seq1 = pF1KE0014.tfa, 1461 bp
seq2 = pF1KE0014/gi568815586r_6877149.tfa (gi568815586r:6877149_7118424), 241276 bp

>pF1KE0014 1461
>gi568815586r:6877149_7118424 (Chr12)

(complement)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-259  (134886-134993)   100% ->
260-366  (135643-135749)   100% ->
367-460  (136521-136614)   100% ->
461-498  (136793-136830)   100% ->
499-677  (137243-137421)   100% ->
678-786  (138846-138954)   100% ->
787-873  (139736-139822)   100% ->
874-1040  (139918-140084)   100% ->
1041-1188  (140680-140827)   100% ->
1189-1347  (140900-141058)   100% ->
1348-1461  (141163-141276)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCTCAGCGGAGGGGGACGAGGGGACTGTGGTGGCGCTGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCTCAGCGGAGGGGGACGAGGGGACTGTGGTGGCGCTGGCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTCTGCAGTCGGGTTTCCAGGAGCTGAGCCTTAACAAGTTGGCGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTTCTGCAGTCGGGTTTCCAGGAGCTGAGCCTTAACAAGTTGGCGACGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGGGCGCGTCAGAACAGGCGCTGCGGCTGATCATCTCCATCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGGGCGCGTCAGAACAGGCGCTGCGGCTGATCATCTCCATCTTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         GTTACCCCTTTGCTTTGTTTTATCGGCATTACCTTTTCTA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTA...TAGGTTACCCCTTTGCTTTGTTTTATCGGCATTACCTTTTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGAGACCTACCTCATCCACCTCTTCCATACCTTTACAGGCCTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134926 CAAGGAGACCTACCTCATCCACCTCTTCCATACCTTTACAGGCCTCTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGCTTATTTTAACTTTG         GAAACCAGCTCTACCACTCCCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 134976 TTGCTTATTTTAACTTTGGTG...CAGGAAACCAGCTCTACCACTCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGTGTATTGTGCTTCAGTTCCTCATCCTTCGACTAATGGGCCGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135666 CTGTGTATTGTGCTTCAGTTCCTCATCCTTCGACTAATGGGCCGCACCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACTGCCGTCCTCACTACCTTTTGCTTCCAGATG         GCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 135716 CACTGCCGTCCTCACTACCTTTTGCTTCCAGATGGTA...TAGGCCTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCTGGCTGGATACTATTACACTGCCACCGGCAACTACGATATCAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136528 TTCTGGCTGGATACTATTACACTGCCACCGGCAACTACGATATCAAGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACAATGCCACATTGTGTTCTGACTTTGAAGCTGATTG         GTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 136578 ACAATGCCACATTGTGTTCTGACTTTGAAGCTGATTGGTG...CAGGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGCTGTTGACTACTTTGACGGAGGGAAAGATCAG         AATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 136797 GGCTGTTGACTACTTTGACGGAGGGAAAGATCAGGTA...TAGAATTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGTCCTCTGAGCAACAGAAATATGCCATACGTGGTGTTCCTTCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137250 TGTCCTCTGAGCAACAGAAATATGCCATACGTGGTGTTCCTTCCCTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGTTGCTGGTTTCTCCTACTTCTATGGGGCCTTCTTGGTAGGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137300 GAAGTTGCTGGTTTCTCCTACTTCTATGGGGCCTTCTTGGTAGGGCCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTCTCAATGAATCACTACATGAAGCTGGTGCAGGGAGAGCTGATTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137350 GTTCTCAATGAATCACTACATGAAGCTGGTGCAGGGAGAGCTGATTGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TACCAGGAAAGATACCAAACAG         CATCATTCCTGCTCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 137400 TACCAGGAAAGATACCAAACAGGTA...CAGCATCATTCCTGCTCTCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CGCCTGAGTCTGGGCCTTTTCTACCTAGTGGGCTACACACTGCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138865 CGCCTGAGTCTGGGCCTTTTCTACCTAGTGGGCTACACACTGCTCAGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCACATCACAGAAGACTATCTCCTCACTGAAGACTATGAC         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 138915 CCACATCACAGAAGACTATCTCCTCACTGAAGACTATGACGTG...AAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACCACCCCTTCTGGTTCCGCTGCATGTACATGCTGATCTGGGGCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139737 ACCACCCCTTCTGGTTCCGCTGCATGTACATGCTGATCTGGGGCAAGTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGCTGTACAAATATGTCACCTGTTGGCTGGTCACA         GAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 139787 GTGCTGTACAAATATGTCACCTGTTGGCTGGTCACAGTA...CAGGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGTATGCATTTTGACGGGCCTGGGCTTCAATGGCTTTGAAGAAAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139923 AGTATGCATTTTGACGGGCCTGGGCTTCAATGGCTTTGAAGAAAAGGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGCAAAGTGGGATGCCTGTGCCAACATGAAGGTGTGGCTCTTTGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139973 AGGCAAAGTGGGATGCCTGTGCCAACATGAAGGTGTGGCTCTTTGAAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AACCCCCGCTTCACTGGCACCATTGCCTCATTCAACATCAACACCAACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140023 AACCCCCGCTTCACTGGCACCATTGCCTCATTCAACATCAACACCAACGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CTGGGTGGCCCG         CTACATCTTCAAACGACTCAAGTTCCTTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 140073 CTGGGTGGCCCGGTG...CAGCTACATCTTCAAACGACTCAAGTTCCTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GAAATAAAGAACTCTCTCAGGGTCTCTCGTTGCTATTCCTGGCCCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140709 GAAATAAAGAACTCTCTCAGGGTCTCTCGTTGCTATTCCTGGCCCTCTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CACGGCCTGCACTCAGGATACCTGGTCTGCTTCCAGATGGAATTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140759 CACGGCCTGCACTCAGGATACCTGGTCTGCTTCCAGATGGAATTCCTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGTTATTGTGGAAAGACAG         GCTGCCAGGCTCATTCAAGAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 140809 TGTTATTGTGGAAAGACAGGTA...CAGGCTGCCAGGCTCATTCAAGAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GCCCCACCCTGAGCAAGCTGGCCGCCATTACTGTCCTCCAGCCCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140922 GCCCCACCCTGAGCAAGCTGGCCGCCATTACTGTCCTCCAGCCCTTCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TATTTGGTGCAACAGACCATCCACTGGCTCTTCATGGGTTACTCCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140972 TATTTGGTGCAACAGACCATCCACTGGCTCTTCATGGGTTACTCCATGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGCCTTCTGCCTCTTCACGTGGGACAAATGGCTTAAG         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 141022 TGCCTTCTGCCTCTTCACGTGGGACAAATGGCTTAAGGCA...CAGGTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ATAAATCCATCTATTTCCTTGGCCACATCTTCTTCCTGAGCCTACTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141167 ATAAATCCATCTATTTCCTTGGCCACATCTTCTTCCTGAGCCTACTATTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ATATTGCCTTATATTCACAAAGCAATGGTGCCAAGGAAAGAGAAGTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141217 ATATTGCCTTATATTCACAAAGCAATGGTGCCAAGGAAAGAGAAGTTAAA

   1550     .    :
   1452 GAAGATGGAA
        ||||||||||
 141267 GAAGATGGAA