Result of SIM4 for
pF1KE0052
seq1 = pF1KE0052.tfa, 3261 bp
seq2 = pF1KE0052/gi568815586f_66202604.tfa (gi568815586f:66202604_66438099), 235496 bp
>pF1KE0052 3261
>gi568815586f:66202604_66438099 (Chr12)
1-187 (100001-100187) 100% ->
188-607 (102128-102547) 100% ->
608-777 (103742-103911) 100% ->
778-1680 (107103-108005) 100% ->
1681-1858 (111383-111560) 100% ->
1859-2000 (112639-112780) 100% ->
2001-2155 (116035-116189) 100% ->
2156-2237 (119345-119426) 100% ->
2238-2297 (120121-120180) 100% ->
2298-2526 (121380-121608) 100% ->
2527-2670 (122380-122523) 100% ->
2671-3162 (128551-129042) 100% ->
3163-3261 (135398-135496) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCAGGTCGAGTCCGTACCTGCGCCAACTTCAGGGACCTCTGCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCCAGGTCGAGTCCGTACCTGCGCCAACTTCAGGGACCTCTGCTCCC
50 . : . : . : . : . :
51 ACCCAGGGATCTGGTGGAGGAGGACGACGACTACCTAAACGACGACGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ACCCAGGGATCTGGTGGAGGAGGACGACGACTACCTAAACGACGACGTGG
100 . : . : . : . : . :
101 AGGAGGATGAAGAGTCCGTGTTCATCGACGCCGAGGAGCTCTGCAGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 AGGAGGATGAAGAGTCCGTGTTCATCGACGCCGAGGAGCTCTGCAGTGGG
150 . : . : . : . : . :
151 GGCGTAAAGGCTGGCAGCCTCCCCGGGTGCCTCCGCG TTTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
100151 GGCGTAAAGGCTGGCAGCCTCCCCGGGTGCCTCCGCGGTG...TAGTTTC
200 . : . : . : . : . :
192 TATTTGTGATGAAAACACACAAGAGACATGTAAAGTGTTTGGACGTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102132 TATTTGTGATGAAAACACACAAGAGACATGTAAAGTGTTTGGACGTTTTC
250 . : . : . : . : . :
242 CGATAACAGGTGCTTGGTGGAGAGTGAAGGTACAAGTAAAGCCTGTGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102182 CGATAACAGGTGCTTGGTGGAGAGTGAAGGTACAAGTAAAGCCTGTGGTG
300 . : . : . : . : . :
292 GGATCAAGGAGCTATCAATATCAAGTTCAAGGATTTCCGTCTTACTTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102232 GGATCAAGGAGCTATCAATATCAAGTTCAAGGATTTCCGTCTTACTTTTT
350 . : . : . : . : . :
342 GCAGTCTGATATGTCACCACCAAATCAAAAACATATCTGTGCTCTCTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102282 GCAGTCTGATATGTCACCACCAAATCAAAAACATATCTGTGCTCTCTTTC
400 . : . : . : . : . :
392 TTAAAGAGTGTGAGGTCTCCAGTGATGATGTTAATAAATTTTTAACATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102332 TTAAAGAGTGTGAGGTCTCCAGTGATGATGTTAATAAATTTTTAACATGG
450 . : . : . : . : . :
442 GTAAAGGAGGTATCAAACTACAAAAACCTAAACTTTGAAAATCTTAGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102382 GTAAAGGAGGTATCAAACTACAAAAACCTAAACTTTGAAAATCTTAGGGA
500 . : . : . : . : . :
492 AACACTAAGAACTTTCCACAAGGAAACTGGAAGGAAAGATCAAAAGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102432 AACACTAAGAACTTTCCACAAGGAAACTGGAAGGAAAGATCAAAAGCAGC
550 . : . : . : . : . :
542 CTACACAGAATGGTCAGGAAGAGTTGTTCCTAGACAATGAGATGAGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102482 CTACACAGAATGGTCAGGAAGAGTTGTTCCTAGACAATGAGATGAGTCTT
600 . : . : . : . : . :
592 CCTCTGGAAAACACAA TTCCATTTAGAAATGTAATGACAGC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
102532 CCTCTGGAAAACACAAGTA...TAGTTCCATTTAGAAATGTAATGACAGC
650 . : . : . : . : . :
633 TTTGCAGTTTCCGAAGATAATGGAATTCCTTCCAGTTCTTCTGCCTCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103767 TTTGCAGTTTCCGAAGATAATGGAATTCCTTCCAGTTCTTCTGCCTCGAC
700 . : . : . : . : . :
683 ACTTTAAATGGATCATAGGGTCAGGTTCTAAAGAGATGTTGAAAGAGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103817 ACTTTAAATGGATCATAGGGTCAGGTTCTAAAGAGATGTTGAAAGAGATA
750 . : . : . : . : . :
733 GAAGAGATTTTAGGTACACATCCGTGGAAACTTGGATTTAGTAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
103867 GAAGAGATTTTAGGTACACATCCGTGGAAACTTGGATTTAGTAAAGTA..
800 . : . : . : . : . :
778 ATAACCTACAGAGAGTGGAAACTCCTGCGATGTGAGGCAAGTTGGA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103917 .AAGATAACCTACAGAGAGTGGAAACTCCTGCGATGTGAGGCAAGTTGGA
850 . : . : . : . : . :
824 TAGCATTTTGTCAGTGTGAGTCTCTTCTCCAGCTGATGACTGATTTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107149 TAGCATTTTGTCAGTGTGAGTCTCTTCTCCAGCTGATGACTGATTTGGAG
900 . : . : . : . : . :
874 AAGAATGCATTAATAATGTATTCCAGACTGAAGCAGATATGTAGAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107199 AAGAATGCATTAATAATGTATTCCAGACTGAAGCAGATATGTAGAGAAGA
950 . : . : . : . : . :
924 TGGGCACACATATGTTGAAGTGAATGACTTAACTTTGACATTGTCAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107249 TGGGCACACATATGTTGAAGTGAATGACTTAACTTTGACATTGTCAAATC
1000 . : . : . : . : . :
974 ATATGTCATTTCATGCTGCTTCAGAGTCTCTGAAGTTTTTGAAGGATATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107299 ATATGTCATTTCATGCTGCTTCAGAGTCTCTGAAGTTTTTGAAGGATATT
1050 . : . : . : . : . :
1024 GGTGTGGTGACATATGAGAAGTCCTGTGTCTTCCCTTATGACCTTTACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107349 GGTGTGGTGACATATGAGAAGTCCTGTGTCTTCCCTTATGACCTTTACCA
1100 . : . : . : . : . :
1074 TGCTGAAAGAGCCATCGCCTTTTCAATTTGTGACCTGATGAAGAAACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107399 TGCTGAAAGAGCCATCGCCTTTTCAATTTGTGACCTGATGAAGAAACCTC
1150 . : . : . : . : . :
1124 CTTGGCATTTATGTGTCGATGTCGAAAAGGTGCTTGCCTCTATTCACACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107449 CTTGGCATTTATGTGTCGATGTCGAAAAGGTGCTTGCCTCTATTCACACC
1200 . : . : . : . : . :
1174 ACAAAACCTGAGAATTCAAGCGATGATGCATTGAATGAGAGCAAACCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107499 ACAAAACCTGAGAATTCAAGCGATGATGCATTGAATGAGAGCAAACCTGA
1250 . : . : . : . : . :
1224 TGAAGTAAGATTAGAAAATCCTGTGGATGTTGTGGACACACAGGACAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107549 TGAAGTAAGATTAGAAAATCCTGTGGATGTTGTGGACACACAGGACAATG
1300 . : . : . : . : . :
1274 GTGACCATATTTGGACTAATGGTGAAAATGAAATTAATGCAGAAATAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107599 GTGACCATATTTGGACTAATGGTGAAAATGAAATTAATGCAGAAATAAGT
1350 . : . : . : . : . :
1324 GAAGTTCAGCTGGATCAGGATCAGGTTGAAGTTCCACTGGATCGGGATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107649 GAAGTTCAGCTGGATCAGGATCAGGTTGAAGTTCCACTGGATCGGGATCA
1400 . : . : . : . : . :
1374 GGTGGCTGCTTTGGAAATGATTTGCTCCAATCCTGTGACAGTCATAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107699 GGTGGCTGCTTTGGAAATGATTTGCTCCAATCCTGTGACAGTCATAAGTG
1450 . : . : . : . : . :
1424 GGAAAGGTGGATGTGGGAAGACCACAATCGTTAGCCGTCTTTTTAAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107749 GGAAAGGTGGATGTGGGAAGACCACAATCGTTAGCCGTCTTTTTAAGCAT
1500 . : . : . : . : . :
1474 ATAGAGCAGTTGGAAGAAAGAGAAGTAAAAAAAGCCTGTGAAGATTTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107799 ATAGAGCAGTTGGAAGAAAGAGAAGTAAAAAAAGCCTGTGAAGATTTTGA
1550 . : . : . : . : . :
1524 ACAAGACCAGAATGCTTCAGAAGAATGGATTACCTTTACTGAGCAAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107849 ACAAGACCAGAATGCTTCAGAAGAATGGATTACCTTTACTGAGCAAAGTC
1600 . : . : . : . : . :
1574 AACTAGAGGCGGACAAGGCTATAGAAGTTTTGCTCACAGCACCTACAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107899 AACTAGAGGCGGACAAGGCTATAGAAGTTTTGCTCACAGCACCTACAGGG
1650 . : . : . : . : . :
1624 AAAGCAGCTGGCTTACTAAGACAGAAAACTGGTCTTCATGCCTACACACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107949 AAAGCAGCTGGCTTACTAAGACAGAAAACTGGTCTTCATGCCTACACACT
1700 . : . : . : . : . :
1674 GTGTCAG GTCAATTATAGCTTCTATTCATGGACTCAAACAA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
107999 GTGTCAGGTA...TAGGTCAATTATAGCTTCTATTCATGGACTCAAACAA
1750 . : . : . : . : . :
1715 TGATGACCACAAACAAACCATGGAAATTTTCTTCGGTTAGAGTTCTGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111417 TGATGACCACAAACAAACCATGGAAATTTTCTTCGGTTAGAGTTCTGGTT
1800 . : . : . : . : . :
1765 GTGGATGAAGGGAGTTTGGTATCTGTAGGAATCTTCAAATCGGTCTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111467 GTGGATGAAGGGAGTTTGGTATCTGTAGGAATCTTCAAATCGGTCTTAAA
1850 . : . : . : . : . :
1815 TTTATTGTGTGAGCACTCCAAACTTTCTAAGCTTATTATCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
111517 TTTATTGTGTGAGCACTCCAAACTTTCTAAGCTTATTATCCTTGGTA...
1900 . : . : . : . : . :
1859 GTGACATTAGACAGTTACCCAGTATTGAACCTGGTAACTTGCTGAAA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112636 TAGGTGACATTAGACAGTTACCCAGTATTGAACCTGGTAACTTGCTGAAA
1950 . : . : . : . : . :
1906 GATCTTTTTGAGACTCTTAAGTCAAGAAATTGTGCTATTGAGCTAAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112686 GATCTTTTTGAGACTCTTAAGTCAAGAAATTGTGCTATTGAGCTAAAGAC
2000 . : . : . : . : . :
1956 AAACCATAGAGCAGAATCTCAGCTCATTGTGGACAATGCTACAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
112736 AAACCATAGAGCAGAATCTCAGCTCATTGTGGACAATGCTACAAGGTA..
2050 . : . : . : . : . :
2001 AATCTCAAGACGCCAATTTCCAAAATTTGATGCAGAACTAAATATC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112786 .AAGAATCTCAAGACGCCAATTTCCAAAATTTGATGCAGAACTAAATATC
2100 . : . : . : . : . :
2047 TCTGATAATCCAACATTACCCATCTCAATTCAAGATAAGACATTTATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116081 TCTGATAATCCAACATTACCCATCTCAATTCAAGATAAGACATTTATTTT
2150 . : . : . : . : . :
2097 TGTCAGGCTCCCAGAAGAGGATGCCAGTTCTCAGTCATCTAAAACTAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116131 TGTCAGGCTCCCAGAAGAGGATGCCAGTTCTCAGTCATCTAAAACTAATC
2200 . : . : . : . : . :
2147 ATCACTCTT GTTTATATTCTGCAGTTAAAACTTTACTACAA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
116181 ATCACTCTTGTA...TAGGTTTATATTCTGCAGTTAAAACTTTACTACAA
2250 . : . : . : . : . :
2188 GAAAATAACTTACAAAATGCAAAAACATCACAATTTATTGCATTTAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119377 GAAAATAACTTACAAAATGCAAAAACATCACAATTTATTGCATTTAGAAG
2300 . : . : . : . : . :
2238 GCAAGACTGTGATCTAATTAATGACTGCTGCTGCAAACACT
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119427 GTA...CAGGCAAGACTGTGATCTAATTAATGACTGCTGCTGCAAACACT
2350 . : . : . : . : . :
2279 ACACAGGCCACCTCACCAA AGACCATCAGAGTAGACTTGTT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
120162 ACACAGGCCACCTCACCAAGTG...CAGAGACCATCAGAGTAGACTTGTT
2400 . : . : . : . : . :
2320 TTTGGAATTGGTGATAAAATTTGTTGTACCAGGAATGCATACCTCTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121402 TTTGGAATTGGTGATAAAATTTGTTGTACCAGGAATGCATACCTCTCAGA
2450 . : . : . : . : . :
2370 CTTACTACCTGAAAATATCTCTGGAAGTCAGCAAAATAATGATCTAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121452 CTTACTACCTGAAAATATCTCTGGAAGTCAGCAAAATAATGATCTAGATG
2500 . : . : . : . : . :
2420 CCAGTAGTGAAGACTTTTCTGGTACGCTTCCTGATTTTGCTAAAAATAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121502 CCAGTAGTGAAGACTTTTCTGGTACGCTTCCTGATTTTGCTAAAAATAAG
2550 . : . : . : . : . :
2470 CGTGACTTTGAAAGTAACGTTCGACTGTGCAATGGAGAGATATTTTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121552 CGTGACTTTGAAAGTAACGTTCGACTGTGCAATGGAGAGATATTTTTCAT
2600 . : . : . : . : . :
2520 AACAAAT GATGTAACTGATGTAACTTTTGGAAAGAGAAGAT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
121602 AACAAATGTA...CAGGATGTAACTGATGTAACTTTTGGAAAGAGAAGAT
2650 . : . : . : . : . :
2561 CTTTGACCATTAATAATATGGCTGGCCTGGAAGTAACTGTGGATTTTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122414 CTTTGACCATTAATAATATGGCTGGCCTGGAAGTAACTGTGGATTTTAAG
2700 . : . : . : . : . :
2611 AAACTAATGAAATATTGTCGCATAAAACATGCATGGGCAAGAACTATTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122464 AAACTAATGAAATATTGTCGCATAAAACATGCATGGGCAAGAACTATTCA
2750 . : . : . : . : . :
2661 CACTTTTCAG GGGTCCGAGGAGCAAACAGTTGTCTATGTGG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
122514 CACTTTTCAGGTA...CAGGGGTCCGAGGAGCAAACAGTTGTCTATGTGG
2800 . : . : . : . : . :
2702 TGGGGAAGGCGGGCCGCCAGCACTGGCAGCATGTCTACACCGCCGTGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128582 TGGGGAAGGCGGGCCGCCAGCACTGGCAGCATGTCTACACCGCCGTGACC
2850 . : . : . : . : . :
2752 AGGGGCCGCTGCCGAGTGTATGTGATTGCAGAGGAGTCTCAGCTCCGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128632 AGGGGCCGCTGCCGAGTGTATGTGATTGCAGAGGAGTCTCAGCTCCGGAA
2900 . : . : . : . : . :
2802 TGCCATTATGAAAAACAGTTTTCCTAGAAAAACTCGTTTGAAACATTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128682 TGCCATTATGAAAAACAGTTTTCCTAGAAAAACTCGTTTGAAACATTTCT
2950 . : . : . : . : . :
2852 TGCAAAGTAAGCTCTCCTCTAGCGGCGCACCTCCAGCAGATTTTCCGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128732 TGCAAAGTAAGCTCTCCTCTAGCGGCGCACCTCCAGCAGATTTTCCGTCC
3000 . : . : . : . : . :
2902 CCACGGAAGAGCTCTGGAGACAGTGGAGGACCCAGCACACCGTCAGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128782 CCACGGAAGAGCTCTGGAGACAGTGGAGGACCCAGCACACCGTCAGCATC
3050 . : . : . : . : . :
2952 TCCACTCCCTGTAGTCACAGACCACGCCATGACAAATGATGTCACCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128832 TCCACTCCCTGTAGTCACAGACCACGCCATGACAAATGATGTCACCTGGA
3100 . : . : . : . : . :
3002 GCGAGGCCTCTTCGCCTGATGAGAGGACACTCACCTTTGCTGAAAGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128882 GCGAGGCCTCTTCGCCTGATGAGAGGACACTCACCTTTGCTGAAAGATGG
3150 . : . : . : . : . :
3052 CAATTATCTTCACCTGATGGAGTAGATACAGATGATGATTTACCAAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128932 CAATTATCTTCACCTGATGGAGTAGATACAGATGATGATTTACCAAAATC
3200 . : . : . : . : . :
3102 GCGAGCATCCAAAAGAACCTGTGGTGTGAATGATGATGAAAGTCCAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128982 GCGAGCATCCAAAAGAACCTGTGGTGTGAATGATGATGAAAGTCCAAGCA
3250 . : . : . : . : . :
3152 AAATTTTTATG GTGGGAGAATCTCCACAAGTGTCTTCCAGA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
129032 AAATTTTTATGGTA...CAGGTGGGAGAATCTCCACAAGTGTCTTCCAGA
3300 . : . : . : . : . :
3193 CTTCAGAATTTGAGACTGAATAATTTAATTCCCAGGCAACTTTTCAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135428 CTTCAGAATTTGAGACTGAATAATTTAATTCCCAGGCAACTTTTCAAGCC
3350 . : .
3243 CACCGATAATCAAGAAACT
|||||||||||||||||||
135478 CACCGATAATCAAGAAACT