seq1 = pF1KB9995.tfa, 1755 bp
seq2 = pF1KB9995/gi568815588f_26116810.tfa (gi568815588f:26116810_26400958), 284149 bp

>pF1KB9995 1755
>gi568815588f:26116810_26400958 (Chr10)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-136  (100801-100860)   100% ->
137-286  (101033-101182)   100% ->
287-520  (102234-102467)   100% ->
521-611  (107078-107168)   100% ->
612-724  (107730-107842)   100% ->
725-840  (112853-112968)   100% ->
841-920  (129112-129191)   100% ->
921-975  (152310-152364)   100% ->
976-1092  (153831-153947)   100% ->
1093-1157  (156827-156891)   100% ->
1158-1236  (164200-164278)   100% ->
1237-1386  (169536-169685)   100% ->
1387-1494  (175656-175763)   100% ->
1495-1584  (176093-176182)   100% ->
1585-1755  (183979-184149)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCTCCGGGCTCTGGCTTTTGGTCTTTCGGGTCGGAAGATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCTCCGGGCTCTGGCTTTTGGTCTTTCGGGTCGGAAGATGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGGATTCCGAGAATCCCGGCACAG         CGCGAGCCTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 TGGGGATTCCGAGAATCCCGGCACAGGTA...CAGCGCGAGCCTGGTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGTGGCTCAGAAGTTCACGGGCGGCATCGGAAACAAACTGTGCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100816 AAGTGGCTCAGAAGTTCACGGGCGGCATCGGAAACAAACTGTGCGGTG..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     CCCTGCTCTACGGAGACGCCGAGAAGCCGGCGGAGAGCGGCGGGAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100866 .CAGCCCTGCTCTACGGAGACGCCGAGAAGCCGGCGGAGAGCGGCGGGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAACCCCCGCGGGCCGCCGCCCGGAAGGCCGCCTGCGCCTGCGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101079 CCAACCCCCGCGGGCCGCCGCCCGGAAGGCCGCCTGCGCCTGCGACCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCCCTGCAGCTGCTCCAAAGTGGATGTCAACTACGCGTTTCTCCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101129 AGCCCTGCAGCTGCTCCAAAGTGGATGTCAACTACGCGTTTCTCCATGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAG         ACCTGCTGCCGGCGTGTGATGGAGAAAGGCCCACTTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101179 ACAGGTA...TAGACCTGCTGCCGGCGTGTGATGGAGAAAGGCCCACTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCGTTTCTGCAAGATGTTATGAACATTTTACTTCAGTATGTGGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102271 GGCGTTTCTGCAAGATGTTATGAACATTTTACTTCAGTATGTGGTGAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTTTCGATAGATCAACCAAAGTGATTGATTTCCATTATCCTAATGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102321 GTTTCGATAGATCAACCAAAGTGATTGATTTCCATTATCCTAATGAGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCCAAGAATATAATTGGGAATTGGCAGACCAACCACAAAATTTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102371 CTCCAAGAATATAATTGGGAATTGGCAGACCAACCACAAAATTTGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AATTTTGATGCATTGCCAAACAACTCTAAAATATGCAATTAAAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102421 AATTTTGATGCATTGCCAAACAACTCTAAAATATGCAATTAAAACAGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    521       GGCATCCTAGATACTTCAATCAACTTTCTACTGGTTTGGATATG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102471 ...CAGGGCATCCTAGATACTTCAATCAACTTTCTACTGGTTTGGATATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTTGGATTAGCAGCAGACTGGCTGACATCAACAGCAAATACTAACAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 107122 GTTGGATTAGCAGCAGACTGGCTGACATCAACAGCAAATACTAACATGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    612       GTTCACCTATGAAATTGCTCCAGTATTTGTGCTTTTGGAATATG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107172 ...CAGGTTCACCTATGAAATTGCTCCAGTATTTGTGCTTTTGGAATATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCACACTAAAGAAAATGAGAGAAATCATTGGCTGGCCAGGGGGCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107774 TCACACTAAAGAAAATGAGAGAAATCATTGGCTGGCCAGGGGGCTCTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GATGGGATATTTTCTCCCG         GTGGCGCCATATCTAACATGTA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 107824 GATGGGATATTTTCTCCCGGTA...TAGGTGGCGCCATATCTAACATGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCCATGATGATCGCACGCTTTAAGATGTTCCCAGAAGTCAAGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112875 TGCCATGATGATCGCACGCTTTAAGATGTTCCCAGAAGTCAAGGAGAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GAATGGCTGCTCTTCCCAGGCTCATTGCCTTCACGTCTGAACAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112925 GAATGGCTGCTCTTCCCAGGCTCATTGCCTTCACGTCTGAACATGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    841    AGTCATTTTTCTCTCAAGAAGGGAGCTGCAGCCTTAGGGATTGGAAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129109 CAGAGTCATTTTTCTCTCAAGAAGGGAGCTGCAGCCTTAGGGATTGGAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGACAGCGTGATTCTGATTAAATGTGATGAGAG         AGGGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129159 AGACAGCGTGATTCTGATTAAATGTGATGAGAGGTG...CAGAGGGAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGATTCCATCTGATCTTGAAAGAAGGATTCTTGAAGCCAAACAGAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 152318 TGATTCCATCTGATCTTGAAAGAAGGATTCTTGAAGCCAAACAGAAAGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    976       GGGTTTGTTCCTTTCCTCGTGAGTGCCACAGCTGGAACCACCGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152368 ...CAGGGGTTTGTTCCTTTCCTCGTGAGTGCCACAGCTGGAACCACCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTACGGAGCATTTGACCCCCTCTTAGCTGTCGCTGACATTTGCAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153875 GTACGGAGCATTTGACCCCCTCTTAGCTGTCGCTGACATTTGCAAAAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATAAGATCTGGATGCATGTGGAT         GCAGCTTGGGGTGGGGGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 153925 ATAAGATCTGGATGCATGTGGATGTA...CAGGCAGCTTGGGGTGGGGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TTACTGATGTCCCGAAAACACAAGTGGAAACTGAGTGGCGTGGAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 156845 TTACTGATGTCCCGAAAACACAAGTGGAAACTGAGTGGCGTGGAGAGGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1158       GGCCAACTCTGTGACGTGGAATCCACACAAGATGATGGGAGTCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156895 ...TAGGGCCAACTCTGTGACGTGGAATCCACACAAGATGATGGGAGTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTTTGCAGTGCTCTGCTCTCCTGGTTAGAGAAGAG         GGATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 164244 CTTTGCAGTGCTCTGCTCTCCTGGTTAGAGAAGAGGTA...TAGGGATTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 ATGCAGAATTGCAACCAAATGCATGCCTCCTACCTCTTTCAGCAAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169542 ATGCAGAATTGCAACCAAATGCATGCCTCCTACCTCTTTCAGCAAGATAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 ACATTATGACCTGTCCTATGACACTGGAGACAAGGCCTTACAGTGCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169592 ACATTATGACCTGTCCTATGACACTGGAGACAAGGCCTTACAGTGCGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GCCACGTTGATGTTTTTAAACTATGGCTGATGTGGAGGGCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 169642 GCCACGTTGATGTTTTTAAACTATGGCTGATGTGGAGGGCAAAGGTG...

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387    GGGACTACCGGGTTTGAAGCGCATGTTGATAAATGTTTGGAGTTGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175653 TAGGGGACTACCGGGTTTGAAGCGCATGTTGATAAATGTTTGGAGTTGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AGAGTATTTATACAACATCATAAAAAACCGAGAAGGATATGAGATGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175703 AGAGTATTTATACAACATCATAAAAAACCGAGAAGGATATGAGATGGTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TTGATGGGAAG         CCTCAGCACACAAATGTCTGCTTCTGGTAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 175753 TTGATGGGAAGGTA...TAGCCTCAGCACACAAATGTCTGCTTCTGGTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 ATTCCTCCAAGCTTGCGTACTCTGGAAGACAATGAAGAGAGAATGAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176123 ATTCCTCCAAGCTTGCGTACTCTGGAAGACAATGAAGAGAGAATGAGTCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CCTCTCGAAG         GTGGCTCCAGTGATTAAAGCCAGAATGATGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 176173 CCTCTCGAAGGTC...CAGGTGGCTCCAGTGATTAAAGCCAGAATGATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 AGTATGGAACCACAATGGTCAGCTACCAACCCTTGGGAGACAAGGTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184010 AGTATGGAACCACAATGGTCAGCTACCAACCCTTGGGAGACAAGGTCAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 TTCTTCCGCATGGTCATCTCAAACCCAGCGGCAACTCACCAAGACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184060 TTCTTCCGCATGGTCATCTCAAACCCAGCGGCAACTCACCAAGACATTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 CTTCCTGATTGAAGAAATAGAACGCCTTGGACAAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184110 CTTCCTGATTGAAGAAATAGAACGCCTTGGACAAGATTTA