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seq2 = pF1KE0078/gi568815597f_1231346.tfa (gi568815597f:1231346_1434461), 203116 bp

>pF1KE0078 2556
>gi568815597f:1231346_1434461 (Chr1)

1-191  (100001-100191)   100% ->
192-492  (100293-100593)   100% ->
493-1275  (100679-101461)   100% ->
1276-1479  (101576-101779)   100% ->
1480-1600  (101914-102034)   100% ->
1601-2556  (102161-103116)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGCCCTGCTGTCCTGGGCCTCAGCCTCTGGGCTCTCCTGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGCCCTGCTGTCCTGGGCCTCAGCCTCTGGGCTCTCCTGCACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGACGGGGGCCCCATTGTGCCTGTCACAGCAACTTAGGATGAAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGACGGGGGCCCCATTGTGCCTGTCACAGCAACTTAGGATGAAGGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTACGTGCTGGGGGGGCTGTTCCCCCTGGGCGAGGCCGAGGAGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTACGTGCTGGGGGGGCTGTTCCCCCTGGGCGAGGCCGAGGAGGCTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCGCAGCCGGACACGGCCCAGCAGCCCTGTGTGCACCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100151 CTCCGCAGCCGGACACGGCCCAGCAGCCCTGTGTGCACCAGGTA...CAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTCTCCTCAAACGGCCTGCTCTGGGCACTGGCCATGAAAATGGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100293 GTTCTCCTCAAACGGCCTGCTCTGGGCACTGGCCATGAAAATGGCCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAGATCAACAACAAGTCGGATCTGCTGCCCGGGCTGCGCCTGGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100343 AGGAGATCAACAACAAGTCGGATCTGCTGCCCGGGCTGCGCCTGGGCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCTCTTTGATACGTGCTCGGAGCCTGTGGTGGCCATGAAGCCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100393 GACCTCTTTGATACGTGCTCGGAGCCTGTGGTGGCCATGAAGCCCAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGTTCCTGGCCAAGGCAGGCAGCCGCGACATCGCCGCCTACTGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100443 CATGTTCCTGGCCAAGGCAGGCAGCCGCGACATCGCCGCCTACTGCAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACACGCAGTACCAGCCCCGTGTGCTGGCTGTCATCGGGCCCCACTCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100493 ACACGCAGTACCAGCCCCGTGTGCTGGCTGTCATCGGGCCCCACTCGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGCTCGCCATGGTCACCGGCAAGTTCTTCAGCTTCTTCCTCATGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100543 GAGCTCGCCATGGTCACCGGCAAGTTCTTCAGCTTCTTCCTCATGCCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 G         GTCAGCTACGGTGCTAGCATGGAGCTGCTGAGCGCCCGGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100593 GGTG...CAGGTCAGCTACGGTGCTAGCATGGAGCTGCTGAGCGCCCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGACCTTCCCCTCCTTCTTCCGCACCGTGCCCAGCGACCGTGTGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100719 AGACCTTCCCCTCCTTCTTCCGCACCGTGCCCAGCGACCGTGTGCAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACGGCCGCCGCGGAGCTGCTGCAGGAGTTCGGCTGGAACTGGGTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100769 ACGGCCGCCGCGGAGCTGCTGCAGGAGTTCGGCTGGAACTGGGTGGCCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTGGGCAGCGACGACGAGTACGGCCGGCAGGGCCTGAGCATCTTCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100819 CCTGGGCAGCGACGACGAGTACGGCCGGCAGGGCCTGAGCATCTTCTCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCCTGGCCGCGGCACGCGGCATCTGCATCGCGCACGAGGGCCTGGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100869 CCCTGGCCGCGGCACGCGGCATCTGCATCGCGCACGAGGGCCTGGTGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGCCCCGTGCCGATGACTCGCGGCTGGGGAAGGTGCAGGACGTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100919 CTGCCCCGTGCCGATGACTCGCGGCTGGGGAAGGTGCAGGACGTCCTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCAGGTGAACCAGAGCAGCGTGCAGGTGGTGCTGCTGTTCGCCTCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100969 CCAGGTGAACCAGAGCAGCGTGCAGGTGGTGCTGCTGTTCGCCTCCGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACGCCGCCCACGCCCTCTTCAACTACAGCATCAGCAGCAGGCTCTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101019 ACGCCGCCCACGCCCTCTTCAACTACAGCATCAGCAGCAGGCTCTCGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AAGGTGTGGGTGGCCAGCGAGGCCTGGCTGACCTCTGACCTGGTCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101069 AAGGTGTGGGTGGCCAGCGAGGCCTGGCTGACCTCTGACCTGGTCATGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GCTGCCCGGCATGGCCCAGATGGGCACGGTGCTTGGCTTCCTCCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101119 GCTGCCCGGCATGGCCCAGATGGGCACGGTGCTTGGCTTCCTCCAGAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTGCCCAGCTGCACGAGTTCCCCCAGTACGTGAAGACGCACCTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101169 GTGCCCAGCTGCACGAGTTCCCCCAGTACGTGAAGACGCACCTGGCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCCACCGACCCGGCCTTCTGCTCTGCCCTGGGCGAGAGGGAGCAGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101219 GCCACCGACCCGGCCTTCTGCTCTGCCCTGGGCGAGAGGGAGCAGGGTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGAGGAGGACGTGGTGGGCCAGCGCTGCCCGCAGTGTGACTGCATCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101269 GGAGGAGGACGTGGTGGGCCAGCGCTGCCCGCAGTGTGACTGCATCACGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TGCAGAACGTGAGCGCAGGGCTAAATCACCACCAGACGTTCTCTGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101319 TGCAGAACGTGAGCGCAGGGCTAAATCACCACCAGACGTTCTCTGTCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GCAGCTGTGTATAGCGTGGCCCAGGCCCTGCACAACACTCTTCAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101369 GCAGCTGTGTATAGCGTGGCCCAGGCCCTGCACAACACTCTTCAGTGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 CGCCTCAGGCTGCCCCGCGCAGGACCCCGTGAAGCCCTGGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101419 CGCCTCAGGCTGCCCCGCGCAGGACCCCGTGAAGCCCTGGCAGGTG...C

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1276   CTCCTGGAGAACATGTACAACCTGACCTTCCACGTGGGCGGGCTGCCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101574 AGCTCCTGGAGAACATGTACAACCTGACCTTCCACGTGGGCGGGCTGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CTGCGGTTCGACAGCAGCGGAAACGTGGACATGGAGTACGACCTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101624 CTGCGGTTCGACAGCAGCGGAAACGTGGACATGGAGTACGACCTGAAGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GTGGGTGTGGCAGGGCTCAGTGCCCAGGCTCCACGACGTGGGCAGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101674 GTGGGTGTGGCAGGGCTCAGTGCCCAGGCTCCACGACGTGGGCAGGTTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ACGGCAGCCTCAGGACAGAGCGCCTGAAGATCCGCTGGCACACGTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101724 ACGGCAGCCTCAGGACAGAGCGCCTGAAGATCCGCTGGCACACGTCTGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AACCAG         AAGCCCGTGTCCCGGTGCTCGCGGCAGTGCCAGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101774 AACCAGGTG...CAGAAGCCCGTGTCCCGGTGCTCGCGGCAGTGCCAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GGGCCAGGTGCGCCGGGTCAAGGGGTTCCACTCCTGCTGCTACGACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101949 GGGCCAGGTGCGCCGGGTCAAGGGGTTCCACTCCTGCTGCTACGACTGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TGGACTGCGAGGCGGGCAGCTACCGGCAAAACCCAG         ACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101999 TGGACTGCGAGGCGGGCAGCTACCGGCAAAACCCAGGTG...CAGACGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 ATCGCCTGCACCTTTTGTGGCCAGGATGAGTGGTCCCCGGAGCGAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102166 ATCGCCTGCACCTTTTGTGGCCAGGATGAGTGGTCCCCGGAGCGAAGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 ACGCTGCTTCCGCCGCAGGTCTCGGTTCCTGGCATGGGGCGAGCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102216 ACGCTGCTTCCGCCGCAGGTCTCGGTTCCTGGCATGGGGCGAGCCGGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGAGCCTGGCGCTGGGCCTTGTGCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102266 TGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGAGCCTGGCGCTGGGCCTTGTGCTGGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GCTTTGGGGCTGTTCGTTCACCATCGGGACAGCCCACTGGTTCAGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102316 GCTTTGGGGCTGTTCGTTCACCATCGGGACAGCCCACTGGTTCAGGCCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 GGGGGGGCCCCTGGCCTGCTTTGGCCTGGTGTGCCTGGGCCTGGTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102366 GGGGGGGCCCCTGGCCTGCTTTGGCCTGGTGTGCCTGGGCCTGGTCTGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 TCAGCGTCCTCCTGTTCCCTGGCCAGCCCAGCCCTGCCCGATGCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102416 TCAGCGTCCTCCTGTTCCCTGGCCAGCCCAGCCCTGCCCGATGCCTGGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 CAGCAGCCCTTGTCCCACCTCCCGCTCACGGGCTGCCTGAGCACACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102466 CAGCAGCCCTTGTCCCACCTCCCGCTCACGGGCTGCCTGAGCACACTCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CCTGCAGGCGGCCGAGATCTTCGTGGAGTCAGAACTGCCTCTGAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102516 CCTGCAGGCGGCCGAGATCTTCGTGGAGTCAGAACTGCCTCTGAGCTGGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 CAGACCGGCTGAGTGGCTGCCTGCGGGGGCCCTGGGCCTGGCTGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102566 CAGACCGGCTGAGTGGCTGCCTGCGGGGGCCCTGGGCCTGGCTGGTGGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 CTGCTGGCCATGCTGGTGGAGGTCGCACTGTGCACCTGGTACCTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102616 CTGCTGGCCATGCTGGTGGAGGTCGCACTGTGCACCTGGTACCTGGTGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 CTTCCCGCCGGAGGTGGTGACGGACTGGCACATGCTGCCCACGGAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102666 CTTCCCGCCGGAGGTGGTGACGGACTGGCACATGCTGCCCACGGAGGCGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TGGTGCACTGCCGCACACGCTCCTGGGTCAGCTTCGGCCTAGCGCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102716 TGGTGCACTGCCGCACACGCTCCTGGGTCAGCTTCGGCCTAGCGCACGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 ACCAATGCCACGCTGGCCTTTCTCTGCTTCCTGGGCACTTTCCTGGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102766 ACCAATGCCACGCTGGCCTTTCTCTGCTTCCTGGGCACTTTCCTGGTGCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 GAGCCAGCCGGGCCGCTACAACCGTGCCCGTGGCCTCACCTTTGCCATGC
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102816 GAGCCAGCCGGGCTGCTACAACCGTGCCCGTGGCCTCACCTTTGCCATGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 TGGCCTACTTCATCACCTGGGTCTCCTTTGTGCCCCTCCTGGCCAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102866 TGGCCTACTTCATCACCTGGGTCTCCTTTGTGCCCCTCCTGGCCAATGTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2356 CAGGTGGTCCTCAGGCCCGCCGTGCAGATGGGCGCCCTCCTGCTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102916 CAGGTGGTCCTCAGGCCCGCCGTGCAGATGGGCGCCCTCCTGCTCTGTGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2406 CCTGGGCATCCTGGCTGCCTTCCACCTGCCCAGGTGTTACCTGCTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102966 CCTGGGCATCCTGGCTGCCTTCCACCTGCCCAGGTGTTACCTGCTCATGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2456 GGCAGCCAGGGCTCAACACCCCCGAGTTCTTCCTGGGAGGGGGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103016 GGCAGCCAGGGCTCAACACCCCCGAGTTCTTCCTGGGAGGGGGCCCTGGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2506 GATGCCCAAGGCCAGAATGACGGGAACACAGGAAATCAGGGGAAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103066 GATGCCCAAGGCCAGAATGACGGGAACACAGGAAATCAGGGGAAACATGA

   2600 
   2556 G
        |
 103116 G