seq1 = pF1KE0095.tfa, 3783 bp
seq2 = pF1KE0095/gi568815595r_123184611.tfa (gi568815595r:123184611_123548545), 363935 bp

>pF1KE0095 3783
>gi568815595r:123184611_123548545 (Chr3)

(complement)

1-1134  (100001-101134)   100% ->
1135-1284  (195965-196114)   100% ->
1285-1406  (200643-200764)   100% ->
1407-1518  (215871-215982)   100% ->
1519-1646  (217530-217657)   100% ->
1647-1805  (219744-219902)   100% ->
1806-1947  (220787-220928)   100% ->
1948-2088  (223084-223224)   100% ->
2089-2111  (227775-227797)   100% ->
2112-2256  (228728-228872)   100% ->
2257-2354  (230429-230526)   100% ->
2355-2442  (234224-234311)   100% ->
2443-2559  (244363-244479)   100% ->
2560-2724  (245327-245491)   100% ->
2725-2900  (248251-248426)   100% ->
2901-2930  (251164-251193)   100% ->
2931-3063  (252330-252462)   100% ->
3064-3327  (257170-257433)   100% ->
3328-3532  (258592-258796)   100% ->
3533-3657  (261737-261861)   100% ->
3658-3783  (263810-263935)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGCTCCAAAAGCGTGAGCCCCCCGGGCTACGCGGCGCAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGGCTCCAAAAGCGTGAGCCCCCCGGGCTACGCGGCGCAGAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCGGCGCCGGCGCCCCGGGGAGGCCCCGAACACCGCTCTGCGTGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCGGCGCCGGCGCCCCGGGGAGGCCCCGAACACCGCTCTGCGTGGGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCGATTCCCGCGCGAATGGCTACCCCCATGCCCCCGGGGGCTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCGATTCCCGCGCGAATGGCTACCCCCATGCCCCCGGGGGCTCTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCGGCTCCACCAAGAAACCCGGGGGGGCGGTGACCCCGCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCGGCTCCACCAAGAAACCCGGGGGGGCGGTGACCCCGCAGCAGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCTGGCCAGCCGCTGGCGCAGCGACGACGACGACGATCCTCCGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCCTGGCCAGCCGCTGGCGCAGCGACGACGACGACGATCCTCCGCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGTGACGACCCCCTGGCCGGGGGCTTCGGCTTCAGCTTCCGCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGGTGACGACCCCCTGGCCGGGGGCTTCGGCTTCAGCTTCCGCTCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGCCTGGCAGGAGCGCGGCGGCGACGACTGCGGTCGCGGCAGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCGCCTGGCAGGAGCGCGGCGGCGACGACTGCGGTCGCGGCAGCCGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGCGGCGGGGCGCGGCCAGCGGGGGCAGCACCCGGGCGCCCCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGCGGCGGGGCGCGGCCAGCGGGGGCAGCACCCGGGCGCCCCCTGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGGCGGCGGCGGCTCGGCGGCGGCGGCTGCCTCGGCGGGCGGGACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGGCGGCGGCGGCTCGGCGGCGGCGGCTGCCTCGGCGGGCGGGACGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGCGCCCTCGCTCGGTGGAGGTGGGTCTGGAGGAGCGGCGGGGCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGCGCCCTCGCTCGGTGGAGGTGGGTCTGGAGGAGCGGCGGGGCAAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCGCGCGGCCGACGAGCTGGAGGCCGGCGCCGTCGAGGGCGGCGAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCGCGCGGCCGACGAGCTGGAGGCCGGCGCCGTCGAGGGCGGCGAGGGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGGGGATGGCGGCAGCTCGGCGGACTCGGGCTCGGGCGCGGGGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGGGGATGGCGGCAGCTCGGCGGACTCGGGCTCGGGCGCGGGGCCCGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGGTGCTGTCCCTGGGCGCCTGCTGCCTGGCGTTGCTGCAGATATTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCGGTGCTGTCCCTGGGCGCCTGCTGCCTGGCGTTGCTGCAGATATTCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCAAGAAGTTCCCGTCGGACAAACTGGAGCGGCTGTACCAGCGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCAAGAAGTTCCCGTCGGACAAACTGGAGCGGCTGTACCAGCGCTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTTCCGCCTGAACCAGAGCAGCCTCACCATGCTCATGGCCGTGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTTCCGCCTGAACCAGAGCAGCCTCACCATGCTCATGGCCGTGCTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCGTGTGCCTGGTCATGTTGGCCTTCCACGCGGCGCGGCCCCCGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCGTGTGCCTGGTCATGTTGGCCTTCCACGCGGCGCGGCCCCCGCTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCTGCCCTACCTGGCCGTGCTGGCGGCCGCCGTCGGCGTGATCCTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTGCCCTACCTGGCCGTGCTGGCGGCCGCCGTCGGCGTGATCCTCATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGCTGTGCTTTGCAACCGCGCCGCCTTCCACCAGGACCACATGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGCTGTGCTTTGCAACCGCGCCGCCTTCCACCAGGACCACATGGGCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCTGCTATGCGCTCATCGCCGTGGTGCTGGCCGTCCAGGTGGTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCTGCTATGCGCTCATCGCCGTGGTGCTGGCCGTCCAGGTGGTGGGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTGCTGCCGCAGCCACGCAGCGCCTCTGAGGGCATCTGGTGGACCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCTGCTGCCGCAGCCACGCAGCGCCTCTGAGGGCATCTGGTGGACCGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTTCATCTACACCATCTACACGCTGCTGCCCGTGCGCATGCGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTTCATCTACACCATCTACACGCTGCTGCCCGTGCGCATGCGGGCCGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTGCTCAGCGGGGTGCTCCTGTCCGCCCTCCACCTGGCCATCGCCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTGCTCAGCGGGGTGCTCCTGTCCGCCCTCCACCTGGCCATCGCCCTGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CACCAACGCCCAGGACCAGTTCCTGCTGAAGCAG         CTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101101 CACCAACGCCCAGGACCAGTTCCTGCTGAAGCAGGTA...CAGCTTGTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCAATGTTCTCATTTTCTCCTGCACCAACATCGTGGGTGTCTGCACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195972 CCAATGTTCTCATTTTCTCCTGCACCAACATCGTGGGTGTCTGCACCCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TATCCGGCTGAGGTCTCCCAGAGACAGGCTTTCCAGGAGACCCGAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196022 TATCCGGCTGAGGTCTCCCAGAGACAGGCTTTCCAGGAGACCCGAGAGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CATCCAGGCGCGGCTCCACTCGCAGCGGGAGAACCAGCAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 196072 CATCCAGGCGCGGCTCCACTCGCAGCGGGAGAACCAGCAGCAGGTG...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1285   GAACGGCTCCTGCTGTCTGTCCTTCCCCGTCATGTTGCCATGGAGATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200641 AGGAACGGCTCCTGCTGTCTGTCCTTCCCCGTCATGTTGCCATGGAGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AAAGCAGACATCAACGCCAAGCAGGAGGATATGATGTTCCATAAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200691 AAAGCAGACATCAACGCCAAGCAGGAGGATATGATGTTCCATAAGATTTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CATCCAGAAACATGACAACGTGAG         CATCCTGTTTGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 200741 CATCCAGAAACATGACAACGTGAGGTA...CAGCATCCTGTTTGCTGACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TCGAGGGCTTCACCAGCCTGGCGTCCCAGTGCACTGCACAGGAACTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215888 TCGAGGGCTTCACCAGCCTGGCGTCCCAGTGCACTGCACAGGAACTGGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 ATGACCCTCAACGAGCTCTTCGCCCGCTTTGACAAGCTGGCCGCA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 215938 ATGACCCTCAACGAGCTCTTCGCCCGCTTTGACAAGCTGGCCGCAGTG..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1519     GAGAATCACTGTTTACGTATTAAGATCCTTGGGGATTGTTATTACT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215988 .CAGGAGAATCACTGTTTACGTATTAAGATCCTTGGGGATTGTTATTACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 GCGTCTCGGGGCTGCCTGAAGCAAGGGCTGACCACGCCCACTGCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217576 GCGTCTCGGGGCTGCCTGAAGCAAGGGCTGACCACGCCCACTGCTGTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GAGATGGGCATGGACATGATCGAGGCCATCTC         GTTGGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 217626 GAGATGGGCATGGACATGATCGAGGCCATCTCGTA...CAGGTTGGTCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GGAGGTGACAGGGGTGAACGTGAACATGCGTGTGGGAATTCACAGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219753 GGAGGTGACAGGGGTGAACGTGAACATGCGTGTGGGAATTCACAGCGGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 GAGTACACTGCGGTGTCCTTGGTCTCAGGAAGTGGCAGTTCGACGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219803 GAGTACACTGCGGTGTCCTTGGTCTCAGGAAGTGGCAGTTCGACGTCTGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 TCTAACGATGTCACGCTAGCCAACCACATGGAGGCTGGCGGCAAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219853 TCTAACGATGTCACGCTAGCCAACCACATGGAGGCTGGCGGCAAGGCAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806          ACGCATCCACATCACCAAGGCTACACTCAACTACCTGAATG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219903 GTG...TAGACGCATCCACATCACCAAGGCTACACTCAACTACCTGAATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 GGGACTACGAGGTGGAGCCAGGCTGTGGGGGCGAGCGCAACGCCTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220828 GGGACTACGAGGTGGAGCCAGGCTGTGGGGGCGAGCGCAACGCCTACCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1897 AAGGAGCACAGTATCGAGACCTTCCTCATCCTGCGCTGCACCCAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220878 AAGGAGCACAGTATCGAGACCTTCCTCATCCTGCGCTGCACCCAGAAGCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 G         AAAGAAGAGAAGGCCATGATCGCCAAGATGAACCGCCAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220928 GGTC...CAGAAAGAAGAGAAGGCCATGATCGCCAAGATGAACCGCCAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 GAACCAACTCCATCGGGCACAACCCACCACACTGGGGGGCTGAGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223124 GAACCAACTCCATCGGGCACAACCCACCACACTGGGGGGCTGAGCGCCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 TTCTACAACCACCTGGGTGGCAACCAGGTGTCCAAGGAGATGAAGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223174 TTCTACAACCACCTGGGTGGCAACCAGGTGTCCAAGGAGATGAAGCGGAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2088 G         GGCTTTGAAGACCCCAAGGACAA         GAACGCCC
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 223224 GGTG...TAGGGCTTTGAAGACCCCAAGGACAAGTG...CAGGAACGCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 AGGAGAGTGCGAACCCTGAGGATGAAGTGGATGAGTTTCTGGGCCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228736 AGGAGAGTGCGAACCCTGAGGATGAAGTGGATGAGTTTCTGGGCCGTGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 ATTGACGCCAGGAGCATTGATAGGCTTCGGTCTGAGCACGTCCGCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228786 ATTGACGCCAGGAGCATTGATAGGCTTCGGTCTGAGCACGTCCGCAAGTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 CCTCCTGACCTTCAGGGAGCCTGACTTAGAGAAGAAG         TACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 228836 CCTCCTGACCTTCAGGGAGCCTGACTTAGAGAAGAAGGTA...CAGTACT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 CCAAGCAGGTAGACGACCGATTTGGTGCCTATGTGGCGTGTGCCTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230433 CCAAGCAGGTAGACGACCGATTTGGTGCCTATGTGGCGTGTGCCTCGCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 GTCTTCCTCTTCATCTGCTTTGTCCAGATCACCATCGTGCCCCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 230483 GTCTTCCTCTTCATCTGCTTTGTCCAGATCACCATCGTGCCCCAGTG...

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2355    CTCCATATTCATGCTCAGCTTCTACCTGACCTGTTCCCTGCTGCTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234221 CAGCTCCATATTCATGCTCAGCTTCTACCTGACCTGTTCCCTGCTGCTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 CCTTGGTGGTGTTTGTGTCTGTGATCTACTCCTGCGTAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 234271 CCTTGGTGGTGTTTGTGTCTGTGATCTACTCCTGCGTAAAGGTG...TAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 CTCTTCCCCTCCCCACTGCAGACCCTCTCCAGGAAGATCGTGCGGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244363 CTCTTCCCCTCCCCACTGCAGACCCTCTCCAGGAAGATCGTGCGGTCCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 GATGAACAGCACCCTGGTTGGGGTGTTCACCATCACCCTGGTGTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244413 GATGAACAGCACCCTGGTTGGGGTGTTCACCATCACCCTGGTGTTCCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2543 CGGCTTTTGTCAACATG         TTCACGTGCAACTCCAGGGACCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 244463 CGGCTTTTGTCAACATGGTG...CAGTTCACGTGCAACTCCAGGGACCTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 CTGGGCTGCTTGGCACAGGAGCACAACATCAGCGCGAGCCAGGTCAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245351 CTGGGCTGCTTGGCACAGGAGCACAACATCAGCGCGAGCCAGGTCAACGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2634 GTGTCACGTGGCGGAGTCGGCCGTCAACTACAGCCTGGGCGATGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245401 GTGTCACGTGGCGGAGTCGGCCGTCAACTACAGCCTGGGCGATGAGCAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2684 GCTTCTGTGGCAGCCCCTGGCCCAACTGCAACTTCCCCGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 245451 GCTTCTGTGGCAGCCCCTGGCCCAACTGCAACTTCCCCGAGGTA...CAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 TACTTCACCTACAGCGTGCTGCTCAGCCTGCTGGCCTGCTCCGTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248251 TACTTCACCTACAGCGTGCTGCTCAGCCTGCTGGCCTGCTCCGTGTTCCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 GCAGATCAGCTGCATCGGGAAGCTGGTGCTCATGCTGGCCATCGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248301 GCAGATCAGCTGCATCGGGAAGCTGGTGCTCATGCTGGCCATCGAGCTCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2825 TCTACGTGCTCATCGTGGAGGTGCCAGGTGTCACGCTCTTCGACAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248351 TCTACGTGCTCATCGTGGAGGTGCCAGGTGTCACGCTCTTCGACAACGCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2875 GACCTGCTGGTCACCGCCAACGCCAT         AGACTTCTTCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 248401 GACCTGCTGGTCACCGCCAACGCCATGTA...CAGAGACTTCTTCAACAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 CGGGACCTCCCAGTG         CCCTGAGCATGCAACCAAGGTGGCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 251179 CGGGACCTCCCAGTGGTG...CAGCCCTGAGCATGCAACCAAGGTGGCAT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957 TGAAGGTGGTGACGCCCATCATCATCTCAGTCTTTGTGCTGGCCCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 252356 TGAAGGTGGTGACGCCCATCATCATCTCAGTCTTTGTGCTGGCCCTGTAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3007 CTGCACGCCCAGCAGGTGGAGTCCACTGCCCGCCTCGACTTCCTCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 252406 CTGCACGCCCAGCAGGTGGAGTCCACTGCCCGCCTCGACTTCCTCTGGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3057 ACTGCAG         GCCACAGAGGAGAAAGAGGAGATGGAGGAGCTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 252456 ACTGCAGGTG...CAGGCCACAGAGGAGAAAGAGGAGATGGAGGAGCTGC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 AGGCCTACAACCGGCGGCTGCTGCACAACATCCTGCCCAAGGACGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257204 AGGCCTACAACCGGCGGCTGCTGCACAACATCCTGCCCAAGGACGTGGCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 GCTCACTTCCTGGCCCGCGAGCGGCGCAATGATGAGCTCTACTATCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257254 GCTCACTTCCTGGCCCGCGAGCGGCGCAATGATGAGCTCTACTATCAGTC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 CTGTGAGTGTGTGGCGGTCATGTTCGCCTCCATCGCCAACTTCTCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257304 CTGTGAGTGTGTGGCGGTCATGTTCGCCTCCATCGCCAACTTCTCCGAGT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3248 TCTACGTTGAGCTGGAGGCCAACAACGAGGGTGTCGAGTGCCTGCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257354 TCTACGTTGAGCTGGAGGCCAACAACGAGGGTGTCGAGTGCCTGCGGCTA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3298 CTCAATGAGATCATCGCTGACTTTGATGAG         ATCATCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 257404 CTCAATGAGATCATCGCTGACTTTGATGAGGTG...CAGATCATCAGCGA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3339 GGATCGGTTCCGGCAGCTGGAGAAGATCAAGACCATCGGCAGCACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258603 GGATCGGTTCCGGCAGCTGGAGAAGATCAAGACCATCGGCAGCACCTACA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3389 TGGCTGCCTCCGGCCTCAACGACTCTACCTACGACAAGGTGGGCAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258653 TGGCTGCCTCCGGCCTCAACGACTCTACCTACGACAAGGTGGGCAAGACC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3439 CACATCAAGGCACTGGCCGACTTTGCCATGAAGCTGATGGACCAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258703 CACATCAAGGCACTGGCCGACTTTGCCATGAAGCTGATGGACCAGATGAA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3489 GTACATCAATGAGCACTCCTTCAACAACTTCCAGATGAAGATCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 258753 GTACATCAATGAGCACTCCTTCAACAACTTCCAGATGAAGATCGGTG...

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3533    GGCTCAACATCGGCCCCGTGGTGGCCGGGGTGATAGGGGCACGAAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261734 CAGGGCTCAACATCGGCCCCGTGGTGGCCGGGGTGATAGGGGCACGAAAG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3580 CCTCAGTACGACATCTGGGGCAATACCGTGAACGTGGCCAGCCGCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261784 CCTCAGTACGACATCTGGGGCAATACCGTGAACGTGGCCAGCCGCATGGA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3630 CAGCACCGGTGTACCCGACCGCATCCAG         GTCACCACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 261834 CAGCACCGGTGTACCCGACCGCATCCAGGTG...CAGGTCACCACAGACA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3671 TGTACCAGGTGCTGGCTGCCAACACGTACCAGCTGGAGTGCCGGGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263823 TGTACCAGGTGCTGGCTGCCAACACGTACCAGCTGGAGTGCCGGGGCGTG

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3721 GTCAAGGTCAAGGGCAAAGGCGAGATGATGACCTACTTCCTCAATGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 263873 GTCAAGGTCAAGGGCAAAGGCGAGATGATGACCTACTTCCTCAATGGAGG

   3950     .    :
   3771 GCCCCCGCTCAGT
        |||||||||||||
 263923 GCCCCCGCTCAGT