seq1 = pF1KE0082.tfa, 1986 bp
seq2 = pF1KE0082/gi568815579f_57317910.tfa (gi568815579f:57317910_57521478), 203569 bp

>pF1KE0082 1986
>gi568815579f:57317910_57521478 (Chr19)

8-142  (99997-100129)   97% ->
143-1986  (101726-103569)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 TGACTGAGGATTATATGGTTTTTGAGGACGTGGCCATACATTTCTCCCAG
        || |--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 TGGC  AGGATTATATGGTTTTTGAGGACGTGGCCATACATTTCTCCCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 GAGGAGTGGGGAATTCTTAATGACGTTCAGAGACACCTGCACAGCGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 GAGGAGTGGGGAATTCTTAATGACGTTCAGAGACACCTGCACAGCGATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 GATGCTGGAGAACTTTGCACTTTTGTCCTCAGTAG         GTTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100095 GATGCTGGAGAACTTTGCACTTTTGTCCTCAGTAGGTA...TAGGTTGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149 GGCATGGAGCCAAGGATGAGGAGGCACCTTCCAAGCAATGTGTTTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101732 GGCATGGAGCCAAGGATGAGGAGGCACCTTCCAAGCAATGTGTTTCTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 GGAGTGTCACAGGTCACAACTTTAAAGCCAGCTTTGTCCACCCAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101782 GGAGTGTCACAGGTCACAACTTTAAAGCCAGCTTTGTCCACCCAGAAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 CCAGCCCTGTGAGACATGTAGCTCACTTCTGAAGGACATTCTACACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101832 CCAGCCCTGTGAGACATGTAGCTCACTTCTGAAGGACATTCTACACCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 CTGAGCATGACGGAACACACCCCAAGCGTACAGCCAAGCTTTACCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101882 CTGAGCATGACGGAACACACCCCAAGCGTACAGCCAAGCTTTACCTGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349 CAAAAGGAGCATCTTAGAGAGAAGCTCACCAGAAGTGATGAAGGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101932 CAAAAGGAGCATCTTAGAGAGAAGCTCACCAGAAGTGATGAAGGGAGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    399 TTCGTTTGTGAATGACAGTGTTCACCTGGCAAAGAGGAACCTCACATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101982 TTCGTTTGTGAATGACAGTGTTCACCTGGCAAAGAGGAACCTCACATGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    449 TGCAGGGTGGCAAGGATTTTACTGGTGATTCAGATCTTCAACAACAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102032 TGCAGGGTGGCAAGGATTTTACTGGTGATTCAGATCTTCAACAACAGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    499 CTTCACAGTGGGTGGAAGCCACACAGGGACACTCATGGTGTGGAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102082 CTTCACAGTGGGTGGAAGCCACACAGGGACACTCATGGTGTGGAGGCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    549 TCAAAGTGGACAGAATAATTACAGCTGCACCCAATGTGGGAAAGACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102132 TCAAAGTGGACAGAATAATTACAGCTGCACCCAATGTGGGAAAGACTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    599 GCCACCAACATACACTGTTTGAGCACCAGAAAATCCACACAGAGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102182 GCCACCAACATACACTGTTTGAGCACCAGAAAATCCACACAGAGGAAAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    649 CCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGCAAATTGTTTAGGTACAACTCCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102232 CCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGCAAATTGTTTAGGTACAACTCCGACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    699 TATTAAACATCAGCGAAATCATACTGGAGAAAGGCCTTATAAGTGTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102282 TATTAAACATCAGCGAAATCATACTGGAGAAAGGCCTTATAAGTGTAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    749 AATGTGGAAAAGCCTTCAGCCTCAAATACAATGTTGTTCAACACCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102332 AATGTGGAAAAGCCTTCAGCCTCAAATACAATGTTGTTCAACACCAGAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    799 ATTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102382 ATTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAAGCTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    849 TCTTAGAAAGTCTCACCTACTTCAGCACCAGAGGATTCACACCAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102432 TCTTAGAAAGTCTCACCTACTTCAGCACCAGAGGATTCACACCAGGCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    899 GGCCTTATGTGTGTAGTGAATGTGGGAAGGCCTTCCTTACACAGGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102482 GGCCTTATGTGTGTAGTGAATGTGGGAAGGCCTTCCTTACACAGGCTCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    949 CTTGTTGGTCACCAGAAAATTCATACTGGAGAACGGCCTTATGGATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102532 CTTGTTGGTCACCAGAAAATTCATACTGGAGAACGGCCTTATGGATGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    999 TGAATGTGGGAAATACTTTATGTACAGTTCAGCACTCATTAGACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102582 TGAATGTGGGAAATACTTTATGTACAGTTCAGCACTCATTAGACATCAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1049 AAGTTCACACTGGAGAAAGGCCTTTTTATTGCTGTGAATGTGGGAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102632 AAGTTCACACTGGAGAAAGGCCTTTTTATTGCTGTGAATGTGGGAAATTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1099 TTTATGGACAGCTGCACACTCATTATTCACCAGAGAGTTCATACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102682 TTTATGGACAGCTGCACACTCATTATTCACCAGAGAGTTCATACTGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1149 AAAACCTTATGAATGCAACGAATGTGGGAAATTCTTTAGATACCGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102732 AAAACCTTATGAATGCAACGAATGTGGGAAATTCTTTAGATACCGTTCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1199 CACTCATTAGACATCAGAAAGTTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102782 CACTCATTAGACATCAGAAAGTTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1249 AGTGAATGTGGGAAGTTCTTTATGGACACTTCCACACTCATTATTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102832 AGTGAATGTGGGAAGTTCTTTATGGACACTTCCACACTCATTATTCATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1299 GAGAGTTCATACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGCAACAAATGTGGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102882 GAGAGTTCATACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGCAACAAATGTGGGAAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1349 TCTTTAGGTATTGCTTCACACTGAATAGACATCAGAGAGTTCACTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102932 TCTTTAGGTATTGCTTCACACTGAATAGACATCAGAGAGTTCACTCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1399 GAGAGGCCTTATGAATGCAGTGAATGTGGCAAATTCTTTGTGGACAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102982 GAGAGGCCTTATGAATGCAGTGAATGTGGCAAATTCTTTGTGGACAGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1449 TACACTGAAGAGTCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAGACCTTTTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103032 TACACTGAAGAGTCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAGACCTTTTGAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1499 GCAGCATTTGTGGGAAATCCTTTAGATGTCGCTCCACACTTGATACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103082 GCAGCATTTGTGGGAAATCCTTTAGATGTCGCTCCACACTTGATACACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1549 CAGAGAATTCACACTGGTGAAAGGCCTTATGAGTGTAGTGAATGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103132 CAGAGAATTCACACTGGTGAAAGGCCTTATGAGTGTAGTGAATGTGGGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1599 ATTCTTTAGGCACAACTCAAATCATATTAGACATCGGAGAAATCACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103182 ATTCTTTAGGCACAACTCAAATCATATTAGACATCGGAGAAATCACTTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1649 GAGAAAGGTCTTTTGAGTGCACTGAGTGTGGGAGAGTTTTTAGCCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103232 GAGAAAGGTCTTTTGAGTGCACTGAGTGTGGGAGAGTTTTTAGCCAAAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1699 TCCCACCTCATTCGGCACCAAAAAGTTCACACTAGGGAAAGAACTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103282 TCCCACCTCATTCGGCACCAAAAAGTTCACACTAGGGAAAGAACTTACAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1749 ATGCAGCAAATGTGGGAAATTTTTTATGGACAGCTCCACACTCATTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103332 ATGCAGCAAATGTGGGAAATTTTTTATGGACAGCTCCACACTCATTAGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1799 ATGAGAGAGTTCATACTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103382 ATGAGAGAGTTCATACTGGAGAAAAGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1849 AAAGTCTTTAGATACAACTCCAGCCTCATTAAACATCGGAGAATTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103432 AAAGTCTTTAGATACAACTCCAGCCTCATTAAACATCGGAGAATTCACAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1899 TGGAGAGAGACCTTATCAGTGCAGTGAATGTGGAAGAGTCTTTAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103482 TGGAGAGAGACCTTATCAGTGCAGTGAATGTGGAAGAGTCTTTAACCAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .
   1949 ATTCTCATCTCATTCAGCACCAGAAAGTTCACACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103532 ATTCTCATCTCATTCAGCACCAGAAAGTTCACACCAGA