seq1 = pF1KE0028.tfa, 2241 bp
seq2 = pF1KE0028/gi568815591r_135086154.tfa (gi568815591r:135086154_135311502), 225349 bp

>pF1KE0028 2241
>gi568815591r:135086154_135311502 (Chr7)

(complement)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-303  (101748-101927)   100% ->
304-514  (102505-102714)   99% ->
515-594  (104304-104383)   100% ->
595-725  (105445-105575)   100% ->
726-891  (107070-107235)   100% ->
892-1050  (113352-113510)   100% ->
1051-1244  (115166-115359)   100% ->
1245-1395  (116419-116569)   100% ->
1396-1490  (117831-117925)   100% ->
1491-1659  (118104-118272)   99% ->
1660-1768  (122051-122159)   100% ->
1769-1881  (122958-123070)   100% ->
1882-2079  (124334-124531)   100% ->
2080-2241  (125188-125349)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGCCGTGGAGCGCACTGACGAGCTGGTCCGGGAGTACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGGCCGTGGAGCGCACTGACGAGCTGGTCCGGGAGTACCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCGCGGGTTCACGCACACACTGCGGCAGCTGGACGCCGAGATCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCGCGGGTTCACGCACACACTGCGGCAGCTGGACGCCGAGATCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACAAGGAGAAGGGGTTCCGG         GTGGATAAGATTGTGGAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 CGGACAAGGAGAAGGGGTTCCGGGTG...CAGGTGGATAAGATTGTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCTGCAGCAGTTAATGCAGGTGTATGACTTGGCTGCCCTTCGGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101766 CAGCTGCAGCAGTTAATGCAGGTGTATGACTTGGCTGCCCTTCGGGATTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTGGAGCTACTTGGAGCGTCGGCTCTTCAGCCGCTTGGAGGATATATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101816 TTGGAGCTACTTGGAGCGTCGGCTCTTCAGCCGCTTGGAGGATATATACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACCCACAATCCACAAGCTGAAAACCAGCCTGTTTCGATTTTATCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101866 GACCCACAATCCACAAGCTGAAAACCAGCCTGTTTCGATTTTATCTTGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACACAATCCAG         ACAAACAGAAATGACAAGGCTCAGGAGTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101916 TACACAATCCAGGTG...CAGACAAACAGAAATGACAAGGCTCAGGAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTTGCAAAGCAGGCCACGGAACTCCAGAACCAGGCTGAGTGGAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102534 CTTTGCAAAGCAGGCCACGGAACTCCAGAACCAGGCTGAGTGGAAGGATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGTTTGTCCTGCCCTTCCTGCCATCCCCGGACACCAACCCCACCTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102584 GGTTTGTCCTGCCCTTCCTGCCATCCCCGGACACCAACCCCACCTTTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACCTACTTTTCTCGACAGTGGGCTGACACCTTCATTGTGTCCCTGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102634 ACCTACTTTTCTCGACAGTGGGCTGACACCTTCATTGTGTCCCTGCACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCCTGAGCGTCCTGTTTCAGTGCATGCCAG         TCCCTGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||-| >>>...>>>|||||||||
 102684 CTTCCTGAGCGTCCTGTTTCAGTGCATGC ATATC...CAGTCCCTGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGAACTTTGATGCGGAGTGTCAGAGGACTAACCAGGTTCAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104313 TCCTGAACTTTGATGCGGAGTGTCAGAGGACTAACCAGGTTCAAGAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATGAAGTTCTGCGTCAGAAG         CTTTTTGCATTGCAAGCTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104363 AATGAAGTTCTGCGTCAGAAGGTT...TAGCTTTTTGCATTGCAAGCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AATCCACCGACTGAAGAAAGAGGAGCAACAGCCAGAAGAGGAAGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105465 AATCCACCGACTGAAGAAAGAGGAGCAACAGCCAGAAGAGGAAGAGGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGTCCAACACAAATTGCCTCCTTATGTCTCCAACATGGACCGCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105515 TGGTCCAACACAAATTGCCTCCTTATGTCTCCAACATGGACCGCCTGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACTCGGAACT         TGCCATGGTGTGCAGCCAAAGGAATGCCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105565 GACTCGGAACTGTG...CAGTGCCATGGTGTGCAGCCAAAGGAATGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTCTCCCAGTCACCTCGTGTGGGCTTCCTGTCCTCGCTGCTGCCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107100 CCTCTCCCAGTCACCTCGTGTGGGCTTCCTGTCCTCGCTGCTGCCTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTAAGAAGAGCCCCTCAAGGTTGTCGCCTGCTCAGGGCCCTCCTCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107150 GTAAGAAGAGCCCCTCAAGGTTGTCGCCTGCTCAGGGCCCTCCTCAACCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CAGAGCTCGGCCAAGAAAGAGTCCTTCGGTGGTCAG         GGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107200 CAGAGCTCGGCCAAGAAAGAGTCCTTCGGTGGTCAGGTA...TAGGGCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGGGAAAGGACCCGACGTCCGGAGCCAAGGATGGGAAGAGCCTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113357 CAAGGGAAAGGACCCGACGTCCGGAGCCAAGGATGGGAAGAGCCTCCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCGGGCTGGCCACTGGGGAGTCCGGTTGGTCACAGCACCGGCAGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113407 GCGGGCTGGCCACTGGGGAGTCCGGTTGGTCACAGCACCGGCAGCGGCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGCAGGACCATGGCAAGGAGAGGAAGGAGCTTTTCTCCACAACCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113457 CTGCAGGACCATGGCAAGGAGAGGAAGGAGCTTTTCTCCACAACCACTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCAG         TGTGCAGAGAAGAAACCAGAAGCCAGTGGCCCAGAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113507 CCAGGTA...CAGTGTGCAGAGAAGAAACCAGAAGCCAGTGGCCCAGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTGAGCCCTGCCCAGAGCTCCACACGGAGCCAGTGGAGCCACTGACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115203 CTGAGCCCTGCCCAGAGCTCCACACGGAGCCAGTGGAGCCACTGACTCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCATCCTCGGCAGGCCCTGAGGGTGGAGGAGTCCGCCCCGAGCAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115253 GCATCCTCGGCAGGCCCTGAGGGTGGAGGAGTCCGCCCCGAGCAGCCCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TATTGTGCTGGGACAGGAGGAGTACGGGGAACACCACTCATCCATCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115303 TATTGTGCTGGGACAGGAGGAGTACGGGGAACACCACTCATCCATCATGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACTGCAG         AGTGGACTGCTCTGGGAGGAGAGTCGCCAGCTTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115353 ACTGCAGGTG...CAGAGTGGACTGCTCTGGGAGGAGAGTCGCCAGCTTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GACGTAGATGGGGTCATCAAAGTGTGGTCCTTCAACCCCATCATGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116453 GACGTAGATGGGGTCATCAAAGTGTGGTCCTTCAACCCCATCATGCAGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CAAAGCATCCTCCATTTCCAAATCACCGCTGCTGTCTTTGGAATGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116503 CAAAGCATCCTCCATTTCCAAATCACCGCTGCTGTCTTTGGAATGGGCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCAAACGGGACAGACTG         CTCTTGCTGGGCAGTGGTGTGGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 116553 CCAAACGGGACAGACTGGTG...CAGCTCTTGCTGGGCAGTGGTGTGGGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ACAGTGCGTCTCTATGACACGGAAGCCAAGAAGAATCTCTGTGAAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117855 ACAGTGCGTCTCTATGACACGGAAGCCAAGAAGAATCTCTGTGAAATCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TATCAACGACAACATGCCCAG         AATCCTGTCTCTTGCGTGCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 117905 TATCAACGACAACATGCCCAGGTG...CAGAATCCTGTCTCTTGCGTGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GCCCCAACGGGGCCTCTTTCGTCTGTTCGGCAGCAGCTCCGAGCCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118124 GCCCCAACGGGGCCTCTTTCGTCTGTTCGGCAGCAGCTCCGAGCCTCACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TCCCAGGTGGACTTCTCAGCACCAGACATCGGCAGCAAGGGCATGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 118174 TCCCAGGTGGACTTCTCAGCACCAGACATCGGCAGCAAGGGCATGAACCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GGTTCCTGGCAGGCTGCTGCTGTGGGACACGAAAACCATGAAGCAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 118224 GGTTCCTGGCAGGCTGCTGCTGTGGGACACGAAAACCATGAAGCAGCAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1660         CTCCAGTTCTCCCTGGATCCAGAACCCATTGCTATCAACTGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118274 TA...TAGCTCCAGTTCTCCCTGGATCCAGAACCCATTGCTATCAACTGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 ACAGCCTTCAATCACAACGGGAACCTGCTGGTCACAGGGGCAGCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122093 ACAGCCTTCAATCACAACGGGAACCTGCTGGTCACAGGGGCAGCTGATGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CGTCATCCGGCTGTTTG         ACATGCAGCAGCATGAGTGCGCGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 122143 CGTCATCCGGCTGTTTGGTA...CAGACATGCAGCAGCATGAGTGCGCGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TGAGCTGGAGGGCCCACTACGGGGAGGTCTACTCTGTGGAGTTCAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122982 TGAGCTGGAGGGCCCACTACGGGGAGGTCTACTCTGTGGAGTTCAGCTAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GATGAGAACACCGTGTACAGCATCGGCGAGGACGGGAAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 123032 GATGAGAACACCGTGTACAGCATCGGCGAGGACGGGAAGGTA...CAGTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CATCCAGTGGAACATCCACAAGAGTGGCCTCAAGGTATCCGAGTACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124336 CATCCAGTGGAACATCCACAAGAGTGGCCTCAAGGTATCCGAGTACAGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TCCCCTCAGATGCCACGGGCCCCTTTGTGCTGTCTGGATACAGCGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124386 TCCCCTCAGATGCCACGGGCCCCTTTGTGCTGTCTGGATACAGCGGCTAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AAGCAGGTTCAAGTCCCCAGGGGCCGACTCTTCGCTTTTGACTCGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124436 AAGCAGGTTCAAGTCCCCAGGGGCCGACTCTTCGCTTTTGACTCGGAGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 AAATTACATGCTGACATGTTCTGCCACAGGCGGCGTCATCTACAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124486 AAATTACATGCTGACATGTTCTGCCACAGGCGGCGTCATCTACAAGGTA.

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080      CTGGGTGGCGATGAGAAGGTTCTGGAGAGCTGCTTGAGCCTAGGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124536 ..CAGCTGGGTGGCGATGAGAAGGTTCTGGAGAGCTGCTTGAGCCTAGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GGCCACCGAGCCCCTGTGGTCACCGTGGACTGGAGCACTGCCATGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125233 GGCCACCGAGCCCCTGTGGTCACCGTGGACTGGAGCACTGCCATGGACTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TGGGACCTGCCTCACCGCCTCCATGGATGGCAAGATCAAGCTGACCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125283 TGGGACCTGCCTCACCGCCTCCATGGATGGCAAGATCAAGCTGACCACCC

   2350     .    :    .
   2225 TCCTGGCCCATAAAGCC
        |||||||||||||||||
 125333 TCCTGGCCCATAAAGCC