seq1 = pF1KE0037.tfa, 2220 bp
seq2 = pF1KE0037/gi568815587r_64945274.tfa (gi568815587r:64945274_65158461), 213188 bp

>pF1KE0037 2220
>gi568815587r:64945274_65158461 (Chr11)

(complement)

1-185  (99941-100125)   100% ->
186-358  (100212-100384)   100% ->
359-480  (100466-100587)   100% ->
481-603  (100969-101091)   100% ->
604-887  (103724-104007)   100% ->
888-992  (104108-104212)   100% ->
993-1078  (104886-104971)   100% ->
1079-1198  (105125-105244)   100% ->
1199-1284  (110077-110162)   100% ->
1285-1348  (110247-110310)   100% ->
1349-1416  (110414-110481)   100% ->
1417-1508  (110724-110815)   100% ->
1509-1599  (110897-110987)   100% ->
1600-1681  (111936-112017)   100% ->
1682-1855  (112100-112273)   100% ->
1856-1943  (112348-112435)   100% ->
1944-2036  (112548-112640)   100% ->
2037-2220  (113005-113188)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTGGACGAAGGTGTTGGGGCTGGGGCTGGGGGCTGCTGCCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99941 ATGCAGTGGACGAAGGTGTTGGGGCTGGGGCTGGGGGCTGCTGCCCTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGCTGGGGATCATCCTCGGCCACTTTGCCATCCCCAAAAAAGCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99991 GGGGCTGGGGATCATCCTCGGCCACTTTGCCATCCCCAAAAAAGCCAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACTGGCCCCCCAGGACCTGGACCTGGAGATCCTGGAGACCGTCATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100041 CACTGGCCCCCCAGGACCTGGACCTGGAGATCCTGGAGACCGTCATGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTGGATGCCCACAGGATCCGGGAGAACCTCAG         AGAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100091 CAGCTGGATGCCCACAGGATCCGGGAGAACCTCAGGTG...CAGAGAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCCAGGGAGCCACACCTGGCCTCCAGCCCTCGGGATGAGGACCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100218 CTCCAGGGAGCCACACCTGGCCTCCAGCCCTCGGGATGAGGACCTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCTGCTGCTGCAGCGCTGGAAGGACCCAGAGTCAGGCCTGGACTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100268 AGCTGCTGCTGCAGCGCTGGAAGGACCCAGAGTCAGGCCTGGACTCGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGGCCTCCACGTACGAAGTGCTGCTGTCCTTCCCTAGCCAGGAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100318 GAGGCCTCCACGTACGAAGTGCTGCTGTCCTTCCCTAGCCAGGAGCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAACGTCGTGGACATCG         TGGGCCCCACTGGGGGCATCATCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100368 CAACGTCGTGGACATCGGTG...CAGTGGGCCCCACTGGGGGCATCATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTCCTGCCACCGGACTGAGGAGAACGTGACCGGGGAGCAAGGGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100490 ACTCCTGCCACCGGACTGAGGAGAACGTGACCGGGGAGCAAGGGGGGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGTGGTACAACCCTATGCTGCCTATGCTCCTTCTGGAACCCCACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100540 GATGTGGTACAACCCTATGCTGCCTATGCTCCTTCTGGAACCCCACAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481        GGCCTCCTCGTCTATGCCAACCGGGGCGCGGAAGAAGACTTTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100590 G...TAGGGCCTCCTCGTCTATGCCAACCGGGGCGCGGAAGAAGACTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGCTACAGACTCAGGGCATCAAACTTGAAGGCACCATTGCCCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101012 AGGAGCTACAGACTCAGGGCATCAAACTTGAAGGCACCATTGCCCTGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGATATGGGGGTGTAGGGCGTGGGGCCAAG         GCTGTGAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101062 CGATATGGGGGTGTAGGGCGTGGGGCCAAGGTG...CAGGCTGTGAACGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCCAAGCACGGGGTAGCTGGGGTGCTGGTGTACACAGACCCTGCCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103735 TGCCAAGCACGGGGTAGCTGGGGTGCTGGTGTACACAGACCCTGCCGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCAACGATGGGCTGAGCTCACCCGACGAAACCTTTCCCAACTCCTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103785 TCAACGATGGGCTGAGCTCACCCGACGAAACCTTTCCCAACTCCTGGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGCCCCCCTCAGGAGTGGAGCGAGGCTCCTACTACGAGTATTTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103835 CTGCCCCCCTCAGGAGTGGAGCGAGGCTCCTACTACGAGTATTTTGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCCTCTGACTCCCTACCTTCCAGCCGTCCCCTCTTCCTTCCGCGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103885 CCCTCTGACTCCCTACCTTCCAGCCGTCCCCTCTTCCTTCCGCGTGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTGCCAATGTCTCCGGATTTCCCCCAATTCCTACACAGCCCATTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103935 TTGCCAATGTCTCCGGATTTCCCCCAATTCCTACACAGCCCATTGGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAGGATGCAAGAGACCTGCTCTG         TAACCTCAACGGAACTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103985 CAGGATGCAAGAGACCTGCTCTGGTG...CAGTAACCTCAACGGAACTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGCCCCAGCCACCTGGCAGGGAGCACTGGGCTGCCACTACAGGTTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104126 GGCCCCAGCCACCTGGCAGGGAGCACTGGGCTGCCACTACAGGTTGGGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCGGCTTCCGGCCTGACGGAGACTTCCCAGCAGACAG         CCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104176 CCGGCTTCCGGCCTGACGGAGACTTCCCAGCAGACAGGTG...CAGCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTGAATGTGAGCGTCTACAACCGCCTGGAGCTGAGGAACTCTTCCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104890 GTGAATGTGAGCGTCTACAACCGCCTGGAGCTGAGGAACTCTTCCAACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCTGGGCATCATCCGTGGGGCTGTGGAGCCTG         ATCGCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104940 CCTGGGCATCATCCGTGGGGCTGTGGAGCCTGGTG...CAGATCGCTACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TGCTGTATGGGAACCACCGAGACAGCTGGGTGCACGGGGCTGTGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105134 TGCTGTATGGGAACCACCGAGACAGCTGGGTGCACGGGGCTGTGGACCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGCAGTGGCACCGCCGTCCTCCTGGAGCTCTCCCGTGTCCTGGGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105184 AGCAGTGGCACCGCCGTCCTCCTGGAGCTCTCCCGTGTCCTGGGGACCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCTGAAGAAGG         GCACCTGGCGTCCTCGCAGATCAATCGTGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105234 GCTGAAGAAGGGTG...CAGGCACCTGGCGTCCTCGCAGATCAATCGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TTGCGAGCTGGGGGGCTGAGGAGTTTGGGCTCATTGGCTCCACGGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110107 TTGCGAGCTGGGGGGCTGAGGAGTTTGGGCTCATTGGCTCCACGGAATTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACAGAA         GAGTTCTTCAACAAGCTGCAGGAGCGCACGGTGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110157 ACAGAAGTG...CAGGAGTTCTTCAACAAGCTGCAGGAGCGCACGGTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTACATCAACGTGGACATCTCGGTGTTTG         CCAACGCTACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 110282 CTACATCAACGTGGACATCTCGGTGTTTGGTA...CAGCCAACGCTACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTAGGGTGCAGGGGACGCCCCCTGTCCAGAGCGTCGTCTTCTCTGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110426 TTAGGGTGCAGGGGACGCCCCCTGTCCAGAGCGTCGTCTTCTCTGCAACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AAAGAG         ATCCGCTCACCAGGCCCTGGCGACCTGAGCATCTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110476 AAAGAGGTG...CAGATCCGCTCACCAGGCCCTGGCGACCTGAGCATCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CGACAACTGGATCCGGTACTTCAACCGCAGCAGCCCGGTGTACGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110759 CGACAACTGGATCCGGTACTTCAACCGCAGCAGCCCGGTGTACGGCCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCCCCAG         CTTGGGTTCTCTGGGTGCTGGCAGCGACTATGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110809 TCCCCAGGTA...CAGCTTGGGTTCTCTGGGTGCTGGCAGCGACTATGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CCCTTCGTTCACTTCCTGGGCATCTCCTCCATGGACATTGCCTATACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110931 CCCTTCGTTCACTTCCTGGGCATCTCCTCCATGGACATTGCCTATACCTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGACCGG         AGCAAGACTTCAGCCAGGATCTACCCCACCTACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110981 TGACCGGGTG...CAGAGCAAGACTTCAGCCAGGATCTACCCCACCTACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ACACAGCCTTTGACACCTTTGACTATGTGGACAAGTTTTTGGACCCGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111970 ACACAGCCTTTGACACCTTTGACTATGTGGACAAGTTTTTGGACCCGGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1682        GCTTCAGCAGCCATCAGGCTGTGGCCCGGACAGCGGGGAGTGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112020 G...CAGGCTTCAGCAGCCATCAGGCTGTGGCCCGGACAGCGGGGAGTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GATTCTCCGGCTCAGTGACAGCTTCTTCCTGCCCCTCAAAGTCAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112143 GATTCTCCGGCTCAGTGACAGCTTCTTCCTGCCCCTCAAAGTCAGTGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 ACAGTGAGACACTCCGCAGCTTCCTGCAGGCAGCCCAGCAAGATCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112193 ACAGTGAGACACTCCGCAGCTTCCTGCAGGCAGCCCAGCAAGATCTTGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GCCCTGCTGGAGCAGCACAGCATCAGCCTGG         GGCCTCTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112243 GCCCTGCTGGAGCAGCACAGCATCAGCCTGGGTA...CAGGGCCTCTGGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GACTGCAGTGGAGAAGTTTGAGGCAGAAGCTGCAGCCTTGGGCCAACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112358 GACTGCAGTGGAGAAGTTTGAGGCAGAAGCTGCAGCCTTGGGCCAACGCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TATCAACACTGCAGAAGGGCAGCCCTGA         CCCCCTGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 112408 TATCAACACTGCAGAAGGGCAGCCCTGAGTG...CAGCCCCCTGCAGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CGGATGCTCAATGACCAGTTGATGCTCTTGGAACGGACCTTTCTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112561 CGGATGCTCAATGACCAGTTGATGCTCTTGGAACGGACCTTTCTGAACCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TAGAGCCTTCCCAGAGGAACGCTACTACAG         CCATGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112611 TAGAGCCTTCCCAGAGGAACGCTACTACAGGTG...CAGCCATGTGCTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GGGCACCTCGCACGGGCTCCGTAGTCACATTCCCGGGCCTATCCAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113016 GGGCACCTCGCACGGGCTCCGTAGTCACATTCCCGGGCCTATCCAATGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 TGCTCCAGGGCCAGGGACACAGCTTCTGGATCTGAAGCTTGGGCTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113066 TGCTCCAGGGCCAGGGACACAGCTTCTGGATCTGAAGCTTGGGCTGAGGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CCAGAGACAGCTCAGCATTGTGGTGACAGCCCTGGAGGGTGCGGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113116 CCAGAGACAGCTCAGCATTGTGGTGACAGCCCTGGAGGGTGCGGCAGCCA

   2350     .    :    .    :
   2198 CCCTGAGGCCTGTGGCTGACCTC
        |||||||||||||||||||||||
 113166 CCCTGAGGCCTGTGGCTGACCTC