seq1 = pF1KE0031.tfa, 1482 bp
seq2 = pF1KE0031/gi568815581r_41877261.tfa (gi568815581r:41877261_42117416), 240156 bp

>pF1KE0031 1482
>gi568815581r:41877261_42117416 (Chr17)

(complement)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-166  (116847-116935)   100% ->
167-291  (120178-120302)   100% ->
292-405  (120993-121106)   100% ->
406-480  (122473-122547)   100% ->
481-599  (127035-127153)   100% ->
600-753  (127860-128013)   100% ->
754-918  (128521-128685)   100% ->
919-1010  (129507-129598)   100% ->
1011-1084  (133781-133854)   100% ->
1085-1231  (135016-135162)   99% ->
1232-1384  (135410-135562)   100% ->
1385-1447  (140094-140156)   100% ->
1448-1482  (140647-140681)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAG         GGAAGCAGAGACTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 GCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAGGTA...CAGGGAAGCAGAGACTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116861 TCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATAATTATTATACAAAAGCCATAG         ATATGTGTCCTAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116911 TATAATTATTATACAAAAGCCATAGGTG...TAGATATGTGTCCTAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120194 TGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120244 TCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTGTCCGG         GGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120294 TTTGTCCGGGTA...TAGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121025 TCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAG         TTCAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121075 TGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGGTA...CAGTTCAAGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122482 GCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCGAGATTTTCGGAAG         GTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122532 GCGAGATTTTCGGAAGGTA...CAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127060 TAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127110 TTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    600    TGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127857 CAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127907 GAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127957 TTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTGCAGA         AATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128007 CTGCAGAGTA...TAGAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128555 GGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128605 ACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAG         CTTAGGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 128655 CTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGGTA...AAGCTTAGGAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129517 TAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTG         TTACATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 129567 TACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGGTA...CAGTTACATGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133790 CACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CAGAGAAAACAAAAG         AACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 133840 CAGAGAAAACAAAAGGTA...TAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CAGCTGGAACTGAGGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135042 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135092 AGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GGGCCTTGATGCACCATCCAG         ATCGGCATAGTGGAGCCAGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 135142 GGGCCTTGATGCACCATCCAGGTA...TAGATCGGCATAGTGGAGCCAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135430 GCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135480 CTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGTGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTG         ATTTTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 135530 AGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGGTG...CAGATTTTGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140102 CCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1443 TGAAG         CATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC
        |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140152 TGAAGGTA...CAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC