seq1 = pF1KE0083.tfa, 1575 bp
seq2 = pF1KE0083/gi568815582r_46983224.tfa (gi568815582r:46983224_47232027), 248804 bp

>pF1KE0083 1575
>gi568815582r:46983224_47232027 (Chr16)

(complement)

1-34  (88416-88449)   100% ->
35-91  (100003-100059)   100% ->
92-232  (102664-102804)   100% ->
233-481  (103455-103703)   100% ->
482-526  (109116-109160)   100% ->
527-654  (109244-109371)   100% ->
655-883  (122317-122545)   100% ->
884-997  (145689-145802)   100% ->
998-1575  (148227-148804)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTGGAGCGGCTCTGCTCGGTCCTCAAAG         TGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  88416 ATGGCCCTGGAGCGGCTCTGCTCGGTCCTCAAAGGTA...TAGTGTTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AATAACAGTACTGGTAGTGGAAGGGATTGCCGTGGCCCAAAAAACCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 AATAACAGTACTGGTAGTGGAAGGGATTGCCGTGGCCCAAAAAACCCAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92          ATGGACAAAATATTGGAATCAAGCATATTCCTGCAACCCAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100060 GTA...AAGATGGACAAAATATTGGAATCAAGCATATTCCTGCAACCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TGTGGCATTTGGGTTCGAACCAGCAATGGAGGTCATTTTGCTTCGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102705 TGTGGCATTTGGGTTCGAACCAGCAATGGAGGTCATTTTGCTTCGCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTATCCTGACTCATATCCACCAAACAAGGAGTGTATCTACATTTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102755 TTATCCTGACTCATATCCACCAAACAAGGAGTGTATCTACATTTTGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233          CTGCTCCACGTCAAAGAATAGAGTTGACCTTTGATGAACAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102805 GTA...TAGCTGCTCCACGTCAAAGAATAGAGTTGACCTTTGATGAACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TATTATATAGAACCATCATTTGAGTGTCGGTTTGATCACTTGGAAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103496 TATTATATAGAACCATCATTTGAGTGTCGGTTTGATCACTTGGAAGTTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGATGGGCCATTTGGTTTCTCTCCTCTTATAGATCGTTACTGTGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103546 AGATGGGCCATTTGGTTTCTCTCCTCTTATAGATCGTTACTGTGGCGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAAGCCCTCCATTAATTAGATCAACAGGGAGATTCATGTGGATTAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103596 AAAGCCCTCCATTAATTAGATCAACAGGGAGATTCATGTGGATTAAGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTTCTGATGAAGAGCTTGAAGGACTGGGATTTCGAGCAAAATATTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103646 AGTTCTGATGAAGAGCTTGAAGGACTGGGATTTCGAGCAAAATATTCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATTCCAG         ATCCAGACTTTACTTACCTAGGAGGTATTTTAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103696 TATTCCAGGTA...CAGATCCAGACTTTACTTACCTAGGAGGTATTTTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATCCCATTCCAG         ATTGTCAGTTCGAGCTCTCGGGAGCTGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 109149 ATCCCATTCCAGGTT...CAGATTGTCAGTTCGAGCTCTCGGGAGCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGAATAGTGCGCTCTAGTCAGGTAGAACAAGAGGAGAAAACAAAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109273 GGAATAGTGCGCTCTAGTCAGGTAGAACAAGAGGAGAAAACAAAACCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAAGCCGTTGATTGCATCTGGACCATTAAAGCCACTCCAAAAGCTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109323 CCAAGCCGTTGATTGCATCTGGACCATTAAAGCCACTCCAAAAGCTAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655         ATTTATTTGAGGTTCCTAGATTATCAAATGGAGCACTCAAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109373 TA...CAGATTTATTTGAGGTTCCTAGATTATCAAATGGAGCACTCAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAATGCAAGAGAAACTTCGTTGCAGTCTATGATGGAAGCAGTTCTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122359 GAATGCAAGAGAAACTTCGTTGCAGTCTATGATGGAAGCAGTTCTATTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AAACCTGAAGGCCAAGTTTTGCAGCACTGTGGCCAATGATGTAATGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122409 AAACCTGAAGGCCAAGTTTTGCAGCACTGTGGCCAATGATGTAATGCTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAACAGGAATTGGAGTGATTCGAATGTGGGCAGATGAAGGTAGTCGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122459 AAACAGGAATTGGAGTGATTCGAATGTGGGCAGATGAAGGTAGTCGGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGCAGGTTTCGAATGCTCTTTACTTCCTTTGTGGAGC         CTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 122509 AGCAGGTTTCGAATGCTCTTTACTTCCTTTGTGGAGCGTA...CAGCTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTGCACAAGCAGCACTTTCTTTTGCCATAGCAACATGTGCATCAATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145693 CTGCACAAGCAGCACTTTCTTTTGCCATAGCAACATGTGCATCAATAATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTTTAGTCTGTAATGGTGTCCAAAATTGTGCATACCCTTGGGATGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145743 CTTTAGTCTGTAATGGTGTCCAAAATTGTGCATACCCTTGGGATGAAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CATTGTAAAG         AAAAGAAAAAAGCAGGAGTATTTGAACAAAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 145793 CATTGTAAAGGTG...CAGAAAAGAAAAAAGCAGGAGTATTTGAACAAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CACTAAGACTCATGGAACAATTATTGGCATTACTTCAGGGATTGTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148258 CACTAAGACTCATGGAACAATTATTGGCATTACTTCAGGGATTGTCTTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCCTTCTCATTATTTCTATTTTAGTACAAGTGAAACAGCCTCGAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148308 TCCTTCTCATTATTTCTATTTTAGTACAAGTGAAACAGCCTCGAAAAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GTCATGGCTTGCAAAACCGCTTTTAATAAAACCGGGTTCCAAGAAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148358 GTCATGGCTTGCAAAACCGCTTTTAATAAAACCGGGTTCCAAGAAGTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGATCCTCCTCATTATGAACTGTTTTCACTAAGGGACAAAGAGATTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148408 TGATCCTCCTCATTATGAACTGTTTTCACTAAGGGACAAAGAGATTTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAGACCTGGCAGACTTGTCGGAAGAATTGGACAACTACCAGAAGATGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148458 CAGACCTGGCAGACTTGTCGGAAGAATTGGACAACTACCAGAAGATGCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGCTCCTCCACCGCCTCCCGCTGCATCCACGACCACCACTGTGGGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148508 CGCTCCTCCACCGCCTCCCGCTGCATCCACGACCACCACTGTGGGTCGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGCCTCCAGCGTCAAACAAAGCAGGACCAACCTCAGTTCCATGGAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148558 GGCCTCCAGCGTCAAACAAAGCAGGACCAACCTCAGTTCCATGGAACTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CTTTCCGAAATGACTTTGCACAACCACAGCCAATGAAAACATTTAATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148608 CTTTCCGAAATGACTTTGCACAACCACAGCCAATGAAAACATTTAATAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACCTTCAAGAAAAGTAGTTACACTTTCAAACAGGGACATGAGTGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148658 ACCTTCAAGAAAAGTAGTTACACTTTCAAACAGGGACATGAGTGCCCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GCAGGCCCTGGAAGACCGAGTAATGGAGGAGATTCCCTGTGAAATTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148708 GCAGGCCCTGGAAGACCGAGTAATGGAGGAGATTCCCTGTGAAATTTATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1529 TCAGGGGGCGAGAAGATTCTGCACAAGCATCCATATCCATTGACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148758 TCAGGGGGCGAGAAGATTCTGCACAAGCATCCATATCCATTGACTTC