seq1 = pF1KE0070.tfa, 1680 bp
seq2 = pF1KE0070/gi568815595r_194296603.tfa (gi568815595r:194296603_194498282), 201680 bp

>pF1KE0070 1680
>gi568815595r:194296603_194498282 (Chr3)

(complement)

1-1680  (100001-101680)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAGGGGGACTCTACTGTGCGCGGTGCTCGGGCTTCTGCGCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGAGGGGGACTCTACTGTGCGCGGTGCTCGGGCTTCTGCGCGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCTTCCCCTGTCCGCCAGCTTGCAAGTGTGTCTTCCGGGACGCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCTTCCCCTGTCCGCCAGCTTGCAAGTGTGTCTTCCGGGACGCCGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGCTCGGGGGGCGACGTGGCGCGCATCTCCGCGCTAGGCCTGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGCTCGGGGGGCGACGTGGCGCGCATCTCCGCGCTAGGCCTGCCCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCTCACGCACATCCTGCTCTTCGGAATGGGCCGCGGCGTCCTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACCTCACGCACATCCTGCTCTTCGGAATGGGCCGCGGCGTCCTGCAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAGAGCTTCAGCGGCATGACCGTCCTGCAGCGCCTCATGATCTCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGAGCTTCAGCGGCATGACCGTCCTGCAGCGCCTCATGATCTCCGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCACATTTCCGCCGTTGCCCCCGGCACCTTCAGTGACCTGATAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCACATTTCCGCCGTTGCCCCCGGCACCTTCAGTGACCTGATAAAACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAACCCTGAGGCTGTCGCGCAACAAAATCACGCATCTTCCAGGTGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAACCCTGAGGCTGTCGCGCAACAAAATCACGCATCTTCCAGGTGCGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGATAAGATGGTGCTCCTGGAGCAGTTGTTTTTGGACCACAATGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGATAAGATGGTGCTCCTGGAGCAGTTGTTTTTGGACCACAATGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAAGGGGCATTGACCAAAACATGTTTCAGAAACTGGTTAACCTGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAAGGGGCATTGACCAAAACATGTTTCAGAAACTGGTTAACCTGCAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCGCTCTGAACCAGAATCAGCTCGATTTCCTTCCTGCCAGTCTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCGCTCTGAACCAGAATCAGCTCGATTTCCTTCCTGCCAGTCTCTTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATCTGGAGAACCTGAAGTTGTTGGATTTATCGGGAAACAACCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATCTGGAGAACCTGAAGTTGTTGGATTTATCGGGAAACAACCTGACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTGCCCAAGGGGTTGCTTGGAGCACAGGCTAAGCTCGAGAGACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTGCCCAAGGGGTTGCTTGGAGCACAGGCTAAGCTCGAGAGACTTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCCACTCGAACCGCCTTGTGTCTCTGGATTCGGGGCTGTTGAACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCCACTCGAACCGCCTTGTGTCTCTGGATTCGGGGCTGTTGAACAGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGCGCCCTGACGGAGCTGCAGTTCCACCGAAATCACATCCGTTCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGCGCCCTGACGGAGCTGCAGTTCCACCGAAATCACATCCGTTCCATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CACCCGGGGCCTTCGACCGGCTCCCAAACCTCAGTTCTTTGACGCTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CACCCGGGGCCTTCGACCGGCTCCCAAACCTCAGTTCTTTGACGCTTTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGAAACCACCTTGCGTTTCTCCCCTCTGCGCTCTTTCTTCATTCGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGAAACCACCTTGCGTTTCTCCCCTCTGCGCTCTTTCTTCATTCGCACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTGACTCTGTTGACTCTGTTCGAGAACCCGCTGGCAGAGCTCCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTGACTCTGTTGACTCTGTTCGAGAACCCGCTGGCAGAGCTCCCGGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTCTTCGGGGAGATGGGGGGCCTGCAGGAGCTGTGGCTGAACCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTCTTCGGGGAGATGGGGGGCCTGCAGGAGCTGTGGCTGAACCGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGCTGCGCACCCTGCCCGCCGCCGCCTTCCGCAACCTGAGCCGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGCTGCGCACCCTGCCCGCCGCCGCCTTCCGCAACCTGAGCCGCCTGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTACTTAGGGGTGACTCTGAGCCCGCGGCTGAGCGCGCTTCCGCAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTACTTAGGGGTGACTCTGAGCCCGCGGCTGAGCGCGCTTCCGCAGGGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTTCCAGGGCCTTGGCGAGCTCCAGGTGCTCGCCCTGCACTCCAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTTCCAGGGCCTTGGCGAGCTCCAGGTGCTCGCCCTGCACTCCAACGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGACCGCCCTCCCCGACGGCTTGCTGCGCGGCCTCGGCAAGCTGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTGACCGCCCTCCCCGACGGCTTGCTGCGCGGCCTCGGCAAGCTGCGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGTGTCCCTGCGCCGCAACAGGCTGCGCGCCCTGCCCCGTGCCCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGTGTCCCTGCGCCGCAACAGGCTGCGCGCCCTGCCCCGTGCCCTCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCAATCTCAGCAGCCTGGAGAGCGTCCAGCTCGACCACAACCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCAATCTCAGCAGCCTGGAGAGCGTCCAGCTCGACCACAACCAGCTGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACCCTGCCTGGCGACGTGTTTGGGGCTCTGCCCCGGCTGACGGAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCCTGCCTGGCGACGTGTTTGGGGCTCTGCCCCGGCTGACGGAGGTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GTTGGGGCACAACTCCTGGCGCTGCGACTGTGGCCTGGGGCCCTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GTTGGGGCACAACTCCTGGCGCTGCGACTGTGGCCTGGGGCCCTTCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GGTGGCTGCGGCAGCACCTAGGCCTCGTGGGCGGGGAAGAGCCCCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GGTGGCTGCGGCAGCACCTAGGCCTCGTGGGCGGGGAAGAGCCCCCACGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGCGCAGGCCCTGGGGCGCACGCCGGCCTGCCGCTCTGGGCCCTGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TGCGCAGGCCCTGGGGCGCACGCCGGCCTGCCGCTCTGGGCCCTGCCGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGGTGACGCGGAGTGCCCGGGCCCCCGGGGCCCGCCTCCCCGCCCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGGTGACGCGGAGTGCCCGGGCCCCCGGGGCCCGCCTCCCCGCCCCGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CGGACAGCTCCTCGGAAGCCCCTGTCCACCCAGCCTTGGCTCCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CGGACAGCTCCTCGGAAGCCCCTGTCCACCCAGCCTTGGCTCCCAACAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TCAGAACCCTGGGTGTGGGCCCAGCCGGTGACCACGGGCAAAGGTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TCAGAACCCTGGGTGTGGGCCCAGCCGGTGACCACGGGCAAAGGTCAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCATAGTCCGTTCTGGGGGTTTTATTTTCTGCTTTTAGCTGTTCAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCATAGTCCGTTCTGGGGGTTTTATTTTCTGCTTTTAGCTGTTCAGGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGATCACCGTGATCATCGTGTTTGCTATGATTAAAATTGGCCAACTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGATCACCGTGATCATCGTGTTTGCTATGATTAAAATTGGCCAACTCTTT

   1650     .    :    .    :    .    :
   1651 CGAAAATTAATCAGAGAGAGAGCCCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CGAAAATTAATCAGAGAGAGAGCCCTTGGG