seq1 = pF1KE0060.tfa, 1725 bp
seq2 = pF1KE0060/gi568815590r_25750594.tfa (gi568815590r:25750594_26144859), 394266 bp

>pF1KE0060 1725
>gi568815590r:25750594_26144859 (Chr8)

(complement)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-288  (102609-102765)   100% ->
289-352  (103858-103921)   100% ->
353-408  (104189-104244)   100% ->
409-482  (104759-104832)   100% ->
483-551  (111707-111775)   100% ->
552-633  (236305-236386)   100% ->
634-751  (254991-255108)   100% ->
752-882  (256888-257018)   100% ->
883-1009  (257979-258105)   100% ->
1010-1098  (282063-282151)   100% ->
1099-1164  (283486-283551)   100% ->
1165-1342  (283634-283811)   100% ->
1343-1528  (286356-286541)   100% ->
1529-1696  (294099-294266)   100% ->
1697-1725  (300220-300248)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTGGAATTCAAGATACTTTAGGAAGAGGACCAACTCTGAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTGGAATTCAAGATACTTTAGGAAGAGGACCAACTCTGAAAGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCGCTGGGCGCGGAGATGGATTCGGTCAGGTCCTGGGTCCGGAATGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCGCTGGGCGCGGAGATGGATTCGGTCAGGTCCTGGGTCCGGAATGTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGTGGTGGACGCTAATGTCGCCGCGCAGAG         CGGGGTCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 GAGTGGTGGACGCTAATGTCGCCGCGCAGAGGTA...CAGCGGGGTCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGTCCCGGGCCCACTTTGAGAAACAGCCTCCTTCCAACTTGAGGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102619 CTGTCCCGGGCCCACTTTGAGAAACAGCCTCCTTCCAACTTGAGGAAATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACTTCTTTCACTTCGTCCTGGCGCTCTATGACAGGCAGGGCCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102669 CAACTTCTTTCACTTCGTCCTGGCGCTCTATGACAGGCAGGGCCAGCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGATCGAGCGGACGGCCTTCGTGGACTTTGTGGAGAATGACAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102719 TGGAGATCGAGCGGACGGCCTTCGTGGACTTTGTGGAGAATGACAAAGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       GAACAAGGCAACGAGAAGACCAACAACGGCACTCACTACAAGTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102769 ...CAGGAACAAGGCAACGAGAAGACCAACAACGGCACTCACTACAAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACAGCTCCTCTACAGCAACG         GTGTCCGCACGGAACAGGACC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103902 ACAGCTCCTCTACAGCAACGGTG...CAGGTGTCCGCACGGAACAGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTATGTCAGGCTCATCGACTCGGTCACCAAGCAG         CCCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104210 TCTATGTCAGGCTCATCGACTCGGTCACCAAGCAGGTG...CAGCCCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTTACGAGGGACAGAATAAGAATCCGGAAATGTGCCGAGTTCTCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104765 GCTTACGAGGGACAGAATAAGAATCCGGAAATGTGCCGAGTTCTCCTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCACGAAGTGATGTGTAG         TCGATGCTGCGAAAAGAAAAGCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104815 GCACGAAGTGATGTGTAGGTA...CAGTCGATGCTGCGAAAAGAAAAGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGGAAACCGAAATGAGACTCCATCGGACCCAGTCATAATTGACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 111730 GTGGAAACCGAAATGAGACTCCATCGGACCCAGTCATAATTGACAGGTA.

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    552      ATTCTTTTTAAAATTTTTCCTCAAGTGCAATCAGAATTGTTTGAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111780 ..CAGATTCTTTTTAAAATTTTTCCTCAAGTGCAATCAGAATTGTTTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AACAGCAGGAAACCCAAGGGACATGAGACGGTTTCAG         GTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 236350 AACAGCAGGAAACCCAAGGGACATGAGACGGTTTCAGGTA...CAGGTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TGTTGTCAACAACGGTGAATGTGGATGGACACGTCCTGGCTGTTTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 254995 TGTTGTCAACAACGGTGAATGTGGATGGACACGTCCTGGCTGTTTCTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AACATGTTTGTTCATAACAACTCCAAGCATGGACGGAGAGCAAGAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255045 AACATGTTTGTTCATAACAACTCCAAGCATGGACGGAGAGCAAGAAGACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CGATCCATCGGAAG         CTACCCCCTGCATCAAAGCCATTAGCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 255095 CGATCCATCGGAAGGTA...TAGCTACCCCCTGCATCAAAGCCATTAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CGAGTGAAGGCTGGACCACAGGAGGAGCCATGGTCATCATCATCGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256915 CGAGTGAAGGCTGGACCACAGGAGGAGCCATGGTCATCATCATCGGGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AACTTCTTTGATGGTCTCCAAGTGGTGTTTGGGACTATGCTTGTATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256965 AACTTCTTTGATGGTCTCCAAGTGGTGTTTGGGACTATGCTTGTATGGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CGAG         CTAATAACCCCTCATGCCATCAGAGTACAGACTCCTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257015 CGAGGTA...CAGCTAATAACCCCTCATGCCATCAGAGTACAGACTCCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCCGGCACATCCCAGGCGTGGTAGAGGTGACATTATCTTATAAATCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258016 CCCGGCACATCCCAGGCGTGGTAGAGGTGACATTATCTTATAAATCTAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CAGTTCTGCAAAGGAGCCCCAGGAAGGTTCATTTACACAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 258066 CAGTTCTGCAAAGGAGCCCCAGGAAGGTTCATTTACACAGGTA...CAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 ATTAAATGAACCCACCATAGACTATGGCTTCCAGAGACTGCAGAAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282064 ATTAAATGAACCCACCATAGACTATGGCTTCCAGAGACTGCAGAAGGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCCCTAGGCATCCTGGAGATCCTGAGAGATTAGCTAAG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 282114 TCCCTAGGCATCCTGGAGATCCTGAGAGATTAGCTAAGGTA...CAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ATGCTGTTGAAAAGAGCTGCAGATCTAGTGGAAGCTCTTTATGGCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283489 ATGCTGTTGAAAAGAGCTGCAGATCTAGTGGAAGCTCTTTATGGCACACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 ACACAATAACCAG         GACATCATTTTGAAGCGAGCCGCAGACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 283539 ACACAATAACCAGGTG...TAGGACATCATTTTGAAGCGAGCCGCAGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TTGCTGAAGCTCTCTACAGCGTCCCCAGGAATCCCAGCCAGCTTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283662 TTGCTGAAGCTCTCTACAGCGTCCCCAGGAATCCCAGCCAGCTTCCAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTCTCTAGCTCCCCAGCGCACAGTGGCATGATGGGAATCAACTCCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283712 CTCTCTAGCTCCCCAGCGCACAGTGGCATGATGGGAATCAACTCCTATGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CAGCCAGCTTGGGGTCAGCATCTCAGAGTCAACACAAGGAAATAATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283762 CAGCCAGCTTGGGGTCAGCATCTCAGAGTCAACACAAGGAAATAATCAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343          GGTACATCCGCAACACAAGCAGCATCTCTCCGCGGGGATAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283812 GTA...AAGGGTACATCCGCAACACAAGCAGCATCTCTCCGCGGGGATAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TCTTCCAGCTCCACGCCTCAACAGTCTAATTACAGTACCTCCAGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286397 TCTTCCAGCTCCACGCCTCAACAGTCTAATTACAGTACCTCCAGCAACAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TATGAATGGCTACAGCAATGTCCCCATGGCCAACTTGGGTGTTCCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286447 TATGAATGGCTACAGCAATGTCCCCATGGCCAACTTGGGTGTTCCAGGTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CACCAGGATTTCTAAATGGCTCACCCACCGGCTCTCCTTATGGAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 286497 CACCAGGATTTCTAAATGGCTCACCCACCGGCTCTCCTTATGGAAGTA..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529     TCATGTCATCAAGTCCCACCGTTGGGTCTTCCAGCACATCCTCCAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 286547 .CAGTCATGTCATCAAGTCCCACCGTTGGGTCTTCCAGCACATCCTCCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CCTCCCATTTTCCTCTTCAGTTTTTCCTGCTGTCAAACAGAAGAGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294145 CCTCCCATTTTCCTCTTCAGTTTTTCCTGCTGTCAAACAGAAGAGTGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TTGCCCCTGTCATCAGGCCCCAAGGCTCCCCTTCACCTGCCTGCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294195 TTGCCCCTGTCATCAGGCCCCAAGGCTCCCCTTCACCTGCCTGCTCCAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GGCAATGGAAATGGATTCAGAG         CCATGACCGGACTTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 294245 GGCAATGGAAATGGATTCAGAGGTA...CAGCCATGACCGGACTTGTTGT

   1850     .    :
   1716 ACCCCCGATG
        ||||||||||
 300239 ACCCCCGATG