seq1 = pF1KB9977.tfa, 1671 bp
seq2 = pF1KB9977/gi568815577f_33225056.tfa (gi568815577f:33225056_33455546), 230491 bp

>pF1KB9977 1671
>gi568815577f:33225056_33455546 (Chr21)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-200  (110469-110592)   100% ->
201-376  (115944-116119)   100% ->
377-531  (118213-118367)   100% ->
532-673  (118480-118621)   100% ->
674-788  (120191-120305)   100% ->
789-988  (124036-124235)   100% ->
989-1143  (124334-124488)   100% ->
1144-1294  (127703-127853)   100% ->
1295-1440  (128583-128728)   100% ->
1441-1671  (130261-130491)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGTCGTCCTCCTGGGCGCGACGACCCTAGTGCTCGTCGCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGTCGTCCTCCTGGGCGCGACGACCCTAGTGCTCGTCGCCGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCATGGGTGTTGTCCGCAGCCGCAG         GTGGAAAAAATCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 GCCATGGGTGTTGTCCGCAGCCGCAGGTG...TAGGTGGAAAAAATCTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATCTCCTCAAAAAGTAGAGGTCGACATCATAGATGACAACTTTATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110484 AATCTCCTCAAAAAGTAGAGGTCGACATCATAGATGACAACTTTATCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGTGGAACAGGAGCGATGAGTCTGTCGGGAATGTGACTTTTTCATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110534 AGGTGGAACAGGAGCGATGAGTCTGTCGGGAATGTGACTTTTTCATTCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTATCAAAA         AACTGGGATGGATAATTGGATAAAATTGTCTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 110584 TTATCAAAAGTA...AAGAACTGGGATGGATAATTGGATAAAATTGTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTGTCAGAATATTACTAGTACCAAATGCAACTTTTCTTCACTCAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115976 GGTGTCAGAATATTACTAGTACCAAATGCAACTTTTCTTCACTCAAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATGTTTATGAAGAAATTAAATTGCGTATAAGAGCAGAAAAAGAAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116026 AATGTTTATGAAGAAATTAAATTGCGTATAAGAGCAGAAAAAGAAAACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCTTCATGGTATGAGGTTGACTCATTTACACCATTTCGCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 116076 TTCTTCATGGTATGAGGTTGACTCATTTACACCATTTCGCAAAGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    377    CTCAGATTGGTCCTCCAGAAGTACATTTAGAAGCTGAAGATAAGGCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118210 CAGCTCAGATTGGTCCTCCAGAAGTACATTTAGAAGCTGAAGATAAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATAGTGATACACATCTCTCCTGGAACAAAAGATAGTGTTATGTGGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118260 ATAGTGATACACATCTCTCCTGGAACAAAAGATAGTGTTATGTGGGCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGATGGTTTAAGCTTTACATATAGCTTAGTTATCTGGAAAAACTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118310 GGATGGTTTAAGCTTTACATATAGCTTAGTTATCTGGAAAAACTCTTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTGTAGAA         GAAAGGATTGAAAATATTTATTCCAGACATAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 118360 GTGTAGAAGTA...TAGGAAAGGATTGAAAATATTTATTCCAGACATAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTTATAAACTCTCACCAGAGACTACTTATTGTCTAAAAGTTAAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118513 ATTTATAAACTCTCACCAGAGACTACTTATTGTCTAAAAGTTAAAGCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTACTTACGTCATGGAAAATTGGTGTCTATAGTCCAGTACATTGTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118563 ACTACTTACGTCATGGAAAATTGGTGTCTATAGTCCAGTACATTGTATAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGACCACAG         TTGAAAATGAACTACCTCCACCAGAAAATATA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 118613 AGACCACAGGTA...TAGTTGAAAATGAACTACCTCCACCAGAAAATATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAGTCAGTGTCCAAAATCAGAACTATGTTCTTAAATGGGATTATACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120223 GAAGTCAGTGTCCAAAATCAGAACTATGTTCTTAAATGGGATTATACATA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGCAAACATGACCTTTCAAGTTCAGTGGCTCCA         CGCCTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 120273 TGCAAACATGACCTTTCAAGTTCAGTGGCTCCAGTA...AAGCGCCTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TAAAAAGGAATCCTGGAAACCATTTGTATAAATGGAAACAAATACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124044 TAAAAAGGAATCCTGGAAACCATTTGTATAAATGGAAACAAATACCTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGTGAAAATGTCAAAACTACCCAGTGTGTCTTTCCTCAAAACGTTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124094 TGTGAAAATGTCAAAACTACCCAGTGTGTCTTTCCTCAAAACGTTTTCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AAAAGGAATTTACCTTCTCCGCGTACAAGCATCTGATGGAAATAACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124144 AAAAGGAATTTACCTTCTCCGCGTACAAGCATCTGATGGAAATAACACAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTTTTTGGTCTGAAGAGATAAAGTTTGATACTGAAATACAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 124194 CTTTTTGGTCTGAAGAGATAAAGTTTGATACTGAAATACAAGGTA...TA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    989  CTTTCCTACTTCCTCCAGTCTTTAACATTAGATCCCTTAGTGATTCATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124333 GCTTTCCTACTTCCTCCAGTCTTTAACATTAGATCCCTTAGTGATTCATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCATATCTATATCGGTGCTCCAAAACAGTCTGGAAACACGCCTGTGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124383 CCATATCTATATCGGTGCTCCAAAACAGTCTGGAAACACGCCTGTGATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGATTATCCACTGATTTATGAAATTATTTTTTGGGAAAACACTTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124433 AGGATTATCCACTGATTTATGAAATTATTTTTTGGGAAAACACTTCAAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCTGAG         AGAAAAATTATCGAGAAAAAAACTGATGTTACAGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124483 GCTGAGGTA...TAGAGAAAAATTATCGAGAAAAAAACTGATGTTACAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TCCTAATTTGAAACCACTGACTGTATATTGTGTGAAAGCCAGAGCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127738 TCCTAATTTGAAACCACTGACTGTATATTGTGTGAAAGCCAGAGCACACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCATGGATGAAAAGCTGAATAAAAGCAGTGTTTTTAGTGACGCTGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127788 CCATGGATGAAAAGCTGAATAAAAGCAGTGTTTTTAGTGACGCTGTATGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGAAAACAAAACCAG         GAAATACCTCTAAAATTTGGCTTAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 127838 GAGAAAACAAAACCAGGTC...TAGGAAATACCTCTAAAATTTGGCTTAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGTTGGAATTTGTATTGCATTATTTGCTCTCCCGTTTGTCATTTATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128608 AGTTGGAATTTGTATTGCATTATTTGCTCTCCCGTTTGTCATTTATGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CGAAAGTCTTCTTGAGATGCATCAATTATGTCTTCTTTCCATCACTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128658 CGAAAGTCTTCTTGAGATGCATCAATTATGTCTTCTTTCCATCACTTAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCTTCTTCCAGTATAGATGAG         TATTTCTCTGAACAGCCATT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128708 CCTTCTTCCAGTATAGATGAGGTA...TAGTATTTCTCTGAACAGCCATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GAAGAATCTTCTGCTTTCAACTTCTGAGGAACAAATCGAAAAATGTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130281 GAAGAATCTTCTGCTTTCAACTTCTGAGGAACAAATCGAAAAATGTTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TAATTGAAAATATAAGCACAATTGCTACAGTAGAAGAAACTAATCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130331 TAATTGAAAATATAAGCACAATTGCTACAGTAGAAGAAACTAATCAAACT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GATGAAGATCATAAAAAATACAGTTCCCAAACTAGCCAAGATTCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130381 GATGAAGATCATAAAAAATACAGTTCCCAAACTAGCCAAGATTCAGGAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTATTCTAATGAAGATGAAAGCGAAAGTAAAACAAGTGAAGAACTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130431 TTATTCTAATGAAGATGAAAGCGAAAGTAAAACAAGTGAAGAACTACAGC

   1750     .    :
   1661 AGGACTTTGTA
        |||||||||||
 130481 AGGACTTTGTA