seq1 = pF1KE0008.tfa, 2091 bp
seq2 = pF1KE0008/gi568815591r_112667200.tfa (gi568815591r:112667200_112884825), 217626 bp

>pF1KE0008 2091
>gi568815591r:112667200_112884825 (Chr7)

(complement)

1-1128  (100001-101128)   99% ->
1129-1271  (109508-109650)   99% ->
1272-1546  (111771-112045)   100% ->
1547-2091  (117082-117626)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTAAATCACTGTGTTATTGCTTTAGTCATTGTCTCTATTTAGCAAT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTAAATCACTGCGTTATTGCTTTAGTCATTGTCTCTATTTAGCAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAAGACTGGAAGAAGTAAATAGAGAAGTGAACATGCATTCTTCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAAGACTGGAAGAAGTAAATAGAGAAGTGAACATGCATTCTTCAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTATCTTGGCTATTTAGCCAGAATCAATTTATTGGTTGCTATATGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTATCTTGGCTATTTAGCCAGAATCAATTTATTGGTTGCTATATGCTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTCTATACGTAAGATGGGAAAAAACAGCAAATTCCTTAATTTTGGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTCTATACGTAAGATGGGAAAAAACAGCAAATTCCTTAATTTTGGTAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTATTCTTGGTCTTTTTGTTCTTGGAATCGCCAGCATACTCTATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTATTCTTGGTCTTTTTGTTCTTGGAATCGCCAGCATACTCTATTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTTTCAATGGAAGCAGCAAGTTTAAGTCTCTCCAATCTTTGGTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTTTCAATGGAAGCAGCAAGTTTAAGTCTCTCCAATCTTTGGTTTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTGCTTGGCCTCCTATGTTTTCTTGATAATTCATCCTTTAAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTGCTTGGCCTCCTATGTTTTCTTGATAATTCATCCTTTAAAAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTAAAAGAAGAATCAACCAAATATTTGCTTCTAACATCCATAGTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTAAAAGAAGAATCAACCAAATATTTGCTTCTAACATCCATAGTGTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGATATTGTGCTCTCTGGTGGAGAGAATTTCTGGCTATGTCCGTCATCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100401 GGATATTGTGCTCTCTGGTGGAGAGAATTTCTGGTTATGTCCGTCATCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCACTTTACTAACCACAGTTGAATTTCTGGAGCTTGTTGGATTTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCACTTTACTAACCACAGTTGAATTTCTGGAGCTTGTTGGATTTGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCCAGCACAACTATGTTGGTGGAGAAGTCTCTGAGTGTCATTTTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCCAGCACAACTATGTTGGTGGAGAAGTCTCTGAGTGTCATTTTGCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGTAGCTCTGGCTATGCTGATTATTGATCTGAGAATGAAATCTTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGTAGCTCTGGCTATGCTGATTATTGATCTGAGAATGAAATCTTTCTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTATTCCAAACTTAGTTATTTTTGCAGTTTTGTTATTTTTTTCCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTATTCCAAACTTAGTTATTTTTGCAGTTTTGTTATTTTTTTCCTCATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGAAACTCCCAAAAATCCGATTGCTTTTGCGTGTTTTTTTATTTGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGAAACTCCCAAAAATCCGATTGCTTTTGCGTGTTTTTTTATTTGCCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TAACTGATCCTTTCCTTGACATTTATTTTAGTGGACTTTCAGTAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TAACTGATCCTTTCCTTGACATTTATTTTAGTGGACTTTCAGTAACTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGATGGAAACCCTTTTTGTACCGTGGAAGAATTTGCAGAAGACTTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGATGGAAACCCTTTTTGTACCGTGGAAGAATTTGCAGAAGACTTTCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGTTTTTGCTGGAATGATTGAGCTTACATTTTTTATTCTTTCCGCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGTTTTTGCTGGAATGATTGAGCTTACATTTTTTATTCTTTCCGCATTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AACTTAGAGACACTCACCTCTGGTATTTTGTAATACCTGGCTTTTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AACTTAGAGACACTCACCTCTGGTATTTTGTAATACCTGGCTTTTCCATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTTGGAATTTTCAGGATGATTTGTCATATTATTTTTCTTTTAACTCTTTG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTTGGAATTTTCTGGATGATTTGTCATATTATTTTTCTTTTAACTCTTTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGGATTCCATACCAAATTAAATGACTGCCATAAAGTATATTTTACTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGGATTCCATACCAAATTAAATGACTGCCATAAAGTATATTTTACTCACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGACAGATTACAATAGCCTTGATAGAATCATGGCATCCAAAGGGATGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGACAGATTACAATAGCCTTGATAGAATCATGGCATCCAAAGGGATGCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CATTTTTGCTTGATTTCAGAGCAGTTGGTGTTCTTTAGTCTTCTTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CATTTTTGCTTGATTTCAGAGCAGTTGGTGTTCTTTAGTCTTCTTGCAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGCGATTTTGGGAGCAGTTTCCTGGCAG         CCAACAAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101101 AGCGATTTTGGGAGCAGTTTCCTGGCAGGTA...TAGCCAACAAATGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TTTTCTTGAGCATGTTCCTAATCGTTTTGCCATTGGAATCCATGGCTCAT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 109521 TTTTCTTGAGCATGTTTCTAATCGTTTTGCCATTGGAATCCATGGCTCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GGGCTCTTCCATGAATTGGGTAACTGTTTAGGAGGAACATCTGTTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109571 GGGCTCTTCCATGAATTGGGTAACTGTTTAGGAGGAACATCTGTTGGATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TGCTATTGTGATTCCCACCAACTTCTGCAG         TCCTGATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 109621 TGCTATTGTGATTCCCACCAACTTCTGCAGGTA...CAGTCCTGATGGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AGCCAACACTGCTTCCCCCAGAACATGTACAGGAGTTAAATTTGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111782 AGCCAACACTGCTTCCCCCAGAACATGTACAGGAGTTAAATTTGAGGTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ACTGGCATGCTCAATGCTATCCAAAGATTTTTTGCATATCATATGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111832 ACTGGCATGCTCAATGCTATCCAAAGATTTTTTGCATATCATATGATTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GACCTATGGATGTGACTATTCCACAAGTGGACTGTCATTTGATACTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111882 GACCTATGGATGTGACTATTCCACAAGTGGACTGTCATTTGATACTCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 ATTCCAAACTAAAAGCTTTCCTCGAACTTCGGACAGTGGATGGACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111932 ATTCCAAACTAAAAGCTTTCCTCGAACTTCGGACAGTGGATGGACCCAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CATGATACGTATATTTTGTATTACAGTGGGCACACCCATGGTACAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111982 CATGATACGTATATTTTGTATTACAGTGGGCACACCCATGGTACAGGAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GTGGGCTCTAGCAG         GTGGAGATACACTACGCCTTGACACAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112032 GTGGGCTCTAGCAGGTA...CAGGTGGAGATACACTACGCCTTGACACAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 TTATAGAATGGTGGAGAGAAAAGAATGGTTCCTTTTGTTCCCGGCTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117109 TTATAGAATGGTGGAGAGAAAAGAATGGTTCCTTTTGTTCCCGGCTTATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 ATCGTATTAGACAGCGAAAATTCAACCCCTTGGGTGAAAGAAGTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117159 ATCGTATTAGACAGCGAAAATTCAACCCCTTGGGTGAAAGAAGTGAGGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 AATTAATGACCAGTATATTGCAGTGCAAGGAGCAGAGTTGATAAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117209 AATTAATGACCAGTATATTGCAGTGCAAGGAGCAGAGTTGATAAAAACAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TAGATATTGAAGAAGCTGACCCGCCACAGCTAGGTGACTTTACAAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117259 TAGATATTGAAGAAGCTGACCCGCCACAGCTAGGTGACTTTACAAAAGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 TGGGTAGAATATAACTGCAACTCCTGTAATAACATCTGCTGGACTGAAAA
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 117309 TGGGTAGAATATAACTGCAACTCCAGTAATAACATCTGCTGGACTGAAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GGGACGCACAGTGAAAGCAGTATATGGTGTGTCAAAACGGTGGAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117359 GGGACGCACAGTGAAAGCAGTATATGGTGTGTCAAAACGGTGGAGTGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 ACACTCTGCATTTGCCAACGGGAAGCGATGTGGCCAAGCACTGGATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117409 ACACTCTGCATTTGCCAACGGGAAGCGATGTGGCCAAGCACTGGATGTTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 CACTTTCCTCGTATTACATATCCCCTAGTGCATTTGGCAAATTGGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117459 CACTTTCCTCGTATTACATATCCCCTAGTGCATTTGGCAAATTGGTTATG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 CGGTCTGAACCTTTTTTGGATCTGCAAAACTTGTTTTAGGTGCTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117509 CGGTCTGAACCTTTTTTGGATCTGCAAAACTTGTTTTAGGTGCTTGAAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 GATTAAAAATGAGTTGGTTTCTTCCTACTGTGCTGGACACAGGACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117559 GATTAAAAATGAGTTGGTTTCTTCCTACTGTGCTGGACACAGGACAAGGC

   2100     .    :    .
   2074 TTCAAACTTGTCAAATCT
        ||||||||||||||||||
 117609 TTCAAACTTGTCAAATCT