seq1 = pF1KE0005.tfa, 2103 bp
seq2 = pF1KE0005/gi568815586r_43630379.tfa (gi568815586r:43630379_43855245), 224867 bp

>pF1KE0005 2103
>gi568815586r:43630379_43855245 (Chr12)

(complement)

1-910  (100001-100910)   100% ->
911-1070  (106637-106796)   100% ->
1071-1263  (109008-109200)   100% ->
1264-1362  (112691-112789)   100% ->
1363-1444  (116855-116936)   100% ->
1445-1725  (118585-118865)   100% ->
1726-1779  (123488-123541)   100% ->
1780-2103  (124544-124867)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAAGATACAGATTATAGAATCAGGTTTAGTTCTTTGTGTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGAAGATACAGATTATAGAATCAGGTTTAGTTCTTTGTGTTTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAATGATCACGTTGGATTTCATGGCACTATAAAAAGCTCACCAAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAATGATCACGTTGGATTTCATGGCACTATAAAAAGCTCACCAAGTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTATTGTTATTGAAATTGATGAACAGGGACAGTTAGTTAATAAGACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTATTGTTATTGAAATTGATGAACAGGGACAGTTAGTTAATAAGACCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGAGCCTATTTTCAAGATTAGTGAAATACAACTTGAGCCAAATAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGAGCCTATTTTCAAGATTAGTGAAATACAACTTGAGCCAAATAATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCCAAAAAACCAAAACTAGATCTTCAAAATCTGTCCTTAGAAGATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCCAAAAAACCAAAACTAGATCTTCAAAATCTGTCCTTAGAAGATGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAAACCAAGAAGTTCATACTTTGATTAAGTACACTGATGGTGACCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAAACCAAGAAGTTCATACTTTGATTAAGTACACTGATGGTGACCAAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATCAGTCTGGTTCAGAAAAGGAAGATACTATCGTTGATGGAACTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATCAGTCTGGTTCAGAAAAGGAAGATACTATCGTTGATGGAACTTCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATGTGAAGAAAAAGCTGATGTTTTAAGCTCCTTTTTGGATGAAAAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATGTGAAGAAAAAGCTGATGTTTTAAGCTCCTTTTTGGATGAAAAAACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGAGTTACTGAATAATTTTGCCTGTGATGTAAGAGAGAAGTGGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGAGTTACTGAATAATTTTGCCTGTGATGTAAGAGAGAAGTGGCTTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAAACAGAGCTAATTGGACTACCTCCTGAATTCTCAATAGGCAGAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAAACAGAGCTAATTGGACTACCTCCTGAATTCTCAATAGGCAGAATCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGACAAAAACCAGAGGGCTAGTTTACACAGTGCCATTAGGCAGAAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGACAAAAACCAGAGGGCTAGTTTACACAGTGCCATTAGGCAGAAATTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CATTTTTAGTAACTGTAGGAAAAAACAGTGAAATTGTTGTAAAACCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CATTTTTAGTAACTGTAGGAAAAAACAGTGAAATTGTTGTAAAACCAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTGAATATAAAGAACTTTGTCATTTGGTATCTGAAGAGGAAGCATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTGAATATAAAGAACTTTGTCATTTGGTATCTGAAGAGGAAGCATTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTTTTTAAATATTTGGATGCAAAGAAAGAAAATTCCAAATTTACCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTTTTTAAATATTTGGATGCAAAGAAAGAAAATTCCAAATTTACCTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACCTGATACAAACAAAGACCACAGAAAAGCTGTCCACCATTTTGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AACCTGATACAAACAAAGACCACAGAAAAGCTGTCCACCATTTTGTCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAAAAGTTTGGAAACCTTGTGGAAACCAAATCTTTTTCTAAAATGAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAAAAGTTTGGAAACCTTGTGGAAACCAAATCTTTTTCTAAAATGAATTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGTGCTGGTAATCCGAATGTGGTGGTAACAGTAAGATTTCGGGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGTGCTGGTAATCCGAATGTGGTGGTAACAGTAAGATTTCGGGAAAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CACACAAACGTGGGAAAAGGCCTCTTTCTGAATGCCAAGAAGGAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CACACAAACGTGGGAAAAGGCCTCTTTCTGAATGCCAAGAAGGAAAAGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATATATACAG         CTTTTACCCTACGAAAGGAAAACCTGGAAAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATATATACAGGTA...CAGCTTTTACCCTACGAAAGGAAAACCTGGAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GTTTGAAGCGATTGGTTTTTTAGCTATCAAACTTGGTGTTATTCCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106668 GTTTGAAGCGATTGGTTTTTTAGCTATCAAACTTGGTGTTATTCCTTCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATTTTAGTTATGCAGGCCTTAAAGACAAGAAAGCCATCACCTATCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106718 ATTTTAGTTATGCAGGCCTTAAAGACAAGAAAGCCATCACCTATCAAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATGGTTGTTAGAAAAGTGACTCCAGAGAG         GTTGAAAAATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106768 ATGGTTGTTAGAAAAGTGACTCCAGAGAGGTA...CAGGTTGAAAAATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGAAAAAGAAATTGAAAAGAAAAGAATGAATGTCTTTAATATTCGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109020 TGAAAAAGAAATTGAAAAGAAAAGAATGAATGTCTTTAATATTCGGTCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TAGATGATTCCCTGAGACTTGGTCAGCTCAAAGGAAATCACTTTGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109070 TAGATGATTCCCTGAGACTTGGTCAGCTCAAAGGAAATCACTTTGATATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GTCATTAGAAATTTAAAAAAACAAATAAATGATTCTGCAAACCTGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109120 GTCATTAGAAATTTAAAAAAACAAATAAATGATTCTGCAAACCTGAGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GAGAATTATGGAAGCAATAGAAAATGTTAAG         AAAAAAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 109170 GAGAATTATGGAAGCAATAGAAAATGTTAAGGTA...TAGAAAAAAGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TTGTGAATTACTATGGACCACAGAGATTTGGGAAGGGAAGGAAAGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112701 TTGTGAATTACTATGGACCACAGAGATTTGGGAAGGGAAGGAAAGTTCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ACAGACCAAATTGGACTAGCTTTGCTGAAGAATGAAATG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112751 ACAGACCAAATTGGACTAGCTTTGCTGAAGAATGAAATGGTA...AAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GAAAGCCATAAAATTGTTTCTTACACCAGAAGACTTGGATGATCCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116857 GAAAGCCATAAAATTGTTTCTTACACCAGAAGACTTGGATGATCCTGTAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ATAGAGCAAAGAAGTATTTTCTTCAAACTG         AGGATGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 116907 ATAGAGCAAAGAAGTATTTTCTTCAAACTGGTA...CAGAGGATGCTAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GGCACACTTTCATTGATGCCTGAATTCAAAGTGCGTGAGAGAGCATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118596 GGCACACTTTCATTGATGCCTGAATTCAAAGTGCGTGAGAGAGCATTGTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 GGAGGCATTGCACCGCTTTGGCATGACCGAGGAAGGTTGTATCCAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118646 GGAGGCATTGCACCGCTTTGGCATGACCGAGGAAGGTTGTATCCAGGCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 GGTTCTCTTTACCCCATTCCATGCGCATATTCTATGTTCACGCATATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118696 GGTTCTCTTTACCCCATTCCATGCGCATATTCTATGTTCACGCATATACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 AGCAAAATTTGGAATGAGGCAGTATCTTACAGACTTGAAACCTATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118746 AGCAAAATTTGGAATGAGGCAGTATCTTACAGACTTGAAACCTATGGAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 AAGAGTAGTGCAGGGTGATTTGGTCTGTTTGGATGAAGACATTGATGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118796 AAGAGTAGTGCAGGGTGATTTGGTCTGTTTGGATGAAGACATTGATGACG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AGAATTTCCCAAATAGTAAA         ATTCACCTGGTAACTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118846 AGAATTTCCCAAATAGTAAAGTA...TAGATTCACCTGGTAACTGAAGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GAGGGATCAGCTAATATGTATGCAATACATCAG         GTGGTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 123509 GAGGGATCAGCTAATATGTATGCAATACATCAGGTA...CAGGTGGTTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TCCAGTACTTGGATACAATATTCAGTACCCGAAGAACAAAGTAGGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124552 TCCAGTACTTGGATACAATATTCAGTACCCGAAGAACAAAGTAGGGCAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 GGTACCATGACATACTTAGCAGAGATGGACTACAGACATGTAGGTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124602 GGTACCATGACATACTTAGCAGAGATGGACTACAGACATGTAGGTTTAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 GTACCTACTCTGAAACTGAATATACCAGGTTGCTATAGACAGATTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124652 GTACCTACTCTGAAACTGAATATACCAGGTTGCTATAGACAGATTTTGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 ACATCCCTGTAATCTCTCATACCAACTAATGGAAGATCATGACATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124702 ACATCCCTGTAATCTCTCATACCAACTAATGGAAGATCATGACATTGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 TCAAAACGAAAGGTTCCCACATTGATGAAACAGCTTTGTCTCTTTTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124752 TCAAAACGAAAGGTTCCCACATTGATGAAACAGCTTTGTCTCTTTTGATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2038 TCTTTTGATCTTGATGCTTCATGCTATGCTACCGTTTGTCTGAAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124802 TCTTTTGATCTTGATGCTTCATGCTATGCTACCGTTTGTCTGAAGGAAAT

   2150     .    :    .
   2088 AATGAAGCATGACGTT
        ||||||||||||||||
 124852 AATGAAGCATGACGTT