seq1 = pF1KE0088.tfa, 2715 bp
seq2 = pF1KE0088/gi568815577r_29437233.tfa (gi568815577r:29437233_30039500), 602268 bp

>pF1KE0088 2715
>gi568815577r:29437233_30039500 (Chr21)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-286  (345438-345605)   100% ->
287-544  (349516-349773)   100% ->
545-726  (366337-366518)   100% ->
727-780  (384638-384691)   100% ->
781-954  (388210-388383)   100% ->
955-1098  (396532-396675)   100% ->
1099-1206  (440564-440671)   100% ->
1207-1320  (448276-448389)   100% ->
1321-1524  (450459-450662)   100% ->
1525-1748  (451912-452135)   100% ->
1749-1867  (457958-458076)   100% ->
1868-2085  (462320-462537)   100% ->
2086-2311  (477652-477877)   100% ->
2312-2562  (484199-484449)   100% ->
2563-2715  (502116-502268)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCACGGCACACTCCTCGCCCAGCCCGGGCTCTGGACCAGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCACGGCACACTCCTCGCCCAGCCCGGGCTCTGGACCAGGGACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTGGGCACTCCTCTATTTCCTCTGCTATATCCTCCCTCAGACCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTGGGCACTCCTCTATTTCCTCTGCTATATCCTCCCTCAGACCGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCAAGTACTCAGGATCG         GAGGGATTTTTGAAACAGTGGAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 CGCAAGTACTCAGGATCGGTG...CAGGAGGGATTTTTGAAACAGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGAGCCTGTTAATGTTGAAGAATTAGCTTTCAAGTTTGCAGTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345461 AATGAGCCTGTTAATGTTGAAGAATTAGCTTTCAAGTTTGCAGTCACCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTAACAGAAACCGAACCCTGATGCCTAACACCACATTAACCTATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345511 CATTAACAGAAACCGAACCCTGATGCCTAACACCACATTAACCTATGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCAGAGAATTAACCTTTTTGATAGTTTTGAAGCCTCGCGGAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 345561 TCCAGAGAATTAACCTTTTTGATAGTTTTGAAGCCTCGCGGAGAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     CATGTGACCAGCTGGCTCTTGGTGTGGCTGCTCTCTTTGGCCCTTC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345611 .CAGCATGTGACCAGCTGGCTCTTGGTGTGGCTGCTCTCTTTGGCCCTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCATAGCTCCTCCGTCAGTGCTGTGCAGTCTATTTGCAATGCTCTCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349562 CCATAGCTCCTCCGTCAGTGCTGTGCAGTCTATTTGCAATGCTCTCGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCCACACATACAGACCCGCTGGAAACACCCCTCGGTGGACAACAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349612 TTCCACACATACAGACCCGCTGGAAACACCCCTCGGTGGACAACAAAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTGTTTTACATCAACCTTTACCCAGATTATGCAGCTATCAGCAGGGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349662 TTGTTTTACATCAACCTTTACCCAGATTATGCAGCTATCAGCAGGGCGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGGATCTGGTCCTCTATTACAACTGGAAAACAGTGACAGTGGTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349712 CCTGGATCTGGTCCTCTATTACAACTGGAAAACAGTGACAGTGGTGTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGACAGCACAG         GTCTAATTCGTCTACAAGAGCTCATCAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 349762 AAGACAGCACAGGTA...TAGGTCTAATTCGTCTACAAGAGCTCATCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTCCCTCCAGATATAATATTAAAATCAAAATCCGCCAGCTGCCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 366366 GCTCCCTCCAGATATAATATTAAAATCAAAATCCGCCAGCTGCCCTCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAATAAAGATGCCAAGCCTTTACTCAAGGAGATGAAGAAAGGCAAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 366416 GAATAAAGATGCCAAGCCTTTACTCAAGGAGATGAAGAAAGGCAAGGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCTATGTGATATTTGATTGTTCACATGAAACAGCCGCTGAAATCCTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 366466 TCTATGTGATATTTGATTGTTCACATGAAACAGCCGCTGAAATCCTTAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CAG         ATTCTGTTCATGGGCATGATGACCGAGTACTATCACTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 366516 CAGGTA...CAGATTCTGTTCATGGGCATGATGACCGAGTACTATCACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTTTTTCACAACCCTG         GACTTATTTGCTTTGGATCTGGAAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 384676 CTTTTTCACAACCCTGGTA...CAGGACTTATTTGCTTTGGATCTGGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCTATAGGTACAGTGGCGTAAACATGACCGGGTTTCGGCTGCTTAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388235 TCTATAGGTACAGTGGCGTAAACATGACCGGGTTTCGGCTGCTTAACATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACAACCCTCACGTGTCATCCATCATTGAGAAGTGGTCCATGGAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388285 GACAACCCTCACGTGTCATCCATCATTGAGAAGTGGTCCATGGAGAGACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCAGGCCCCACCCAGGCCCGAGACTGGCCTTTTGGATGGCATGATGACA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 388335 GCAGGCCCCACCCAGGCCCGAGACTGGCCTTTTGGATGGCATGATGACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    955         ACTGAAGCGGCTCTGATGTACGATGCTGTGTACATGGTGGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388385 TA...CAGACTGAAGCGGCTCTGATGTACGATGCTGTGTACATGGTGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATTGCCTCGCACCGGGCATCCCAGCTGACCGTCAGCTCCCTGCAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396574 ATTGCCTCGCACCGGGCATCCCAGCTGACCGTCAGCTCCCTGCAGTGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TAGACATAAGCCATGGCGCCTCGGACCCAGATTTATGAACCTGATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396624 TAGACATAAGCCATGGCGCCTCGGACCCAGATTTATGAACCTGATCAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AG         GCCCGGTGGGATGGCTTGACTGGGCATATCACCTTTAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 396674 AGGCA...CAGGCCCGGTGGGATGGCTTGACTGGGCATATCACCTTTAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AAAACCAATGGCTTGAGGAAGGATTTTGATCTGGACATTATTAGTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 440603 AAAACCAATGGCTTGAGGAAGGATTTTGATCTGGACATTATTAGTCTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGAGGAAGGAACTGAAAAG         ATTGGGATTTGGAATTCCAACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 440653 AGAGGAAGGAACTGAAAAGGTA...TAGATTGGGATTTGGAATTCCAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTGGGCTTAACATGACGGACAGCAACAAAGACAAGTCCAGCAATATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 448298 GTGGGCTTAACATGACGGACAGCAACAAAGACAAGTCCAGCAATATCACT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GATTCATTGGCCAACAGAACACTCATTGTCACCACCATTCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 448348 GATTCATTGGCCAACAGAACACTCATTGTCACCACCATTCTGGTA...TA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1321  GAAGAACCCTATGTTATGTACAGGAAATCTGATAAGCCTCTATATGGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 450458 GGAAGAACCCTATGTTATGTACAGGAAATCTGATAAGCCTCTATATGGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ATGACAGATTTGAAGGATATTGCCTAGACCTGTTGAAAGAATTGTCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 450508 ATGACAGATTTGAAGGATATTGCCTAGACCTGTTGAAAGAATTGTCAAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ATCCTGGGTTTCATTTATGATGTTAAACTAGTTCCCGATGGCAAATATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 450558 ATCCTGGGTTTCATTTATGATGTTAAACTAGTTCCCGATGGCAAATATGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGCCCAGAATGACAAAGGGGAGTGGAACGGGATGGTTAAAGAACTCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 450608 GGCCCAGAATGACAAAGGGGAGTGGAACGGGATGGTTAAAGAACTCATAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ATCAC         AGGGCTGACCTGGCAGTGGCTCCTCTTACCATCACC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 450658 ATCACGTA...CAGAGGGCTGACCTGGCAGTGGCTCCTCTTACCATCACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TACGTGCGGGAGAAAGTCATTGACTTCTCCAAACCCTTCATGACCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451948 TACGTGCGGGAGAAAGTCATTGACTTCTCCAAACCCTTCATGACCCTAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CATCAGCATTCTCTACCGGAAGCCCAATGGTACCAATCCAGGCGTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 451998 CATCAGCATTCTCTACCGGAAGCCCAATGGTACCAATCCAGGCGTTTTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CCTTCCTCAACCCCCTGTCTCCAGATATTTGGATGTATGTGCTCTTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 452048 CCTTCCTCAACCCCCTGTCTCCAGATATTTGGATGTATGTGCTCTTAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TGCTTGGGAGTCAGCTGTGTACTCTTTGTGATTGCAAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 452098 TGCTTGGGAGTCAGCTGTGTACTCTTTGTGATTGCAAGGTA...CAGGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TACACCCTACGAGTGGTATAACCCCCACCCATGCAACCCTGACTCAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 457961 TACACCCTACGAGTGGTATAACCCCCACCCATGCAACCCTGACTCAGACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGGTGGAAAACAATTTTACTTTACTAAATAGTTTCTGGTTTGGAGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 458011 TGGTGGAAAACAATTTTACTTTACTAAATAGTTTCTGGTTTGGAGTTGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GCTCTCATGCAGCAAG         GATCAGAGCTGATGCCCAAAGCTCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 458061 GCTCTCATGCAGCAAGGTA...CAGGATCAGAGCTGATGCCCAAAGCTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 ATCGACCAGAATAGTTGGAGGGATATGGTGGTTTTTCACCCTAATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 462345 ATCGACCAGAATAGTTGGAGGGATATGGTGGTTTTTCACCCTAATCATCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TTTCATCCTACACGGCCAATCTGGCTGCCTTCTTGACAGTAGAGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 462395 TTTCATCCTACACGGCCAATCTGGCTGCCTTCTTGACAGTAGAGAGAATG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GAATCCCCCATAGATTCGGCAGATGATCTGGCAAAGCAAACCAAGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 462445 GAATCCCCCATAGATTCGGCAGATGATCTGGCAAAGCAAACCAAGATAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 ATATGGGGCGGTTAGAGATGGATCAACAATGACCTTCTTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 462495 ATATGGGGCGGTTAGAGATGGATCAACAATGACCTTCTTCAAGGTA...C

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2086   AAATCAAAAATCTCCACCTATGAGAAGATGTGGGCTTTCATGAGCAGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477650 AGAAATCAAAAATCTCCACCTATGAGAAGATGTGGGCTTTCATGAGCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 AGGCAGCAGACCGCCCTGGTAAGAAACAGTGATGAGGGGATCCAGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477700 AGGCAGCAGACCGCCCTGGTAAGAAACAGTGATGAGGGGATCCAGAGAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 GCTCACCACAGACTACGCGCTGCTGATGGAGTCCACCAGCATTGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477750 GCTCACCACAGACTACGCGCTGCTGATGGAGTCCACCAGCATTGAGTATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TGACGCAGAGAAACTGCAACCTCACTCAGATCGGGGGCCTCATTGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477800 TGACGCAGAGAAACTGCAACCTCACTCAGATCGGGGGCCTCATTGACTCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 AAAGGTTACGGAGTGGGAACACCTATTG         GTTCTCCTTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 477850 AAAGGTTACGGAGTGGGAACACCTATTGGTA...CAGGTTCTCCTTACCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GGATAAAATTACTATTGCTATTCTTCAACTCCAAGAAGAAGGGAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 484212 GGATAAAATTACTATTGCTATTCTTCAACTCCAAGAAGAAGGGAAGCTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 ATATGATGAAAGAGAAGTGGTGGCGTGGGAATGGCTGCCCCGAGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 484262 ATATGATGAAAGAGAAGTGGTGGCGTGGGAATGGCTGCCCCGAGGAAGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 AACAAAGAAGCCAGTGCCCTGGGAGTGGAAAATATTGGAGGCATCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 484312 AACAAAGAAGCCAGTGCCCTGGGAGTGGAAAATATTGGAGGCATCTTCAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 TGTTCTGGCTGCCGGACTGGTCCTTTCTGTATTTGTAGCTATTGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 484362 TGTTCTGGCTGCCGGACTGGTCCTTTCTGTATTTGTAGCTATTGGAGAAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 TCATATACAAATCACGGAAGAATAATGATATTGAACAG         TGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 484412 TCATATACAAATCACGGAAGAATAATGATATTGAACAGGTG...TAGTGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 CTCTCTTTCAACGCTATCATGGAAGAACTGGGAATCTCACTGAAGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 502119 CTCTCTTTCAACGCTATCATGGAAGAACTGGGAATCTCACTGAAGAATCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 GAAAAAAATAAAGAAAAAGTCAAGAACTAAGGGGAAATCTTCCTTCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 502169 GAAAAAAATAAAGAAAAAGTCAAGAACTAAGGGGAAATCTTCCTTCACAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 GTATCCTTACTTGTCATCAGAGACGAACTCAGAGAAAAGAGACTGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 502219 GTATCCTTACTTGTCATCAGAGACGAACTCAGAGAAAAGAGACTGTGGCG