seq1 = pF1KE0045.tfa, 1983 bp
seq2 = pF1KE0045/gi568815597r_196940522.tfa (gi568815597r:196940522_197167223), 226702 bp

>pF1KE0045 1983
>gi568815597r:196940522_197167223 (Chr1)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-265  (104167-104367)   100% ->
266-451  (105255-105440)   100% ->
452-628  (106149-106325)   100% ->
629-805  (106682-106858)   100% ->
806-985  (109759-109938)   100% ->
986-1171  (110026-110211)   100% ->
1172-1354  (111327-111509)   100% ->
1355-1555  (114390-114590)   100% ->
1556-1738  (116345-116527)   100% ->
1739-1952  (126489-126702)   100% ->
1953-1983  (127813-127843)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTGAAAAACCTGACTTTTATCATCATATTGATAATCTCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTGAAAAACCTGACTTTTATCATCATATTGATAATCTCAGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTCTATGCAGAAG         AGAAACCCTGTGGTTTTCCTCATGTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTCTATGCAGAAGGTA...CAGAGAAACCCTGTGGTTTTCCTCATGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAATGGAAGAATTGCCCAATATTACTATACTTTTAAAAGCTTTTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104194 AAAATGGAAGAATTGCCCAATATTACTATACTTTTAAAAGCTTTTACTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAATGAGCATAGACAAAAAATTGTCATTTTTCTGCTTGGCTGGTTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104244 CCAATGAGCATAGACAAAAAATTGTCATTTTTCTGCTTGGCTGGTTATAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACTGAAAGTGGAAGACAAGAAGAGCAAACCACGTGTACAACAGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104294 CACTGAAAGTGGAAGACAAGAAGAGCAAACCACGTGTACAACAGAAGGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGTCTCCAGAGCCAAGGTGCTTCA         AAAAATGCACTAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104344 GGTCTCCAGAGCCAAGGTGCTTCAGTA...TAGAAAAATGCACTAAGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCTGAGTAATGGTTACATCTCTGATGTAAAGTTATTGTATAAAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105272 GACCTGAGTAATGGTTACATCTCTGATGTAAAGTTATTGTATAAAATTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGAACATGCGTTATGGTTGCGCTTCAGGGTACAAAACCACTGGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105322 AGAGAACATGCGTTATGGTTGCGCTTCAGGGTACAAAACCACTGGAGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGATGAAGAAGTGGTTCAATGTCTCTCTGATGGATGGTCTTCTCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105372 AGGATGAAGAAGTGGTTCAATGTCTCTCTGATGGATGGTCTTCTCAACCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCTGTAGGAAAGAACATG         AAACATGTTTGGCTCCTGAATT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105422 ACCTGTAGGAAAGAACATGGTA...TAGAAACATGTTTGGCTCCTGAATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATATAATGGAAATTATTCCACAACACAGAAAACATTCAAAGTGAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106171 ATATAATGGAAATTATTCCACAACACAGAAAACATTCAAAGTGAAGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGTACAATACGAATGTGCTACTGGCTACTACACAGCTGGAGGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106221 AAGTACAATACGAATGTGCTACTGGCTACTACACAGCTGGAGGAAAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACAGAGGAGGTAGAATGTCTCACATACGGATGGTCTCTCACACCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106271 ACAGAGGAGGTAGAATGTCTCACATACGGATGGTCTCTCACACCAAAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TACCA         AATTAAAGTGCTCTTCTTTAAGATTAATTGAAAATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106321 TACCAGTA...CAGAATTAAAGTGCTCTTCTTTAAGATTAATTGAAAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTATTTTCATCCTGTAAAGCAAACCTATGAAGAAGGAGATGTCGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106718 GTTATTTTCATCCTGTAAAGCAAACCTATGAAGAAGGAGATGTCGTTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTTTCTGTCATGAAAATTATTATCTAAGTGGATCTGATTTAATTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106768 TTTTTCTGTCATGAAAATTATTATCTAAGTGGATCTGATTTAATTCAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTATAACTTTGGTTGGTACCCAGAATCTCCTGTATGCGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106818 CTATAACTTTGGTTGGTACCCAGAATCTCCTGTATGCGAAGGTA...AAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAAGAAGAAACAGATGTCCTCCTCCACCTCTGCCCATAAACTCCAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109759 GAAGAAGAAACAGATGTCCTCCTCCACCTCTGCCCATAAACTCCAAAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAAACACATTCAACAACTTATCGTCATGGAGAAATAGTTCATATAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109809 CAAACACATTCAACAACTTATCGTCATGGAGAAATAGTTCATATAGAATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGAACTTAATTTTGAGATCCATGGGTCAGCAGAAATACGTTGTGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109859 TGAACTTAATTTTGAGATCCATGGGTCAGCAGAAATACGTTGTGAAGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GAAAATGGACAGAACCTCCAAAATGCATTG         AAGGACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 109909 GAAAATGGACAGAACCTCCAAAATGCATTGGTT...CAGAAGGACAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAGGTAGCCTGTGAGGAACCACCCTTCATTGAAAATGGTGCAGCAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110037 AAGGTAGCCTGTGAGGAACCACCCTTCATTGAAAATGGTGCAGCAAATTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ACACTCTAAGATTTATTACAATGGGGATAAAGTGACATATGCATGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110087 ACACTCTAAGATTTATTACAATGGGGATAAAGTGACATATGCATGTAAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCGGCTACCTTCTCCATGGATCGAATGAGATAACTTGTAATCGTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110137 GCGGCTACCTTCTCCATGGATCGAATGAGATAACTTGTAATCGTGGAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TGGACACTTCCTCCTGAGTGTGTTG         AAAATAATGAGAATTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110187 TGGACACTTCCTCCTGAGTGTGTTGGTA...TAGAAAATAATGAGAATTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TAAGCATCCTCCTGTTGTAATGAATGGGGCTGTTGCAGACGGGATATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111343 TAAGCATCCTCCTGTTGTAATGAATGGGGCTGTTGCAGACGGGATATTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CAAGCTATGCAACAGGATCCTCAGTGGAATATAGATGCAATGAATATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111393 CAAGCTATGCAACAGGATCCTCAGTGGAATATAGATGCAATGAATATTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTACTGAGGGGATCAAAAATATCTCGTTGCGAACAAGGAAAATGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111443 TTACTGAGGGGATCAAAAATATCTCGTTGCGAACAAGGAAAATGGTCATC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCCACCTGTTTGCTTGG         AACCATGTACTGTTAATGTGGATT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111493 CCCACCTGTTTGCTTGGGTA...CAGAACCATGTACTGTTAATGTGGATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACATGAACAGAAATAACATAGAAATGAAGTGGAAATATGAAGGGAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114414 ACATGAACAGAAATAACATAGAAATGAAGTGGAAATATGAAGGGAAAGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TTACATGGAGATTTAATAGATTTTGTATGTAAACAGGGATATGACTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114464 TTACATGGAGATTTAATAGATTTTGTATGTAAACAGGGATATGACTTATC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TCCATTAACCCCATTGTCTGAATTATCTGTGCAGTGCAACAGAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114514 TCCATTAACCCCATTGTCTGAATTATCTGTGCAGTGCAACAGAGGAGAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 TGAAATATCCTTTATGTACTAGAAAAG         AATCTAAAGGAATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114564 TGAAATATCCTTTATGTACTAGAAAAGGTA...CAGAATCTAAAGGAATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TGCACATCTCCTCCTCTTATTAAACATGGAGTCATTATTAGTTCAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116359 TGCACATCTCCTCCTCTTATTAAACATGGAGTCATTATTAGTTCAACAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGACACCTATGAAAATGGCTCTTCAGTAGAATACAGATGTTTTGATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116409 AGACACCTATGAAAATGGCTCTTCAGTAGAATACAGATGTTTTGATCACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 ATTTCCTAGAAGGATCTAGGGAGGCCTATTGTTTAGATGGAATGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116459 ATTTCCTAGAAGGATCTAGGGAGGCCTATTGTTTAGATGGAATGTGGACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 ACACCACCATTGTGTTTAG         AGCCATGCACATTATCTTTTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 116509 ACACCACCATTGTGTTTAGGTA...CAGAGCCATGCACATTATCTTTTAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 TGAAATGGAAAAGAATAATTTACTTCTGAAATGGGATTTTGACAATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126511 TGAAATGGAAAAGAATAATTTACTTCTGAAATGGGATTTTGACAATAGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 CACACATTTTGCATGGTGAATATATTGAGTTTATTTGTAGAGGAGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126561 CACACATTTTGCATGGTGAATATATTGAGTTTATTTGTAGAGGAGATACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 TATCCAGCTGAATTATATATTACTGGATCTATACTTAGAATGCAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126611 TATCCAGCTGAATTATATATTACTGGATCTATACTTAGAATGCAATGTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CAGAGGGCAGTTAAAATATCCAAGATGTATTCCAAGACAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 126661 CAGAGGGCAGTTAAAATATCCAAGATGTATTCCAAGACAAAGGTA...AA

   2050     .    :    .    :    .    :
   1953  CACTCTGTCTTATCAAGAACCCTTAAGAACA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||
 127812 GCACTCTGTCTTATCAAGAACCCTTAAGAACA