seq1 = pF1KE0066.tfa, 2679 bp
seq2 = pF1KE0066/gi568815591r_158634210.tfa (gi568815591r:158634210_158821424), 187215 bp

>pF1KE0066 2679
>gi568815591r:158634210_158821424 (Chr7)

(complement)

467-516  (22345-22394)   96% ->
517-651  (23349-23483)   100% ->
652-728  (27699-27775)   100% ->
729-801  (33008-33080)   100% ->
802-891  (33332-33421)   100% ->
892-947  (48029-48084)   100% ->
948-1068  (53651-53771)   100% ->
1069-1245  (56572-56748)   100% ->
1246-1328  (58260-58342)   100% ->
1329-1377  (59881-59929)   100% ->
1378-1467  (61278-61367)   100% ->
1468-1563  (61844-61939)   100% ->
1564-1638  (71702-71776)   100% ->
1639-1725  (73145-73231)   100% ->
1726-1875  (77747-77896)   100% ->
1876-2249  (79529-79902)   100% ->
2250-2348  (82304-82402)   100% ->
2349-2480  (84246-84377)   100% ->
2481-2586  (85817-85922)   98% ->
2587-2636  (86954-87003)   100% ->
2637-2679  (87173-87215)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    467 CCGCCTGGGTTCATTTTCCAGACACTGAAAGAGCAGAATGGCTAAATAAG
        || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22345 CCTCCTAGGTTCATTTTCCAGACACTGAAAGAGCAGAATGGCTAAATAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    517          ACTGTAAAACACATGTGGCCTTTCATTTGCCAATTTATAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22395 GTA...CAGACTGTAAAACACATGTGGCCTTTCATTTGCCAATTTATAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    558 GAAGTTGTTTCGAGAAACTATAGAACCAGCCGTGCGGGGAGCAAACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  23390 GAAGTTGTTTCGAGAAACTATAGAACCAGCCGTGCGGGGAGCAAACACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    608 ACCTTAGCACCTTTAGTTTCACGAAGGTCGACGTGGGCCAGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
  23440 ACCTTAGCACCTTTAGTTTCACGAAGGTCGACGTGGGCCAGCAGGTC...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    652    CCCCTCAGGATCAATGGTGTTAAGGTATACACTGAAAATGTAGACAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  27696 CAGCCCCTCAGGATCAATGGTGTTAAGGTATACACTGAAAATGTAGACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    699 AAGGCAAATTATTTTGGACCTTCAGATTAG         TTTTGTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  27746 AAGGCAAATTATTTTGGACCTTCAGATTAGGTA...TAGTTTTGTAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    740 ATTGTGAGATTGATTTGGAGATCAAACGATATTTTTGTAGAGCTGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33019 ATTGTGAGATTGATTTGGAGATCAAACGATATTTTTGTAGAGCTGGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    790 AAAAGTATCCAG         ATTCATGGTACCATGCGGGTGATCCTGGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
  33069 AAAAGTATCCAGGTA...TAGATTCATGGTACCATGCGGGTGATCCTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    831 ACCGTTGATTGGAGATATGCCCTTAGTTGGAGCTTTGTCTATCTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33361 ACCGTTGATTGGAGATATGCCCTTAGTTGGAGCTTTGTCTATCTTCTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    881 TTAGGAAACCA         CTTTTAGAAATTAACTGGACAGGACTGACG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
  33411 TTAGGAAACCAGTA...CAGCTTTTAGAAATTAACTGGACAGGACTGACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    922 AATCTTCTGGATGTCCCTGGATTGAA         TGGTTTATCAGATAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  48059 AATCTTCTGGATGTCCCTGGATTGAAGTA...CAGTGGTTTATCAGATAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    963 TATCATTTTGGATATAATATCAAACTATCTGGTGCTTCCCAATCGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  53666 TATCATTTTGGATATAATATCAAACTATCTGGTGCTTCCCAATCGAATCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1013 CCGTTCCACTTGTCAGTGAAGTTCAAATAGCTCAGTTGCGGTTTCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  53716 CCGTTCCACTTGTCAGTGAAGTTCAAATAGCTCAGTTGCGGTTTCCTGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1063 CCAAAG         GGTGTTCTAAGGATACATTTTATTGAAGCTCAGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  53766 CCAAAGGTA...CAGGGTGTTCTAAGGATACATTTTATTGAAGCTCAGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1104 TCTTCAGGGGAAAGACACTTACCTTAAGGGACTTGTCAAGGGAAAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56607 TCTTCAGGGGAAAGACACTTACCTTAAGGGACTTGTCAAGGGAAAGTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1154 ACCCCTATGGAATCATTAGAGTTGGCAACCAAATCTTCCAAAGCAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  56657 ACCCCTATGGAATCATTAGAGTTGGCAACCAAATCTTCCAAAGCAGAGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1204 ATCAAGGAGAACCTCAGTCCAAAGTGGAATGAAGTCTATGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  56707 ATCAAGGAGAACCTCAGTCCAAAGTGGAATGAAGTCTATGAGGTG...TA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1246  GCTTTAGTGTATGAACATCCTGGACAAGAATTAGAGATTGAGCTCTTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  58259 GGCTTTAGTGTATGAACATCCTGGACAAGAATTAGAGATTGAGCTCTTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1295 ATGAAGACCCAGACAAGGATGACTTTTTAGGAAG         TCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  58309 ATGAAGACCCAGACAAGGATGACTTTTTAGGAAGGTA...TAGTCTTATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1336 ATTGACCTCATTGAAGTTGAAAAGGAGCGCCTTTTAGATGAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  59888 ATTGACCTCATTGAAGTTGAAAAGGAGCGCCTTTTAGATGAAGTA...CA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1378  TGGTTCACTCTGGACGAGGTTCCCAAGGGGAAGCTACACTTGAGACTGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  61277 GTGGTTCACTCTGGACGAGGTTCCCAAGGGGAAGCTACACTTGAGACTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1427 AGTGGCTCACGTTAATGCCAAATGCGTCAAACCTCGACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
  61327 AGTGGCTCACGTTAATGCCAAATGCGTCAAACCTCGACAAGGTG...TAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1468 GTGCTAACAGACATCAAAGCTGACAAAGACCAAGCCAACGATGGTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  61844 GTGCTAACAGACATCAAAGCTGACAAAGACCAAGCCAACGATGGTCTTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1518 CTCTGCATTGCTGATCTTGTACTTGGATTCAGCAAGGAACCTTCCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
  61894 CTCTGCATTGCTGATCTTGTACTTGGATTCAGCAAGGAACCTTCCGGTA.

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1564      TCAGGGAAGAAAATAAGCAGCAACCCAAATCCTGTTGTCCAGATG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  61944 ..TAGTCAGGGAAGAAAATAAGCAGCAACCCAAATCCTGTTGTCCAGATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1609 TCAGTTGGGCACAAGGCCCAGGAGAGCAAG         ATTCGATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  71747 TCAGTTGGGCACAAGGCCCAGGAGAGCAAGGTA...TAGATTCGATACAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1650 AACCAATGAACCTGTGTGGGAGGAAAACTTCACTTTCTTCATTCACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  73156 AACCAATGAACCTGTGTGGGAGGAAAACTTCACTTTCTTCATTCACAATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1700 CCAAGCGCCAGGACCTTGAAGTTGAG         GTCAGAGACGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  73206 CCAAGCGCCAGGACCTTGAAGTTGAGGTA...CAGGTCAGAGACGAGCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1741 CACCAGTGTTCCCTGGGGAACCTGAAGGTCCCCCTCAGCCAGCTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77762 CACCAGTGTTCCCTGGGGAACCTGAAGGTCCCCCTCAGCCAGCTGCTCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1791 CAGTGAGGACATGACTGTGAGCCAGCGCTTCCAGCTCAGTAACTCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77812 CAGTGAGGACATGACTGTGAGCCAGCGCTTCCAGCTCAGTAACTCGGGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1841 CAAACAGCACCATCAAGATGAAGATTGCCCTGCGG         GTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  77862 CAAACAGCACCATCAAGATGAAGATTGCCCTGCGGGTA...TAGGTGCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1882 CATCTCGAAAAGCGAGAAAGGCCTCCAGACCACCAACACTCAGCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79535 CATCTCGAAAAGCGAGAAAGGCCTCCAGACCACCAACACTCAGCTCAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1932 CAAACGTCCCTCTGTGTCCAAAGAGGGGAGGAAAACATCCATCAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79585 CAAACGTCCCTCTGTGTCCAAAGAGGGGAGGAAAACATCCATCAAATCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1982 ATATGTCTGGGTCTCCAGGCCCTGGTGGCAGCAACACAGCTCCATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79635 ATATGTCTGGGTCTCCAGGCCCTGGTGGCAGCAACACAGCTCCATCCACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2032 CCAGTCATTGGGGGCAGTGATAAGCCTGGTATGGAAGAAAAGGCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79685 CCAGTCATTGGGGGCAGTGATAAGCCTGGTATGGAAGAAAAGGCCCAGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2082 CCCTGAGGCCGGCCCTCAGGGGCTGCACGACCTGGGCAGAAGCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79735 CCCTGAGGCCGGCCCTCAGGGGCTGCACGACCTGGGCAGAAGCTCCTCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2132 GCCTCCTGGCCTCCCCAGGCCACATCTCAGTCAAGGAGCCGACCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79785 GCCTCCTGGCCTCCCCAGGCCACATCTCAGTCAAGGAGCCGACCCCCAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2182 ATCGCCTCGGACATCTCGCTGCCCATCGCCACCCAGGAGCTGCGGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79835 ATCGCCTCGGACATCTCGCTGCCCATCGCCACCCAGGAGCTGCGGCAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2232 GCTGAGGCAGCTGGAAAA         CGGGACGACCCTGGGACAGTCTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  79885 GCTGAGGCAGCTGGAAAAGTA...CAGCGGGACGACCCTGGGACAGTCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2273 CACTGGGGCAGATCCAGCTGACCATCCGGCACAGCTCGCAGAGAAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  82327 CACTGGGGCAGATCCAGCTGACCATCCGGCACAGCTCGCAGAGAAACAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2323 CTTATCGTGGTCGTGCATGCCTGCAG         AAACCTCATTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  82377 CTTATCGTGGTCGTGCATGCCTGCAGGTG...AAGAAACCTCATTGCCTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2364 CTCTGAAGACGGCTCTGACCCCTATGTCCGCATGTATTTATTACCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  84261 CTCTGAAGACGGCTCTGACCCCTATGTCCGCATGTATTTATTACCAGACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2414 AGAGGCGGTCAGGAAGGAGGAAAACACACGTGTCAAAGAAAACATTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  84311 AGAGGCGGTCAGGAAGGAGGAAAACACACGTGTCAAAGAAAACATTAAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2464 CCAGTGTTTGATCAAAG         CTTTGATTTCAGTGTTTCGTTACC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  84361 CCAGTGTTTGATCAAAGGTA...CAGCTTTGATTTCAGTGTTTCGTTACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2505 AGAAGTCCAGAGGAGAACGCTTGACGTTGCCGTGAAGAACAGTGGCGGCT
        |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  85841 AGAAGTGCAGAGGAGAACGCTCGACGTTGCCGTGAAGAACAGTGGCGGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2555 TCCTGTCCAAAGACAAAGGGCTCCTTGGCAAA         GTATTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  85891 TCCTGTCCAAAGACAAAGGGCTCCTTGGCAAAGTA...CAGGTATTGGTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2596 GCTCTGGCATCTGAAGAACTTGCCAAAGGCTGGACCCAGTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
  86963 GCTCTGGCATCTGAAGAACTTGCCAAAGGCTGGACCCAGTGGTG...CAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :
   2637 GTATGACCTCACGGAAGATGGGACGAGGCCTCAGGCGATGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  87173 GTATGACCTCACGGAAGATGGGACGAGGCCTCAGGCGATGACA