seq1 = pF1KE0090.tfa, 1449 bp
seq2 = pF1KE0090/gi568815587r_102477329.tfa (gi568815587r:102477329_102725319), 247991 bp

>pF1KE0090 1449
>gi568815587r:102477329_102725319 (Chr11)

(complement)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-374  (108261-108508)   100% ->
375-523  (113417-113565)   100% ->
524-649  (115290-115415)   100% ->
650-811  (116222-116383)   100% ->
812-953  (118644-118785)   100% ->
954-1090  (130563-130699)   100% ->
1091-1247  (131725-131881)   100% ->
1248-1351  (146178-146281)   100% ->
1352-1449  (147894-147991)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTGCTCCCTGCATCTGGCCTTGCTGTCTTCCTCATCATGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTGCTCCCTGCATCTGGCCTTGCTGTCTTCCTCATCATGGCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGTTTTCCACTGCAGCCCCCTCCCTAGTTGCAGCCTCCCCCAGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGTTTTCCACTGCAGCCCCCTCCCTAGTTGCAGCCTCCCCCAGGACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAGGAACAACTACCGCCTCGCACAG         GCGTATCTTGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 GGAGGAACAACTACCGCCTCGCACAGGTT...CAGGCGTATCTTGACAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATTACACAAATAAAGAAGGACACCAGATTGGTGAGATGGTTGCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108276 TATTACACAAATAAAGAAGGACACCAGATTGGTGAGATGGTTGCAAGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGCAATTCCATGATAAGGAAGATTAAGGAGCTACAAGCGTTCTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108326 AAGCAATTCCATGATAAGGAAGATTAAGGAGCTACAAGCGTTCTTTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCAAGTCACCGGGAAGTTAGACCAGACCACAATGAACGTGATCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108376 TCCAAGTCACCGGGAAGTTAGACCAGACCACAATGAACGTGATCAAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTCGCTGTGGAGTTCCTGATGTGGCCAATTATCGCCTCTTCCCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108426 CCTCGCTGTGGAGTTCCTGATGTGGCCAATTATCGCCTCTTCCCTGGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACCCAAATGGAAAAAAAATACTTTGACATACAG         AATATCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108476 ACCCAAATGGAAAAAAAATACTTTGACATACAGGTA...CAGAATATCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AATACACACCTTCCATGAGTTCTGTCGAGGTGGACAAAGCAGTGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113425 AATACACACCTTCCATGAGTTCTGTCGAGGTGGACAAAGCAGTGGAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCTTGCAGGCCTGGAGTAGCGCCGTCCCTCTGAGCTTTGTCAGAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113475 GCCTTGCAGGCCTGGAGTAGCGCCGTCCCTCTGAGCTTTGTCAGAATAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCAGGAGAAGCGGATATTATGATATCTTTTGAAAATGGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 113525 CTCAGGAGAAGCGGATATTATGATATCTTTTGAAAATGGAGGTA...TAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCACGGGGATTCCTATCCATTCGATGGGCCTCGGGGGACTCTAGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115290 ATCACGGGGATTCCTATCCATTCGATGGGCCTCGGGGGACTCTAGCCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCATTTGCTCCTGGAGAAGGCCTGGGAGGAGATACACATTTCGACAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115340 GCATTTGCTCCTGGAGAAGGCCTGGGAGGAGATACACATTTCGACAATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGAGAAGTGGACTATGGGAACGAATG         GTTTTAATTTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 115390 TGAGAAGTGGACTATGGGAACGAATGGTA...TAGGTTTTAATTTGTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCGTTGCTGCTCATGAATTTGGCCATGCCCTGGGCCTGGCCCATTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116237 CCGTTGCTGCTCATGAATTTGGCCATGCCCTGGGCCTGGCCCATTCCACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACCCATCAGCACTGATGTACCCAACTTATAAGTACAAGAATCCCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116287 GACCCATCAGCACTGATGTACCCAACTTATAAGTACAAGAATCCCTATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ATTCCACCTCCCCAAAGATGATGTGAAAGGGATCCAGGCATTATACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116337 ATTCCACCTCCCCAAAGATGATGTGAAAGGGATCCAGGCATTATACGGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    812       GACCTCGGAAAGTATTCCTGGGGAAGCCCACTCTGCCCCATGCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116387 ...TAGGACCTCGGAAAGTATTCCTGGGGAAGCCCACTCTGCCCCATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCCCATCACAAGCCATCCATCCCTGACCTCTGTGACTCCAGCTCATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118688 CCCCATCACAAGCCATCCATCCCTGACCTCTGTGACTCCAGCTCATCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGACGCTGTGACAATGCTGGGGAAGGAGCTCCTGCTCTTCAAGGACCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118738 TGACGCTGTGACAATGCTGGGGAAGGAGCTCCTGCTCTTCAAGGACCGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    954        GATTTTCTGGAGACGGCAGGTTCACTTGCGGACAGGAATTCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118788 A...TAGGATTTTCTGGAGACGGCAGGTTCACTTGCGGACAGGAATTCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CCCAGCACTATTACCAGCTCCTTCCCCCAGCTCATGTCCAATGTGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130606 CCCAGCACTATTACCAGCTCCTTCCCCCAGCTCATGTCCAATGTGGATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGCTTACGAAGTGGCTGAGAGGGGCACTGCTTACTTCTTCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 130656 AGCTTACGAAGTGGCTGAGAGGGGCACTGCTTACTTCTTCAAAGGTA...

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1091    GTCCCCACTACTGGATAACAAGAGGATTCCAAATGCAAGGTCCTCCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131722 CAGGTCCCCACTACTGGATAACAAGAGGATTCCAAATGCAAGGTCCTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CGGACTATTTATGACTTTGGATTTCCAAGGCACGTGCAGCAAATAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131772 CGGACTATTTATGACTTTGGATTTCCAAGGCACGTGCAGCAAATAGATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGCTGTCTACCTCAGGGAGCCACAGAAGACCCTTTTCTTTGTGGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131822 TGCTGTCTACCTCAGGGAGCCACAGAAGACCCTTTTCTTTGTGGGAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AATACTACAG         CTACGACGAAAGGAAAAGGAAAATGGAAAAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131872 AATACTACAGGTA...TAGCTACGACGAAAGGAAAAGGAAAATGGAAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GACTATCCAAAGAATACTGAAGAAGAATTTTCAGGAGTAAATGGCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146209 GACTATCCAAAGAATACTGAAGAAGAATTTTCAGGAGTAAATGGCCAAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CGATGCTGCTGTAGAATTAAATG         GCTACATTTACTTCTTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 146259 CGATGCTGCTGTAGAATTAAATGGTA...TAGGCTACATTTACTTCTTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CAGGACCAAAAACATACAAGTATGACACAGAGAAGGAAGATGTGGTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147912 CAGGACCAAAAACATACAAGTATGACACAGAGAAGGAAGATGTGGTTAGT

   1500     .    :    .    :    .    :
   1420 GTGGTGAAATCTAGTTCCTGGATTGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 147962 GTGGTGAAATCTAGTTCCTGGATTGGTTGC