seq1 = pF1KE0051.tfa, 3003 bp
seq2 = pF1KE0051/gi568815582f_28778672.tfa (gi568815582f:28778672_29003440), 224769 bp

>pF1KE0051 3003
>gi568815582f:28778672_29003440 (Chr16)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-136  (100428-100445)   100% ->
137-219  (100830-100912)   100% ->
220-324  (102244-102348)   100% ->
325-463  (103780-103918)   100% ->
464-544  (105904-105984)   100% ->
545-630  (108518-108603)   100% ->
631-928  (108754-109051)   99% ->
929-1095  (110116-110282)   100% ->
1096-1184  (115484-115572)   100% ->
1185-1287  (115834-115936)   100% ->
1288-1419  (116151-116282)   100% ->
1420-1545  (119329-119454)   100% ->
1546-1764  (119562-119780)   100% ->
1765-2100  (121910-122245)   100% ->
2101-2321  (123192-123412)   100% ->
2322-2524  (123513-123715)   100% ->
2525-2610  (123909-123994)   100% ->
2611-2744  (124107-124240)   100% ->
2745-2862  (124359-124476)   100% ->
2863-2980  (124652-124769)   100% ->
2981-3003  (125509-125531)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCGCTCATGCTAAAACCACGGAGGAATGTTTGGCCTATTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCGCTCATGCTAAAACCACGGAGGAATGTTTGGCCTATTTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGAGTGAGACCACGGGCCTCACCCCGGACCAAGTTAAGCGGAATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGAGTGAGACCACGGGCCTCACCCCGGACCAAGTTAAGCGGAATCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAATACGGCCTCAATG         AGCTCCCTGCTGAGGAAG     
        ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||>>>..
 100101 AGAAATACGGCCTCAATGGTA...TAGAGCTCCCTGCTGAGGAAGGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     GGAAGACCCTGTGGGAGCTGGTGATAGAGCAGTTTGAAGACCTCCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 .CAGGGAAGACCCTGTGGGAGCTGGTGATAGAGCAGTTTGAAGACCTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGTGCGGATTCTCCTCCTGGCCGCATGCATTTCCTTC         GTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100876 GGTGCGGATTCTCCTCCTGGCCGCATGCATTTCCTTCGTA...CAGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TGGCCTGGTTTGAGGAAGGTGAAGAGACCATCACTGCCTTTGTTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102248 TGGCCTGGTTTGAGGAAGGTGAAGAGACCATCACTGCCTTTGTTGAACCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGTCATCCTCTTGATCCTCATTGCCAATGCCATCGTGGGGGTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102298 TTTGTCATCCTCTTGATCCTCATTGCCAATGCCATCGTGGGGGTTTGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 G         GAGCGGAACGCAGAGAACGCCATCGAGGCCCTGAAGGAGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102348 GGTT...CAGGAGCGGAACGCAGAGAACGCCATCGAGGCCCTGAAGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAGCCAGAGATGGGGAAGGTCTACCGGGCTGACCGCAAGTCAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103820 ATGAGCCAGAGATGGGGAAGGTCTACCGGGCTGACCGCAAGTCAGTGCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGGATCAAGGCTCGGGACATCGTCCCTGGGGACATCGTGGAGGTGGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103870 AGGATCAAGGCTCGGGACATCGTCCCTGGGGACATCGTGGAGGTGGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464         TGGGGGACAAAGTCCCTGCAGACATCCGAATCCTCGCCATCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103920 TG...CAGTGGGGGACAAAGTCCCTGCAGACATCCGAATCCTCGCCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AATCCACCACGCTGCGGGTTGACCAGTCCATCCTGACAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 105946 AATCCACCACGCTGCGGGTTGACCAGTCCATCCTGACAGGTC...CAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAGTCTGTATCTGTCATCAAACACACGGAGCCCGTTCCTGACCCCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108520 GAGTCTGTATCTGTCATCAAACACACGGAGCCCGTTCCTGACCCCCGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGTCAACCAGGACAAGAAGAACATGCTTTTCTCG         GGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108570 TGTCAACCAGGACAAGAAGAACATGCTTTTCTCGGTG...CAGGGCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ACATTGCAGCCGGCAAGGCCTTGGGCATCGTGGCCACCACCGGTGTGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 108761 ACATTGCAGCCGGCAAGGCCTTGGGCATCGTGGCCACCACTGGTGTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACCGAGATTGGGAAGATCCGAGACCAAATGGCTGCCACAGAACAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108811 ACCGAGATTGGGAAGATCCGAGACCAAATGGCTGCCACAGAACAGGACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GACCCCCTTGCAGCAGAAGCTGGATGAGTTTGGGGAGCAGCTCTCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108861 GACCCCCTTGCAGCAGAAGCTGGATGAGTTTGGGGAGCAGCTCTCCAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCATCTCCCTCATCTGTGTGGCTGTCTGGCTTATCAACATTGGCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108911 TCATCTCCCTCATCTGTGTGGCTGTCTGGCTTATCAACATTGGCCACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AACGACCCCGTCCATGGGGGCTCCTGGTTCCGCGGGGCCATCTACTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108961 AACGACCCCGTCCATGGGGGCTCCTGGTTCCGCGGGGCCATCTACTACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TAAGATTGCCGTGGCCTTGGCTGTGGCTGCCATCCCCGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 109011 TAAGATTGCCGTGGCCTTGGCTGTGGCTGCCATCCCCGAAGGTA...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GTCTTCCTGCAGTCATCACCACCTGCCTGGCCCTGGGTACCCGTCGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110116 GTCTTCCTGCAGTCATCACCACCTGCCTGGCCCTGGGTACCCGTCGGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCAAAGAAGAATGCCATTGTAAGAAGCTTGCCCTCCGTAGAGACCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110166 GCAAAGAAGAATGCCATTGTAAGAAGCTTGCCCTCCGTAGAGACCCTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CTGCACCTCTGTCATCTGTTCCGACAAGACAGGCACCCTCACCACCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110216 CTGCACCTCTGTCATCTGTTCCGACAAGACAGGCACCCTCACCACCAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGATGTCTGTCTGCAAG         ATGTTTATCATTGACAAGGTGGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110266 AGATGTCTGTCTGCAAGGTC...CAGATGTTTATCATTGACAAGGTGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GGGGACATCTGCCTCCTGAATGAGTTCTCCATCACCGGCTCCACTTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115508 GGGGACATCTGCCTCCTGAATGAGTTCTCCATCACCGGCTCCACTTACGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCCAGAGGGAGAGGT         CTTGAAGAATGATAAGCCAGTCCGGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115558 TCCAGAGGGAGAGGTGTA...CAGCTTGAAGAATGATAAGCCAGTCCGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGGGCAGTATGACGGGCTGGTGGAGCTGGCCACCATCTGTGCCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115860 CAGGGCAGTATGACGGGCTGGTGGAGCTGGCCACCATCTGTGCCCTCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AATGACTCCTCCTTGGACTTCAACGAG         GCCAAAGGTGTCTA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 115910 AATGACTCCTCCTTGGACTTCAACGAGGTA...CAGGCCAAAGGTGTCTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGAGAAGGTCGGCGAGGCCACCGAGACAGCACTCACCACCCTGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116165 TGAGAAGGTCGGCGAGGCCACCGAGACAGCACTCACCACCCTGGTGGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGATGAATGTGTTCAACACGGATGTGAGAAGCCTCTCGAAGGTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116215 AGATGAATGTGTTCAACACGGATGTGAGAAGCCTCTCGAAGGTGGAGAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GCCAACGCCTGCAACTCG         GTGATCCGCCAGCTAATGAAGAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 116265 GCCAACGCCTGCAACTCGGTG...CAGGTGATCCGCCAGCTAATGAAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGAATTCACCCTGGAGTTCTCCCGAGACAGAAAGTCCATGTCTGTCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119352 GGAATTCACCCTGGAGTTCTCCCGAGACAGAAAGTCCATGTCTGTCTATT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GCTCCCCAGCCAAATCTTCCCGGGCTGCTGTGGGCAACAAGATGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119402 GCTCCCCAGCCAAATCTTCCCGGGCTGCTGTGGGCAACAAGATGTTTGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AAG         GGTGCCCCTGAGGGCGTCATCGACCGCTGTAACTATGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119452 AAGGTC...TAGGGTGCCCCTGAGGGCGTCATCGACCGCTGTAACTATGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GCGAGTTGGCACCACCCGGGTGCCACTGACGGGGCCGGTGAAGGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119600 GCGAGTTGGCACCACCCGGGTGCCACTGACGGGGCCGGTGAAGGAAAAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TCATGGCGGTGATCAAGGAGTGGGGCACTGGCCGGGACACCCTGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119650 TCATGGCGGTGATCAAGGAGTGGGGCACTGGCCGGGACACCCTGCGCTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TTGGCCCTGGCCACCCGGGACACCCCCCCGAAGCGAGAGGAAATGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119700 TTGGCCCTGGCCACCCGGGACACCCCCCCGAAGCGAGAGGAAATGGTCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGATGACTCTGCCAGGTTCCTGGAGTATGAG         ACGGACCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 119750 GGATGACTCTGCCAGGTTCCTGGAGTATGAGGTA...CAGACGGACCTGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CATTCGTGGGTGTAGTGGGCATGCTGGACCCTCCGCGCAAGGAGGTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121920 CATTCGTGGGTGTAGTGGGCATGCTGGACCCTCCGCGCAAGGAGGTCACG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GGCTCCATCCAGCTGTGCCGTGACGCCGGGATCCGGGTGATCATGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121970 GGCTCCATCCAGCTGTGCCGTGACGCCGGGATCCGGGTGATCATGATCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TGGGGACAACAAGGGCACAGCCATTGCCATCTGCCGGCGAATTGGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122020 TGGGGACAACAAGGGCACAGCCATTGCCATCTGCCGGCGAATTGGCATCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TTGGGGAGAACGAGGAGGTGGCCGATCGCGCCTACACGGGCCGAGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122070 TTGGGGAGAACGAGGAGGTGGCCGATCGCGCCTACACGGGCCGAGAGTTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GACGACCTGCCCCTGGCTGAACAGCGGGAAGCCTGCCGACGTGCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122120 GACGACCTGCCCCTGGCTGAACAGCGGGAAGCCTGCCGACGTGCCTGCTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CTTCGCCCGTGTGGAGCCCTCGCACAAGTCCAAGATTGTGGAGTACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122170 CTTCGCCCGTGTGGAGCCCTCGCACAAGTCCAAGATTGTGGAGTACCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 AGTCCTACGATGAGATCACAGCCATG         ACAGGTGATGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 122220 AGTCCTACGATGAGATCACAGCCATGGTG...CAGACAGGTGATGGCGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AATGACGCCCCTGCCCTGAAGAAGGCTGAGATTGGCATTGCCATGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123207 AATGACGCCCCTGCCCTGAAGAAGGCTGAGATTGGCATTGCCATGGGATC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TGGCACTGCCGTGGCCAAGACTGCCTCTGAGATGGTGCTGGCTGACGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123257 TGGCACTGCCGTGGCCAAGACTGCCTCTGAGATGGTGCTGGCTGACGACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ACTTCTCCACCATCGTAGCTGCTGTGGAGGAGGGCCGCGCCATCTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123307 ACTTCTCCACCATCGTAGCTGCTGTGGAGGAGGGCCGCGCCATCTACAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 AACATGAAGCAGTTCATCCGCTACCTCATTTCCTCCAACGTGGGCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123357 AACATGAAGCAGTTCATCCGCTACCTCATTTCCTCCAACGTGGGCGAGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GGTCTG         TATCTTCCTGACCGCTGCCCTGGGGCTGCCTGAGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123407 GGTCTGGTG...CAGTATCTTCCTGACCGCTGCCCTGGGGCTGCCTGAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CCCTGATCCCGGTGCAGCTGCTATGGGTGAACTTGGTGACCGACGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123548 CCCTGATCCCGGTGCAGCTGCTATGGGTGAACTTGGTGACCGACGGGCTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CCAGCCACAGCCCTGGGCTTCAACCCACCAGACCTGGACATCATGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123598 CCAGCCACAGCCCTGGGCTTCAACCCACCAGACCTGGACATCATGGACCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CCCCCCCCGGAGCCCCAAGGAGCCCCTCATCAGTGGCTGGCTCTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123648 CCCCCCCCGGAGCCCCAAGGAGCCCCTCATCAGTGGCTGGCTCTTCTTCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 GCTACATGGCAATCGGGG         GCTATGTGGGTGCAGCCACCGTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 123698 GCTACATGGCAATCGGGGGTG...CAGGCTATGTGGGTGCAGCCACCGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GGAGCAGCTGCCTGGTGGTTCCTGTACGCTGAGGATGGGCCTCATGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123932 GGAGCAGCTGCCTGGTGGTTCCTGTACGCTGAGGATGGGCCTCATGTCAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CTACAGCCAGCTG         ACTCACTTCATGCAGTGCACCGAGGACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 123982 CTACAGCCAGCTGGTA...CAGACTCACTTCATGCAGTGCACCGAGGACA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 ACACCCACTTTGAGGGCATAGACTGTGAGGTCTTCGAGGCCCCCGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124135 ACACCCACTTTGAGGGCATAGACTGTGAGGTCTTCGAGGCCCCCGAGCCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 ATGACCATGGCCCTGTCCGTGCTGGTGACCATCGAGATGTGCAATGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124185 ATGACCATGGCCCTGTCCGTGCTGGTGACCATCGAGATGTGCAATGCACT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 GAACAG         CCTGTCCGAGAACCAGTCCCTGCTGCGGATGCCAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124235 GAACAGGTG...CAGCCTGTCCGAGAACCAGTCCCTGCTGCGGATGCCAC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 CCTGGGTGAACATCTGGCTGCTGGGCTCCATCTGCCTCTCCATGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124394 CCTGGGTGAACATCTGGCTGCTGGGCTCCATCTGCCTCTCCATGTCCCTG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 CACTTCCTCATCCTCTATGTTGACCCCCTGCCG         ATGATCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124444 CACTTCCTCATCCTCTATGTTGACCCCCTGCCGGTG...CAGATGATCTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 CAAGCTCCGGGCCCTGGACCTCACCCAGTGGCTCATGGTCCTCAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124660 CAAGCTCCGGGCCCTGGACCTCACCCAGTGGCTCATGGTCCTCAAGATCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 CACTGCCAGTCATTGGGCTCGACGAAATCCTCAAGTTCGTTGCTCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124710 CACTGCCAGTCATTGGGCTCGACGAAATCCTCAAGTTCGTTGCTCGGAAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 TACCTAGAGG         ATCCAGAAGATGAAAGAAGGAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 124760 TACCTAGAGGGTA...CAGATCCAGAAGATGAAAGAAGGAAG