seq1 = pF1KE0059.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KE0059/gi568815579f_37135547.tfa (gi568815579f:37135547_37343661), 208115 bp

>pF1KE0059 1425
>gi568815579f:37135547_37343661 (Chr19)

1-136  (99993-100129)   97% ->
137-232  (100433-100528)   100% ->
233-1425  (106923-108115)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GGCTGAGGGATCAGTGATGTTCAGTGATGTGTCCATAGACTTCTCTC
        ||-|  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 ATTGTTTCAGGGATCAGTGATGTTCAGTGATGTGTCCATAGACTTCTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 AGGAGGAGTGGGACTGCCTGGACCCTGTTCAGAGGGACTTATACAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100043 AGGAGGAGTGGGACTGCCTGGACCCTGTTCAGAGGGACTTATACAGAGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 GTGATGTTGGAGAACTACGGCAATCTGGTTTCAATGG         GACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100093 GTGATGTTGGAGAACTACGGCAATCTGGTTTCAATGGGTA...CAGGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 TTACACTCCTAAGCCTCAAGTGATCTCCTTATTGGAACAAGGGAAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100437 TTACACTCCTAAGCCTCAAGTGATCTCCTTATTGGAACAAGGGAAAGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 CCTGGATGGTTGGCAGAGAGCTTACAAGAGGCCTGTGTTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100487 CCTGGATGGTTGGCAGAGAGCTTACAAGAGGCCTGTGTTCAGGTA...CA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233  ATCTGGAATCGATGTGTGAAACCAAGTTATTATCTCTAAAGAAGGAAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106922 GATCTGGAATCGATGTGTGAAACCAAGTTATTATCTCTAAAGAAGGAAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 TTATGAAATAGAATTATGCCAGAGGGAGATAATGGGACTTACAAAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106972 TTATGAAATAGAATTATGCCAGAGGGAGATAATGGGACTTACAAAGCATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332 GCCTTGAGTACTCCAGTTTTGGAGATGTTTTGGAATATAGAAGCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107022 GCCTTGAGTACTCCAGTTTTGGAGATGTTTTGGAATATAGAAGCCACCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382 GCAAAACAACTGGGATATCCAAATGGGCATTTTAGTCAAGAAATATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107072 GCAAAACAACTGGGATATCCAAATGGGCATTTTAGTCAAGAAATATTCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432 TCCTGAATACATGCCCACATTTATTCAACAGACATTCCTTACTCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107122 TCCTGAATACATGCCCACATTTATTCAACAGACATTCCTTACTCTCCATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482 AAATAATTAATAATGAAGACAGACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107172 AAATAATTAATAATGAAGACAGACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532 GCCTTTAGTCAGAACTCACAATTTATTCAACATCAGAGAATTCATATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107222 GCCTTTAGTCAGAACTCACAATTTATTCAACATCAGAGAATTCATATTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    582 TGAAAAATCTTATGAATGTAAAGAGTGTGGGAAATTCTTTAGTTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107272 TGAAAAATCTTATGAATGTAAAGAGTGTGGGAAATTCTTTAGTTGTGGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    632 CACATGTTACTCGGCATCTGAAAATTCATACTGGCGAAAAACCCTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107322 CACATGTTACTCGGCATCTGAAAATTCATACTGGCGAAAAACCCTTTGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682 TGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTTGTAGCTCATACCTTTCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107372 TGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTTGTAGCTCATACCTTTCTCAACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732 TCAGAGAATCCATACCGGTAAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107422 TCAGAGAATCCATACCGGTAAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    782 AGGCCTTTAGTTATTGCTCAAATCTTATTGACCATCAGCGAATTCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107472 AGGCCTTTAGTTATTGCTCAAATCTTATTGACCATCAGCGAATTCACACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832 GGTGAAAAACCTTATGAATGTAAAGTATGTGGGAAAGCCTTTACTAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107522 GGTGAAAAACCTTATGAATGTAAAGTATGTGGGAAAGCCTTTACTAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    882 CTCACAACTTTTTCAGCATGCACGAATTCATACAGGTGAGAAACCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107572 CTCACAACTTTTTCAGCATGCACGAATTCATACAGGTGAGAAACCCTATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    932 AATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTTACCCAGAGCTCAAAGCTTGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107622 AATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTTACCCAGAGCTCAAAGCTTGTTCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    982 CATCAGAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGCAAGGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107672 CATCAGAGAATTCATACTGGTGAGAAACCCTATGAGTGCAAGGAATGTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032 CAAAGCCTTTAGTAGTGGCTCAGCACTTACTAATCATCAGAGAATTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107722 CAAAGCCTTTAGTAGTGGCTCAGCACTTACTAATCATCAGAGAATTCACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1082 CTGGTGAGAAACCCTATGATTGTAAGGAATGTGGAAAGGCTTTTACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107772 CTGGTGAGAAACCCTATGATTGTAAGGAATGTGGAAAGGCTTTTACTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132 AGCTCACAGCTTCGTCAACATCAGAGAATTCACGCTGGTGAGAAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107822 AGCTCACAGCTTCGTCAACATCAGAGAATTCACGCTGGTGAGAAACCCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1182 TGAATGTCTTGAATGTGGGAAGGCCTTTACTCAGAACTCACAACTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107872 TGAATGTCTTGAATGTGGGAAGGCCTTTACTCAGAACTCACAACTTTTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1232 AGCATCAGAGAATTCATACAGATGAAAAACCATATGAATGTAATGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107922 AGCATCAGAGAATTCATACAGATGAAAAACCATATGAATGTAATGAATGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282 GGAAAGGCCTTTAATAAATGCTCAAACCTTACTCGACATCTGAGAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107972 GGAAAGGCCTTTAATAAATGCTCAAACCTTACTCGACATCTGAGAATTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1332 CACTGGTGAAAAGCCCTATAACTGTAAGGAATGTGGGAAGGCTTTTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108022 CACTGGTGAAAAGCCCTATAACTGTAAGGAATGTGGGAAGGCTTTTAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :
   1382 GTGGCTCGGATCTCATTCGTCATCAGGGAATTCATACTAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108072 GTGGCTCGGATCTCATTCGTCATCAGGGAATTCATACTAATAAA