seq1 = pF1KE0026.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KE0026/gi568815587r_4500279.tfa (gi568815587r:4500279_4705504), 205226 bp

>pF1KE0026 1455
>gi568815587r:4500279_4705504 (Chr11)

(complement)

1-426  (100001-100426)   100% ->
427-528  (102165-102264)   97% ->
529-783  (103099-103353)   100% ->
784-806  (103819-103841)   100% ->
807-907  (104378-104478)   99% ->
908-1455  (104679-105226)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCCACAGCCTTGGTGGAAGCCATTGTGGAAGAAGTGGCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCCACAGCCTTGGTGGAAGCCATTGTGGAAGAAGTGGCCTGTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTGTATGACCTTCCTGAGGGAGCCCATGAGCATTGACTGTGGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCTGTATGACCTTCCTGAGGGAGCCCATGAGCATTGACTGTGGCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCTGCCACAGCTGTCTCTCTGGACTCTGGGAGATCCCAGGAGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCTGCCACAGCTGTCTCTCTGGACTCTGGGAGATCCCAGGAGAATCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGAACTGGGGTTACACCTGTCCCCTCTGTCGAGCTCCTGTCCAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGAACTGGGGTTACACCTGTCCCCTCTGTCGAGCTCCTGTCCAGCCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACCTGCGGCCTAATTGGCAGCTGGCCAATGTTGTAGAAAAAGTCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACCTGCGGCCTAATTGGCAGCTGGCCAATGTTGTAGAAAAAGTCCGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTAAGGCTACATCCAGGAATGGGGCTGAAGGGTGACCTGTGTGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTAAGGCTACATCCAGGAATGGGGCTGAAGGGTGACCTGTGTGAGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATGGGGAAAAGCTGAAGATGTTCTGCAAAGAGGATGTCTTGATAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATGGGGAAAAGCTGAAGATGTTCTGCAAAGAGGATGTCTTGATAATGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGGCCTGCAGCCAGTCCCCAGAGCATGAGGCCCACAGTGTTGTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGGCCTGCAGCCAGTCCCCAGAGCATGAGGCCCACAGTGTTGTGCCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGGATGTTGCCTGGGAGTACAAG         TGGGAACTTCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100401 TGGAGGATGTTGCCTGGGAGTACAAGGTG...CAGTGGGAACTTCATGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCTCGAACATCTGAAGAAAGAGCAAGAAGAGGCCTGGAAGCTTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 GCCCTCGAACATCTGAAGAAAGAGCAAGAAGAGGCCTGGAAGCTTGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGTGAAAGGAAACGAACTGCCACCTGGAAGATACAG         GTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| --|||>>>...>>>||||
 102230 TGGTGAAAGGAAACGAACTGCCACCTGGAAGG  CAGGTT...CAGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAACCCGAAAACAGAGTATTGTATGGGAGTTTGAAAAATACCAGCGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103103 AAACCCGAAAACAGAGTATTGTATGGGAGTTTGAAAAATACCAGCGATTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTAGAGAAAAAGCAGCCACCACATCGGCAGCTGGGGGCAGAGGTAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103153 CTAGAGAAAAAGCAGCCACCACATCGGCAGCTGGGGGCAGAGGTAGCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGCTCTGGCCAGCCTACAGCGGGAGGCAGCGGAGACCATGCAGAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103203 AGCTCTGGCCAGCCTACAGCGGGAGGCAGCGGAGACCATGCAGAAACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGTTGAACCATAGCGAGCTCATCCAGCAGAGCCAGGTCCTGTGGAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103253 AGTTGAACCATAGCGAGCTCATCCAGCAGAGCCAGGTCCTGTGGAGGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATTGCAGAGTTGAAAGAGAGGTCGCAGAGGCCTGTCCGCTGGATGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103303 ATTGCAGAGTTGAAAGAGAGGTCGCAGAGGCCTGTCCGCTGGATGTTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 G         GATATTCAGGAAGTGTTAAACAG         GAGCAAAT
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 103353 GGTG...CAGGATATTCAGGAAGTGTTAAACAGGTA...CAGGAGCAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTTGGAGCTTGCAGCAGCCAGAACCAATCTCCCTGGAGTTGAAGACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104386 CTTGGAGCTTGCAGCAGCCAGAACCAATCTCCCTGGAGTTGAAGACAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TGCCGTGTACTGGGGCTAAGAGAGATCCTGAAGACTTATGCAG       
        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104436 TGCCGTGTGCTGGGGCTAAGAGAGATCCTGAAGACTTATGCAGGTA...T

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    908   CTGATGTGCGCTTGGATCCAGATACTGCTTACTCCCGTCTCATCGTGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104677 AGCTGATGTGCGCTTGGATCCAGATACTGCTTACTCCCGTCTCATCGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTGAGGACAGAAAACGTGTGCACTATGGAGACACCAACCAGAAACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104727 CTGAGGACAGAAAACGTGTGCACTATGGAGACACCAACCAGAAACTGCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GACAATCCTGAGAGATTTTACCGCTATAATATCGTCCTGGGAAGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104777 GACAATCCTGAGAGATTTTACCGCTATAATATCGTCCTGGGAAGCCAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CATCTCCTCAGGCCGGCACTACTGGGAGGTGGAGGTGGGAGACAGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104827 CATCTCCTCAGGCCGGCACTACTGGGAGGTGGAGGTGGGAGACAGGTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGTGGGGCCTGGGAGTATGTAAGCAAAATGTAGACCGGAAGGAGGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104877 AGTGGGGCCTGGGAGTATGTAAGCAAAATGTAGACCGGAAGGAGGTGGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TACTTATCCCCCCACTATGGATTCTGGGTGATAAGGCTGAGGAAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104927 TACTTATCCCCCCACTATGGATTCTGGGTGATAAGGCTGAGGAAGGGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGAGTACCGAGCAGGCACCGATGAGTACCCAATCCTGTCCTTGCCGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104977 TGAGTACCGAGCAGGCACCGATGAGTACCCAATCCTGTCCTTGCCGGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTCCTCGCCGGGTGGGAATCTTCGTGGATTATGAGGCCCATGACATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105027 CTCCTCGCCGGGTGGGAATCTTCGTGGATTATGAGGCCCATGACATTTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TTCTACAATGTGACTGACTGTGGCTCCCACATCTTCACTTTCCCCCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105077 TTCTACAATGTGACTGACTGTGGCTCCCACATCTTCACTTTCCCCCGCTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TCCCTTCCCTGGGCGCCTCCTGCCCTATTTTAGTCCTTGCTACAGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105127 TCCCTTCCCTGGGCGCCTCCTGCCCTATTTTAGTCCTTGCTACAGCATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GAACCAACAACACTGCTCCTCTGGCCATCTGCTCCCTGGATGGGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105177 GAACCAACAACACTGCTCCTCTGGCCATCTGCTCCCTGGATGGGGAGGAC